133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1173 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_1173  Squalene/phytoene synthase  100 
 
 		 348 aa  706    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2309  Squalene/phytoene synthase  84 
 
 		 350 aa  603  1.0000000000000001e-171  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1206  Squalene/phytoene synthase  55.17 
 
 		 355 aa  388  1e-107  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000204086  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0934  Squalene/phytoene synthase  56.73 
 
 		 348 aa  384  1e-106  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0902  Squalene/phytoene synthase  47.13 
 
 		 351 aa  283  4.0000000000000003e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.883554  normal  0.674566 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4822  Squalene/phytoene synthase  31.36 
 
 		 360 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000193666  normal  0.636776 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1321  squalene/phytoene synthase  30.36 
 
 		 366 aa  123  6e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0813  squalene synthase  31.15 
 
 		 362 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.493188  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2125  phytoene/squalene synthetase family protein  31.8 
 
 		 347 aa  113  5e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1784  Squalene synthase  31.11 
 
 		 401 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20770  Squalene/phytoene synthase  32.13 
 
 		 377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00645323  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2280  squalene/phytoene synthase  32.58 
 
 		 359 aa  108  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15920  Squalene synthase  24.61 
 
 		 321 aa  107  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.13397  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31144  predicted protein  27.1 
 
 		 456 aa  103  4e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0189  squalene/phytoene synthase  26.45 
 
 		 329 aa  100  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.433494  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0124  hypothetical protein  26.59 
 
 		 345 aa  99.8  6e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0110  hypothetical protein  26.59 
 
 		 345 aa  98.6  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2690  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  29.91 
 
 		 373 aa  98.2  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.286545  normal  0.217848 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0892  Squalene/phytoene synthase  31.9 
 
 		 330 aa  96.3  7e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000100627  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05660  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase, putative  26.52 
 
 		 542 aa  89.4  8e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.148096  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10396  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01220)  26.77 
 
 		 470 aa  89.4  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0957  squalene/phytoene synthase  25.95 
 
 		 380 aa  89.4  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83429  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  24.11 
 
 		 448 aa  80.9  0.00000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.274803  normal  0.0738823 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3686  squalene/phytoene synthase  27.93 
 
 		 354 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.481699 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1711  squalene/phytoene synthase  32.77 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.208804 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4159  squalene/phytoene synthase  27.93 
 
 		 354 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.283896  normal  0.280623 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0365  Squalene/phytoene synthase  26.84 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2156  squalene/phytoene synthase family protein  29.26 
 
 		 564 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1762  squalene/phytoene synthase family protein  27.95 
 
 		 513 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265717  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0843  squalene/phytoene synthase family protein  27.95 
 
 		 516 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336434  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1133  squalene/phytoene synthase family protein  27.95 
 
 		 349 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0418  squalene/phytoene synthase family protein  27.95 
 
 		 349 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0327  squalene/phytoene synthase family protein  27.95 
 
 		 402 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479613  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4328  squalene/phytoene synthase  27.78 
 
 		 367 aa  72  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0106814  normal  0.0939133 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1840  squalene/phytoene synthase family protein  27.95 
 
 		 356 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.156378  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2107  squalene/phytoene synthase family protein  27.95 
 
 		 356 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.666736  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0169  squalene/phytoene synthase  22.54 
 
 		 340 aa  70.9  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000509815  normal  0.0348824 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3084  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  27.46 
 
 		 350 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5450  squalene/phytoene synthase  25.32 
 
 		 351 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.035034 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1749  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  27.65 
 
 		 354 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0364934  normal  0.191421 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5617  Squalene/phytoene synthase  26.34 
 
 		 353 aa  69.3  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4026  Squalene/phytoene synthase  28.14 
 
 		 388 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.600735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0485  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  31.34 
 
 		 348 aa  67  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.501561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13160  predicted protein  24.3 
 
 		 314 aa  66.2  0.0000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1894  Squalene/phytoene synthase  28.06 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.73181e-25 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0519  Squalene/phytoene synthase  27.8 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000172077  unclonable  0.00000000442805 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0502  Squalene/phytoene synthase  27.8 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4104  squalene/phytoene synthase  27.51 
 
 		 355 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.132439  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4262  squalene/phytoene synthase  27.51 
 
 		 355 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0172457  normal  0.1857 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3255  squalene/phytoene synthase  27.51 
 
 		 355 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_56481  phytoene synthase  25.91 
 
 		 505 aa  60.5  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2584  squalene/phytoene synthase  24.28 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0158567  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2638  squalene/phytoene synthase  24.28 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.444406  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2267  Squalene/phytoene synthase  24.66 
 
 		 292 aa  59.3  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0065  squalene/phytoene synthase  32.46 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.114754  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3578  squalene/phytoene synthase  31.3 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0270096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1814  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  31.96 
 
 		 323 aa  57  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4080  squalene/phytoene synthase  29.58 
 
 		 310 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.243563 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1356  phytoene desaturase  24.48 
 
 		 311 aa  54.7  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1618  squalene/phytoene synthase  29.48 
 
 		 364 aa  54.3  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02151  squalene and phytoene synthase  25.31 
 
 		 312 aa  54.3  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1509  squalene and phytoene synthase  25.31 
 
 		 312 aa  53.5  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1262  squalene/phytoene synthase  25.56 
 
 		 348 aa  53.5  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.238367  normal  0.0709995 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1984  phytoene synthase  23.72 
 
 		 308 aa  52.8  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.735846  normal  0.234628 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1004  Phytoene synthase  25.82 
 
 		 318 aa  52.8  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.372404  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12559  predicted protein  30.91 
 
 		 273 aa  52.8  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.209763  normal  0.196988 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1700  Squalene/phytoene synthase  25 
 
 		 355 aa  52.8  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.898001  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3310  Phytoene synthase  26.17 
 
 		 317 aa  52  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1158  Squalene/phytoene synthase  24.25 
 
 		 310 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2272  squalene/phytoene synthase  28.7 
 
 		 292 aa  51.2  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.267768  normal  0.247445 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4808  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  27.18 
 
 		 276 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000000603288  normal  0.956727 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1468  squalene/phytoene synthase  23.24 
 
 		 291 aa  51.2  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0963018 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2043  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  24.29 
 
 		 274 aa  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.259973  normal  0.118858 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4010  phytoene synthase  28.77 
 
 		 325 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2476  Squalene/phytoene synthase  26.38 
 
 		 321 aa  51.6  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01711  squalene and phytoene synthase  25 
 
 		 302 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.460844  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2706  squalene/phytoene synthase  27.52 
 
 		 277 aa  50.8  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000109995  hitchhiker  0.00000842168 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2069  Squalene/phytoene synthase  28.95 
 
 		 355 aa  51.2  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.910011 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0064  phytoene/squalene synthetase  21.55 
 
 		 236 aa  50.8  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0276  Squalene/phytoene synthase  27.69 
 
 		 321 aa  50.4  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.54913  normal  0.0299312 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2874  phytoene synthase  29.45 
 
 		 310 aa  50.4  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.109595  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1525  putative phytoene synthase-like protein  23.41 
 
 		 299 aa  50.1  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3765  squalene/phytoene synthase  24.6 
 
 		 349 aa  50.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.142197  hitchhiker  0.00585073 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0143  Squalene/phytoene synthase  34.11 
 
 		 324 aa  49.7  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.699038  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4010  squalene/phytoene synthase  24.6 
 
 		 349 aa  49.3  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  hitchhiker  0.005496 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1175  phytoene desaturase  31.25 
 
 		 316 aa  48.9  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.111689  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2018  squalene/phytoene synthase  24.89 
 
 		 296 aa  48.9  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.971404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2685  squalene/phytoene synthase  28.7 
 
 		 292 aa  48.9  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1697  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  27.35 
 
 		 281 aa  48.5  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2394  phytoene synthase  28 
 
 		 302 aa  48.5  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2699  Phytoene synthase  26.39 
 
 		 316 aa  48.5  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0142  phytoene synthase  32.56 
 
 		 337 aa  48.1  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4149  phytoene synthase  27.47 
 
 		 282 aa  48.5  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.165993  normal  0.461254 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01601  squalene and phytoene synthase  23.11 
 
 		 302 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.37181  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01621  squalene and phytoene synthase  22.97 
 
 		 302 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6444  phytoene synthase  34.88 
 
 		 346 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.974636 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2158  squalene synthase HpnD  24.62 
 
 		 277 aa  48.5  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0309  Squalene/phytoene synthase  23.72 
 
 		 310 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2343  squalene/phytoene synthase  26.4 
 
 		 280 aa  47.8  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.149671  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1693  squalene/phytoene synthase  27.78 
 
 		 307 aa  47.8  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.267  hitchhiker  0.0000197833 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>