More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1493 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1493  putative GAF sensor protein  100 
 
 		 233 aa  464  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5263  putative GAF sensor protein  66.29 
 
 		 238 aa  222  4e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3590  putative GAF sensor protein  59.12 
 
 		 231 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.443077 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3585  putative GAF sensor protein  58.49 
 
 		 231 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555714  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3658  putative GAF sensor protein  58.49 
 
 		 231 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.565782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2036  putative GAF sensor protein  42.48 
 
 		 234 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497262 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4311  putative GAF sensor protein  40.66 
 
 		 238 aa  128  7.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4745  putative GAF sensor protein  47.06 
 
 		 230 aa  128  8.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0493146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1753  sensor histidine kinase  44.08 
 
 		 364 aa  123  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4084  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.42 
 
 		 441 aa  122  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3991  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 441 aa  119  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0451  anti-sigma-factor antagonist  40.67 
 
 		 312 aa  118  7e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2371  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.26 
 
 		 1171 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.516834  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1854  GAF sensor hybrid histidine kinase  42.66 
 
 		 579 aa  104  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.46631 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3672  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.49 
 
 		 681 aa  102  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497248  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02127  sensor histidine kinase  39.88 
 
 		 398 aa  99  6e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147572  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0800  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  38.19 
 
 		 781 aa  98.6  8e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3096  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor  39.07 
 
 		 595 aa  96.7  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0665544  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0928  diguanylate cyclase  35.29 
 
 		 323 aa  95.1  9e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2176  diguanylate cyclase with GAF sensor  37.25 
 
 		 321 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.59733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3513  diguanylate cyclase with GAF sensor  32.89 
 
 		 326 aa  94.4  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.668666  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2895  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 		 539 aa  94.7  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.939958  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3158  diguanylate cyclase  33.56 
 
 		 325 aa  94.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0640866 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0329  diguanylate cyclase with GAF sensor  38.51 
 
 		 336 aa  93.6  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.832493  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1974  diguanylate cyclase  38.51 
 
 		 336 aa  93.6  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.588528 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0063  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.87 
 
 		 837 aa  92  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2149  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.09 
 
 		 680 aa  92  7e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2356  diguanylate cyclase with GAF sensor  37.75 
 
 		 319 aa  91.7  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.10775 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02131  GGDEF domain-containing PAS signal transduction protein  32.47 
 
 		 794 aa  91.7  9e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3803  diguanylate cyclase  38.46 
 
 		 489 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0126112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4387  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.1 
 
 		 946 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0918  diguanylate cyclase with GAF sensor  33.99 
 
 		 323 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0219  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  37.71 
 
 		 489 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2267  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 		 403 aa  90.5  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0108452  hitchhiker  0.000000348318 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3444  diguanylate cyclase  33.99 
 
 		 323 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1845  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.01 
 
 		 878 aa  89.7  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.187428  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00678  Putative signal protein with GAF, GGDEF and EAL domains  39.33 
 
 		 595 aa  89.4  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0927231  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2886  diguanylate cyclase with GAF sensor  34.73 
 
 		 326 aa  89.4  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.322967 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0877  putative phytochrome sensor protein  43.84 
 
 		 603 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0810026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0894  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 323 aa  89  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.499341  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4347  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.59 
 
 		 576 aa  89  6e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0230944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3085  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 323 aa  88.2  9e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0191  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.73 
 
 		 743 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.766687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4988  putative PAS/PAC sensor protein  42.75 
 
 		 866 aa  88.2  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.952168  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2479  diguanylate cyclase with GAF sensor  35.53 
 
 		 531 aa  87.4  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.838154  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2310  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  35.62 
 
 		 400 aa  86.3  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3108  diguanylate cyclase with GAF sensor  33.77 
 
 		 323 aa  86.7  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4238  diguanylate cyclase with GAF sensor  35.62 
 
 		 348 aa  86.3  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2191  diguanylate cyclase  34.44 
 
 		 417 aa  86.3  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300716  normal  0.177325 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0192  serine/threonine protein kinase  35.37 
 
 		 471 aa  86.3  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4126  diguanylate cyclase with GAF sensor  35.62 
 
 		 348 aa  86.3  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.859123  normal  0.0985842 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0288  signal transduction histidine kinase  40.14 
 
 		 514 aa  85.9  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.328365  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1643  diguanylate cyclase with GAF sensor  34.9 
 
 		 506 aa  85.5  7e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.65001 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3759  GGDEF domain-containing protein  32.68 
 
 		 324 aa  85.1  9e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0966  diguanylate cyclase  34.21 
 
 		 334 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  32.03 
 
 		 431 aa  84.7  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2025  putative PAS/PAC sensor protein  40 
 
 		 930 aa  84.7  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.76545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4722  diguanylate cyclase with GAF sensor  35.53 
 
 		 323 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.549479 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15571  GAF domain-containing protein  35.53 
 
 		 249 aa  84.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0414818  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.64 
 
 		 1550 aa  83.6  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1566  diguanylate cyclase with GAF sensor  36.77 
 
 		 483 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0792  hypothetical protein  35.57 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.327217  normal  0.0268431 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1367  putative phytochrome sensor protein  41.67 
 
 		 607 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0833  diguanylate cyclase with GAF sensor  32.68 
 
 		 322 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3825  GAF domain-containing protein  36.18 
 
 		 276 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0507581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4134  transcriptional regulator, XRE family  36.18 
 
 		 267 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0405  serine phosphatase  34.18 
 
 		 413 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0414  putative GAF sensor protein  34.18 
 
 		 413 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.479373  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08061  hypothetical protein  32.24 
 
 		 406 aa  82.8  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0393  putative GAF sensor protein  34.18 
 
 		 413 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.667086  normal  0.648976 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0934  hypothetical protein  36.23 
 
 		 253 aa  82.4  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4368  signal transduction histidine kinase  42.31 
 
 		 934 aa  82.4  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523014 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0066  GGDEF domain-containing protein  32.93 
 
 		 743 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.928161  normal  0.0154172 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15351  GAF domain-containing protein  34.03 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.581628  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17911  GAF domain-containing protein  36.23 
 
 		 253 aa  82.4  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.305194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0961  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.67 
 
 		 465 aa  82  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1699  fused adenylate cyclase and hybrid sensor diguanylate cyclase and response regulator  31.71 
 
 		 316 aa  82.4  0.000000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.481687 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0172  signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 		 897 aa  82  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15721  GAF domain-containing protein  34.87 
 
 		 249 aa  81.6  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  30.72 
 
 		 441 aa  81.3  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4265  signal transduction histidine kinase  41.8 
 
 		 930 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.588648  normal  0.462436 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0864  diguanylate cyclase with GAF sensor  31.37 
 
 		 323 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.42 
 
 		 1965 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2169  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  36.84 
 
 		 722 aa  80.9  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0648584  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4251  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.4 
 
 		 603 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.52 
 
 		 640 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2109  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.67 
 
 		 599 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.161845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3897  PAS sensor protein  41.8 
 
 		 930 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240133 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2011  diguanylate cyclase  31.87 
 
 		 321 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0759816  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2420  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.81 
 
 		 624 aa  80.1  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.533876  normal  0.201744 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04155  Putative signal protein with GAF,PAS(PAC) and GGDEF domains  37.69 
 
 		 874 aa  79.7  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.581833  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3828  putative GAF sensor protein  32.34 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.673739 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10742  predicted protein  35.33 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.182467  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2209  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 399 aa  79  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1559  hypothetical protein  34.03 
 
 		 245 aa  79  0.00000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0621  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.78 
 
 		 1309 aa  78.6  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.288255 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6181  signal transduction histidine kinase  38.85 
 
 		 1191 aa  78.6  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.299797 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2072  signal transduction histidine kinase  37.59 
 
 		 829 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1466  GAF domain-containing protein  33.33 
 
 		 249 aa  78.2  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1130  signal transduction histidine kinase  38.16 
 
 		 1002 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039296  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>