More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2010 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2010  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  100 
 
 
574 aa  1164    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2109  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  27.76 
 
 
599 aa  146  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.161845  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4251  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  27.42 
 
 
603 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1587  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.6 
 
 
297 aa  138  2e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.275085  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1306  diguanylate cyclase  42.68 
 
 
615 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.550913  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12380  diguanylate cyclase  34.39 
 
 
499 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00534046  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2240  diguanylate cyclase  40.09 
 
 
758 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.365812 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3115  diguanylate cyclase  42.2 
 
 
354 aa  129  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.276087 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0144  diguanylate cyclase  46.15 
 
 
642 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2363  GGDEF domain-containing protein  31.08 
 
 
311 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.282615  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3846  diguanylate cyclase  41.81 
 
 
405 aa  129  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1926  diguanylate cyclase  43.26 
 
 
466 aa  128  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.647076  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1194  diguanylate cyclase  45.34 
 
 
471 aa  128  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.361877  normal  0.129887 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1891  diguanylate cyclase  43.82 
 
 
466 aa  128  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.311116  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1903  diguanylate cyclase  43.26 
 
 
466 aa  128  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0009  diguanylate cyclase  31.65 
 
 
312 aa  128  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214527  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6176  diguanylate cyclase  43.26 
 
 
466 aa  128  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1821  diguanylate cyclase  43.82 
 
 
466 aa  128  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2364  diguanylate cyclase  44.51 
 
 
351 aa  127  4.0000000000000003e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000850784  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5204  diguanylate cyclase  43.26 
 
 
466 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0140022  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1277  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.96 
 
 
454 aa  127  4.0000000000000003e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.0388481 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3477  diguanylate cyclase  40.28 
 
 
342 aa  127  5e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.377939  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0457  diguanylate cyclase  39.34 
 
 
349 aa  127  5e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.163256  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2636  diguanylate cyclase  38.86 
 
 
220 aa  127  5e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.128146  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2001  GGDEF family protein  39.13 
 
 
347 aa  126  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0435343  normal  0.378089 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2413  response regulator PleD  37.74 
 
 
457 aa  126  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592932  normal  0.173821 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1019  diguanylate cyclase  42.01 
 
 
351 aa  126  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0413  diguanylate cyclase  41.28 
 
 
373 aa  125  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.191775  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2867  diguanylate cyclase  41.86 
 
 
402 aa  125  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2284  hypothetical protein  35.4 
 
 
525 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0619167  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6003  diguanylate cyclase  47.2 
 
 
371 aa  125  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.753958  normal  0.321238 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2679  diguanylate cyclase  44.13 
 
 
459 aa  125  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2856  GGDEF domain-containing protein  41.72 
 
 
568 aa  124  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.592717 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26970  hypothetical protein  34.95 
 
 
525 aa  124  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2375  diguanylate cyclase  43.5 
 
 
764 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2287  diguanylate cyclase  43.5 
 
 
764 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5593  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.87 
 
 
448 aa  124  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0319  diguanylate cyclase  45.12 
 
 
732 aa  124  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1497  response regulator PleD  42.7 
 
 
454 aa  124  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3038  response regulator PleD  36.13 
 
 
457 aa  124  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.372566  normal  0.319547 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7026  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.31 
 
 
312 aa  124  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.398098  hitchhiker  0.000000633587 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2023  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40 
 
 
312 aa  123  7e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.174701  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1576  diguanylate cyclase  43.5 
 
 
764 aa  123  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2165  diguanylate cyclase  40.64 
 
 
460 aa  123  9e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01448  predicted diguanylate cyclase  38.38 
 
 
347 aa  123  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2157  diguanylate cyclase  39.11 
 
 
460 aa  123  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0941263  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0129  GGDEF domain-containing protein  46.5 
 
 
645 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3328  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.87 
 
 
297 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1575  diguanylate cyclase  39.11 
 
 
460 aa  123  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4119  diguanylate cyclase  39.81 
 
 
382 aa  123  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.898336 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6017  PAS:GGDEF  31.01 
 
 
671 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01461  hypothetical protein  38.38 
 
 
347 aa  123  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2310  diguanylate cyclase  47.13 
 
 
555 aa  123  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000248825 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2103  diguanylate cyclase  39.11 
 
 
460 aa  123  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1679  diguanylate cyclase  35.4 
 
 
460 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2167  diguanylate cyclase  35.4 
 
 
460 aa  123  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0116704  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1683  diguanylate cyclase  35.4 
 
 
460 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1163  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.65 
 
 
325 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.925084  normal  0.538197 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3362  diguanylate cyclase  44.44 
 
 
380 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1658  diguanylate cyclase  43.11 
 
 
354 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.287196  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6727  diguanylate cyclase  39.55 
 
 
467 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1036  diguanylate cyclase  41.46 
 
 
427 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.132028  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1109  diguanylate cyclase  38.01 
 
 
532 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2490  diguanylate cyclase  38.8 
 
 
341 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.316308  normal  0.521612 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2700  diguanylate cyclase  47.13 
 
 
555 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3108  diguanylate cyclase  43.67 
 
 
411 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2699  diguanylate cyclase  44.85 
 
 
251 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0918  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.03 
 
 
297 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0046e-32 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0269  diguanylate cyclase  40 
 
 
485 aa  122  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.853723  hitchhiker  0.00000177476 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3678  diguanylate cyclase with GAF sensor  43.53 
 
 
418 aa  121  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.313961 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23130  sensory box GGDEF domain-containing protein  45.51 
 
 
307 aa  121  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.561543  decreased coverage  0.0000866239 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2203  PAS:GGDEF  34.67 
 
 
673 aa  122  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.239318  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0069  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.78 
 
 
314 aa  122  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.840661 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1925  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.8 
 
 
728 aa  121  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0535292  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3536  GGDEF domain-containing protein  38.24 
 
 
536 aa  121  3.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0719  diguanylate cyclase  42.54 
 
 
370 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2668  diguanylate cyclase  45.68 
 
 
390 aa  121  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4104  diguanylate cyclase  41.3 
 
 
610 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.147884 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0936  GGDEF domain-containing protein  32.87 
 
 
301 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000986982  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0096  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.2 
 
 
407 aa  121  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.758352  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0462  3-deoxy-d-manno-octulosonic-acid transferase  38.61 
 
 
422 aa  121  3.9999999999999996e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4789  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and MHYT sensor(s)  33.79 
 
 
795 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0663494  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1348  response regulator PleD  43.72 
 
 
457 aa  121  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1952  hypothetical protein  45.51 
 
 
306 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00612967  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3023  diguanylate cyclase  41.08 
 
 
362 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0379  diguanylate cyclase  28.52 
 
 
540 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2873  diguanylate cyclase  40.66 
 
 
650 aa  120  4.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2239  diguanylate cyclase  44.97 
 
 
387 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3541  response regulator PleD  42.22 
 
 
457 aa  120  6e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3218  diguanylate cyclase  37.43 
 
 
532 aa  120  6e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0498  diguanylate cyclase  39.78 
 
 
624 aa  120  6e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1997  diguanylate cyclase  42.77 
 
 
366 aa  120  6e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0135399 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2318  diguanylate cyclase  35.51 
 
 
363 aa  120  7e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0330  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.75 
 
 
531 aa  120  7e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2399  diguanylate cyclase  31.4 
 
 
311 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.291213  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2105  GGDEF domain-containing protein  31.4 
 
 
311 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3279  diguanylate cyclase  31.4 
 
 
311 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0418707  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3165  diguanylate cyclase  31.4 
 
 
311 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1413  diguanylate cyclase  31.4 
 
 
311 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.195928  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5099  diguanylate cyclase  43.59 
 
 
653 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.873917  normal  0.160564 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>