242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4311 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4311  putative GAF sensor protein  100 
 
 		 238 aa  462  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2036  putative GAF sensor protein  53.48 
 
 		 234 aa  252  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497262 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5263  putative GAF sensor protein  40.6 
 
 		 238 aa  154  9e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3590  putative GAF sensor protein  38.2 
 
 		 231 aa  144  9e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.443077 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3585  putative GAF sensor protein  38.2 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555714  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3658  putative GAF sensor protein  38.2 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.565782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4745  putative GAF sensor protein  38.14 
 
 		 230 aa  143  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0493146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1493  putative GAF sensor protein  40.66 
 
 		 233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0451  anti-sigma-factor antagonist  35.22 
 
 		 312 aa  107  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1753  sensor histidine kinase  33.55 
 
 		 364 aa  98.2  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2371  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 		 1171 aa  95.1  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.516834  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4084  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 441 aa  90.5  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3991  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 441 aa  88.6  9e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4347  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.12 
 
 		 576 aa  81.3  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0230944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1854  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.41 
 
 		 579 aa  80.9  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.46631 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4113  diguanylate cyclase  31.85 
 
 		 349 aa  78.2  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0357706 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2149  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.29 
 
 		 680 aa  77  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  28.39 
 
 		 431 aa  75.9  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1845  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.23 
 
 		 878 aa  75.5  0.0000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.187428  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3096  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor  32.48 
 
 		 595 aa  75.1  0.0000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0665544  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  28.22 
 
 		 441 aa  74.3  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2479  diguanylate cyclase with GAF sensor  31.79 
 
 		 531 aa  73.2  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.838154  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3513  diguanylate cyclase with GAF sensor  26.09 
 
 		 326 aa  72.8  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.668666  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3158  diguanylate cyclase  25.47 
 
 		 325 aa  72  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0640866 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2191  diguanylate cyclase  27.92 
 
 		 417 aa  72  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300716  normal  0.177325 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3672  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 681 aa  70.1  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497248  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0792  hypothetical protein  28.08 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.327217  normal  0.0268431 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2895  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 		 539 aa  69.3  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.939958  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0991  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.38 
 
 		 513 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.338946 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0964  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.38 
 
 		 513 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6648  putative phytochrome sensor protein  30.06 
 
 		 805 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15571  GAF domain-containing protein  28.47 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0414818  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2140  diguanylate cyclase with GAF sensor  28.92 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.480431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4126  diguanylate cyclase with GAF sensor  26.67 
 
 		 348 aa  66.2  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.859123  normal  0.0985842 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2253  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  26.79 
 
 		 780 aa  66.2  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4238  diguanylate cyclase with GAF sensor  26.67 
 
 		 348 aa  66.2  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1559  hypothetical protein  30.14 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1946  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  26.11 
 
 		 722 aa  65.9  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.146362  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1118  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.22 
 
 		 437 aa  65.5  0.0000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15351  GAF domain-containing protein  26.95 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.581628  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2551  ATP-binding region ATPase domain protein  27.39 
 
 		 398 aa  65.1  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0934  hypothetical protein  28.38 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17911  GAF domain-containing protein  28.38 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.305194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2328  GAF sensor Signal transduction histidine kinase  24.67 
 
 		 518 aa  63.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1949  diguanylate cyclase, putative  28.95 
 
 		 327 aa  64.3  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15721  GAF domain-containing protein  29.17 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2010  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  29.94 
 
 		 574 aa  63.5  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2420  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28 
 
 		 624 aa  63.2  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.533876  normal  0.201744 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1980  diguanylate cyclase  29.2 
 
 		 417 aa  63.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0208161  normal  0.907372 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0665  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  27.38 
 
 		 727 aa  62.8  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.545647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1643  diguanylate cyclase with GAF sensor  30.07 
 
 		 506 aa  62.8  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.65001 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2863  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.68 
 
 		 422 aa  62.8  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0405  serine phosphatase  27.7 
 
 		 413 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0414  putative GAF sensor protein  27.7 
 
 		 413 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.479373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0393  putative GAF sensor protein  27.7 
 
 		 413 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.667086  normal  0.648976 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.06 
 
 		 1550 aa  62.4  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1925  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.1 
 
 		 728 aa  62  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0535292  normal  0.500981 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2826  hypothetical protein  24 
 
 		 314 aa  61.2  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1466  GAF domain-containing protein  27.21 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0642  putative GAF sensor protein  26.13 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.344315  hitchhiker  0.000370263 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0800  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  28.67 
 
 		 781 aa  61.2  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2829  GAF domain-containing protein  29.17 
 
 		 393 aa  61.2  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2025  putative PAS/PAC sensor protein  31.11 
 
 		 930 aa  61.2  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.76545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4134  transcriptional regulator, XRE family  27.33 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3825  GAF domain-containing protein  27.33 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0507581  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2505  GAF domain/GGDEF domain-containing protein  28.93 
 
 		 345 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.430442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3060  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  30.43 
 
 		 442 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2463  hypothetical protein  31.3 
 
 		 341 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.162594  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3217  diguanylate cyclase  28.3 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.201545  normal  0.0694192 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0192  serine/threonine protein kinase  27.22 
 
 		 471 aa  60.5  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2267  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.08 
 
 		 403 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0108452  hitchhiker  0.000000348318 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4958  GAF sensor signal transduction histidine kinase  23.93 
 
 		 517 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2176  diguanylate cyclase with GAF sensor  27.95 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.59733  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3759  GGDEF domain-containing protein  29.05 
 
 		 324 aa  59.7  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1877  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  25.16 
 
 		 722 aa  59.7  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0928  diguanylate cyclase  28.38 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2072  signal transduction histidine kinase  30.15 
 
 		 829 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2586  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  25.5 
 
 		 592 aa  59.3  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2059  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  24.84 
 
 		 718 aa  59.3  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0475762  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1789  diguanylate cyclase with GAF sensor  29.55 
 
 		 487 aa  59.3  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1699  fused adenylate cyclase and hybrid sensor diguanylate cyclase and response regulator  26.99 
 
 		 316 aa  59.3  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.481687 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0063  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.67 
 
 		 837 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0541  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.27 
 
 		 445 aa  58.9  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3108  diguanylate cyclase with GAF sensor  29.73 
 
 		 323 aa  58.9  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0864  diguanylate cyclase with GAF sensor  28.38 
 
 		 323 aa  58.9  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0812  Stage II sporulation E family protein  30.3 
 
 		 422 aa  58.5  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2886  diguanylate cyclase with GAF sensor  29.37 
 
 		 326 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.322967 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1229  diguanylate cyclase  29.77 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.586021  normal  0.0822929 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2209  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 		 399 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1600  GGDEF family protein  26.67 
 
 		 594 aa  58.2  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.723611  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2011  diguanylate cyclase  28 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0759816  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3195  sensor histidine kinase  28.99 
 
 		 438 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.211172  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00678  Putative signal protein with GAF, GGDEF and EAL domains  31.58 
 
 		 595 aa  57.4  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0927231  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0191  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.49 
 
 		 743 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.766687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4387  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.17 
 
 		 946 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0318  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  27.81 
 
 		 601 aa  57  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.899318  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2985  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.62 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.369432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3085  diguanylate cyclase  27.7 
 
 		 323 aa  57  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2286  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  26.03 
 
 		 592 aa  57.4  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.128359  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44514  light histidine kinase  26.24 
 
 		 850 aa  57  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>