132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4822 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4822  Squalene/phytoene synthase  100 
 
 		 360 aa  741    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000193666  normal  0.636776 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20770  Squalene/phytoene synthase  33.43 
 
 		 377 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00645323  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1321  squalene/phytoene synthase  33.43 
 
 		 366 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2280  squalene/phytoene synthase  35.56 
 
 		 359 aa  144  3e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2125  phytoene/squalene synthetase family protein  35.52 
 
 		 347 aa  143  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1784  Squalene synthase  35.52 
 
 		 401 aa  143  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3084  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  30.91 
 
 		 350 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15920  Squalene synthase  29.43 
 
 		 321 aa  136  6.0000000000000005e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.13397  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0189  squalene/phytoene synthase  32.84 
 
 		 329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.433494  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2690  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  33.86 
 
 		 373 aa  134  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.286545  normal  0.217848 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0902  Squalene/phytoene synthase  31.04 
 
 		 351 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.883554  normal  0.674566 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1206  Squalene/phytoene synthase  29.18 
 
 		 355 aa  132  9e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000204086  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0934  Squalene/phytoene synthase  29.89 
 
 		 348 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0813  squalene synthase  32.93 
 
 		 362 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.493188  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1173  Squalene/phytoene synthase  31.55 
 
 		 348 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0957  squalene/phytoene synthase  27.84 
 
 		 380 aa  126  5e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1749  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  28.75 
 
 		 354 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0364934  normal  0.191421 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2309  Squalene/phytoene synthase  31.86 
 
 		 350 aa  123  6e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3686  squalene/phytoene synthase  28.75 
 
 		 354 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.481699 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3255  squalene/phytoene synthase  28.44 
 
 		 355 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4104  squalene/phytoene synthase  28.44 
 
 		 355 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.132439  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4262  squalene/phytoene synthase  28.44 
 
 		 355 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0172457  normal  0.1857 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4159  squalene/phytoene synthase  28.27 
 
 		 354 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.283896  normal  0.280623 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4328  squalene/phytoene synthase  28.75 
 
 		 367 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0106814  normal  0.0939133 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0485  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  30.97 
 
 		 348 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.501561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4026  Squalene/phytoene synthase  31.33 
 
 		 388 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.600735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0418  squalene/phytoene synthase family protein  28 
 
 		 349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5617  Squalene/phytoene synthase  28.23 
 
 		 353 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1762  squalene/phytoene synthase family protein  27.69 
 
 		 513 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265717  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0327  squalene/phytoene synthase family protein  28.22 
 
 		 402 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479613  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2156  squalene/phytoene synthase family protein  28.22 
 
 		 564 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1840  squalene/phytoene synthase family protein  28.22 
 
 		 356 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.156378  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0843  squalene/phytoene synthase family protein  27.69 
 
 		 516 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336434  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1133  squalene/phytoene synthase family protein  28.22 
 
 		 349 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2107  squalene/phytoene synthase family protein  28.22 
 
 		 356 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.666736  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0892  Squalene/phytoene synthase  27.7 
 
 		 330 aa  105  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000100627  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5450  squalene/phytoene synthase  26.69 
 
 		 351 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.035034 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31144  predicted protein  28.38 
 
 		 456 aa  91.3  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10396  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01220)  27.86 
 
 		 470 aa  85.1  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05660  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase, putative  28.48 
 
 		 542 aa  84  0.000000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.148096  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13160  predicted protein  28.66 
 
 		 314 aa  83.2  0.000000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2043  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  29.04 
 
 		 274 aa  80.5  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.259973  normal  0.118858 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83429  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  27.55 
 
 		 448 aa  77  0.0000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.274803  normal  0.0738823 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0169  squalene/phytoene synthase  21.5 
 
 		 340 aa  77  0.0000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000509815  normal  0.0348824 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1700  Squalene/phytoene synthase  26.89 
 
 		 355 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.898001  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4808  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  26.58 
 
 		 276 aa  72.8  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000000603288  normal  0.956727 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6444  phytoene synthase  29.3 
 
 		 346 aa  72  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.974636 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0519  Squalene/phytoene synthase  27.27 
 
 		 270 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000172077  unclonable  0.00000000442805 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1894  Squalene/phytoene synthase  26.86 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.73181e-25 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0502  Squalene/phytoene synthase  27.27 
 
 		 270 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1262  squalene/phytoene synthase  26.52 
 
 		 348 aa  70.5  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.238367  normal  0.0709995 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4010  squalene/phytoene synthase  26.14 
 
 		 349 aa  69.7  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  hitchhiker  0.005496 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3765  squalene/phytoene synthase  24.52 
 
 		 349 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.142197  hitchhiker  0.00585073 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2584  squalene/phytoene synthase  26.98 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0158567  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2638  squalene/phytoene synthase  26.98 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.444406  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0124  hypothetical protein  26.01 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2267  Squalene/phytoene synthase  26.94 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0110  hypothetical protein  25.68 
 
 		 345 aa  62.8  0.000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1618  squalene/phytoene synthase  24.71 
 
 		 364 aa  62  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01581  squalene and phytoene synthase  26.55 
 
 		 313 aa  62.4  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0523  squalene/phytoene synthase  27.64 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.182071  normal  0.774917 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4794  phytoene synthase  26.18 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3904  Phytoene synthase  24.63 
 
 		 326 aa  59.7  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0494  phytoene synthase  24.44 
 
 		 342 aa  59.3  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0365  Squalene/phytoene synthase  25.99 
 
 		 299 aa  58.9  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12559  predicted protein  28.92 
 
 		 273 aa  58.5  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.209763  normal  0.196988 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4080  squalene/phytoene synthase  27.44 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.243563 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0145  squalene and phytoene synthase  25.1 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2874  phytoene synthase  24.66 
 
 		 310 aa  57  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.109595  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26641  squalene and phytoene synthase  26.69 
 
 		 313 aa  57  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02151  squalene and phytoene synthase  26.14 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1711  squalene/phytoene synthase  31.13 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.208804 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1509  squalene and phytoene synthase  25.42 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2343  squalene/phytoene synthase  23.25 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.149671  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1158  Squalene/phytoene synthase  24.22 
 
 		 310 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01711  squalene and phytoene synthase  25 
 
 		 302 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.460844  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01621  squalene and phytoene synthase  25 
 
 		 302 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3578  squalene/phytoene synthase  23.62 
 
 		 311 aa  55.1  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0270096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5423  squalene synthase HpnC  27.48 
 
 		 298 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1004  Phytoene synthase  24.2 
 
 		 318 aa  54.7  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.372404  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1469  squalene/phytoene synthase  25.65 
 
 		 278 aa  54.3  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.093499 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0309  Phytoene synthase  26.18 
 
 		 310 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4010  phytoene synthase  24.42 
 
 		 325 aa  53.9  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1601  Squalene/phytoene synthase  25.49 
 
 		 575 aa  53.9  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0484297  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0309  Squalene/phytoene synthase  26.18 
 
 		 310 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1752  squalene/phytoene synthase  28.51 
 
 		 337 aa  53.5  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01601  squalene and phytoene synthase  24.58 
 
 		 302 aa  53.1  0.000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.37181  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1984  phytoene synthase  26.52 
 
 		 308 aa  52  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.735846  normal  0.234628 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1025  squalene/phytoene synthase  24.39 
 
 		 354 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5716  squalene/phytoene synthase  25.99 
 
 		 300 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.038374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3735  squalene/phytoene synthase  26.05 
 
 		 351 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0802479 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0299  phytoene synthase  25.49 
 
 		 304 aa  51.6  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.791623  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4189  Squalene/phytoene synthase  28 
 
 		 312 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.235652 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1047  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  30 
 
 		 292 aa  51.2  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.477192  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3509  phytoene synthase  24.78 
 
 		 361 aa  50.4  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2703  squalene/phytoene synthase  24.9 
 
 		 324 aa  50.8  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80466  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1356  phytoene desaturase  23.66 
 
 		 311 aa  50.1  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0276  Squalene/phytoene synthase  23.48 
 
 		 321 aa  50.1  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.54913  normal  0.0299312 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0820  squalene/phytoene synthase  24.35 
 
 		 304 aa  49.7  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.122884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2842  squalene/phytoene synthase  23.79 
 
 		 338 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>