192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_20770 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_20770  Squalene/phytoene synthase  100 
 
 		 377 aa  785    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00645323  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1321  squalene/phytoene synthase  49.28 
 
 		 366 aa  346  5e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0813  squalene synthase  50.6 
 
 		 362 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.493188  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1784  Squalene synthase  48.48 
 
 		 401 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2125  phytoene/squalene synthetase family protein  48.48 
 
 		 347 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2280  squalene/phytoene synthase  41.95 
 
 		 359 aa  263  3e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2690  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  43.33 
 
 		 373 aa  255  9e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.286545  normal  0.217848 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0189  squalene/phytoene synthase  38.02 
 
 		 329 aa  227  3e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.433494  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4822  Squalene/phytoene synthase  33.43 
 
 		 360 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000193666  normal  0.636776 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3084  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  33.23 
 
 		 350 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0957  squalene/phytoene synthase  31.85 
 
 		 380 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0418  squalene/phytoene synthase family protein  30.25 
 
 		 349 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1840  squalene/phytoene synthase family protein  29.79 
 
 		 356 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.156378  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4026  Squalene/phytoene synthase  31.25 
 
 		 388 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.600735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5450  squalene/phytoene synthase  32.04 
 
 		 351 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.035034 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1133  squalene/phytoene synthase family protein  29.94 
 
 		 349 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2107  squalene/phytoene synthase family protein  29.79 
 
 		 356 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.666736  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2156  squalene/phytoene synthase family protein  30.38 
 
 		 564 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0843  squalene/phytoene synthase family protein  29.79 
 
 		 516 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336434  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4328  squalene/phytoene synthase  33.75 
 
 		 367 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0106814  normal  0.0939133 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0327  squalene/phytoene synthase family protein  29.5 
 
 		 402 aa  126  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479613  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0892  Squalene/phytoene synthase  30.69 
 
 		 330 aa  125  9e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000100627  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0485  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  30 
 
 		 348 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.501561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1762  squalene/phytoene synthase family protein  29.5 
 
 		 513 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265717  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1749  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  32.62 
 
 		 354 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0364934  normal  0.191421 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3255  squalene/phytoene synthase  32.33 
 
 		 355 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5617  Squalene/phytoene synthase  32.13 
 
 		 353 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4104  squalene/phytoene synthase  31.71 
 
 		 355 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.132439  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3686  squalene/phytoene synthase  31.46 
 
 		 354 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.481699 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4262  squalene/phytoene synthase  31.71 
 
 		 355 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0172457  normal  0.1857 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4159  squalene/phytoene synthase  31.15 
 
 		 354 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.283896  normal  0.280623 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83429  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  29.69 
 
 		 448 aa  112  1.0000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.274803  normal  0.0738823 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1173  Squalene/phytoene synthase  32.13 
 
 		 348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2309  Squalene/phytoene synthase  31.6 
 
 		 350 aa  105  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0169  squalene/phytoene synthase  23.05 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000509815  normal  0.0348824 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31144  predicted protein  30.13 
 
 		 456 aa  99.8  6e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1206  Squalene/phytoene synthase  29.91 
 
 		 355 aa  96.3  9e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000204086  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10396  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01220)  28.18 
 
 		 470 aa  95.1  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0934  Squalene/phytoene synthase  30.25 
 
 		 348 aa  95.1  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0124  hypothetical protein  26.53 
 
 		 345 aa  93.2  6e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0110  hypothetical protein  26.54 
 
 		 345 aa  89.7  6e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0365  Squalene/phytoene synthase  30.33 
 
 		 299 aa  88.2  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13160  predicted protein  29.11 
 
 		 314 aa  82  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15920  Squalene synthase  28.24 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.13397  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1894  Squalene/phytoene synthase  31.42 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.73181e-25 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05660  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase, putative  25.62 
 
 		 542 aa  79  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.148096  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0523  squalene/phytoene synthase  30.49 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.182071  normal  0.774917 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4808  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  31.31 
 
 		 276 aa  75.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000000603288  normal  0.956727 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0502  Squalene/phytoene synthase  30.84 
 
 		 270 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0519  Squalene/phytoene synthase  30.84 
 
 		 270 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000172077  unclonable  0.00000000442805 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01581  squalene and phytoene synthase  26.43 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2819  Phytoene synthase  30.56 
 
 		 335 aa  72.4  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2043  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  30.36 
 
 		 274 aa  72.4  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.259973  normal  0.118858 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1752  squalene/phytoene synthase  27.48 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26641  squalene and phytoene synthase  27.39 
 
 		 313 aa  70.9  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2343  squalene/phytoene synthase  26.45 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.149671  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1371  squalene/phytoene synthase  25 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1585  Squalene/phytoene synthase  27.72 
 
 		 309 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02151  squalene and phytoene synthase  26.51 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1509  squalene and phytoene synthase  27.31 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0902  Squalene/phytoene synthase  30.69 
 
 		 351 aa  67.8  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.883554  normal  0.674566 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0309  Phytoene synthase  26.02 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3310  Phytoene synthase  33.06 
 
 		 317 aa  65.9  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0309  Squalene/phytoene synthase  26.02 
 
 		 310 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1697  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  28.1 
 
 		 281 aa  65.1  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2394  phytoene synthase  27.27 
 
 		 302 aa  65.5  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0026  squalene/phytoene synthase  26.13 
 
 		 268 aa  63.9  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2117  squalene/phytoene synthase  35.45 
 
 		 337 aa  63.9  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2441  Phytoene synthase  28.84 
 
 		 289 aa  63.9  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.214033  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1601  Squalene/phytoene synthase  25 
 
 		 575 aa  63.5  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0484297  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1512  squalene synthase HpnD  25.39 
 
 		 285 aa  63.2  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575071  normal  0.0112347 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01711  squalene and phytoene synthase  25.45 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.460844  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4794  phytoene synthase  27.12 
 
 		 310 aa  62.4  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0299  phytoene synthase  28.69 
 
 		 304 aa  62.4  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.791623  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1469  squalene/phytoene synthase  23.87 
 
 		 278 aa  62.8  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.093499 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01601  squalene and phytoene synthase  26.2 
 
 		 302 aa  62.4  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.37181  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01621  squalene and phytoene synthase  25.68 
 
 		 302 aa  62.4  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1524  putative terpenoid synthase  26.75 
 
 		 293 aa  62  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1732  Squalene/phytoene synthase  31.86 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.956731  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0145  squalene and phytoene synthase  25.91 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0378  Phytoene synthase  35.96 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.883354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1984  phytoene synthase  25.16 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.735846  normal  0.234628 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0844  phytoene synthase  27.35 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1694  squalene/phytoene synthase  29.58 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0597183  hitchhiker  0.0000516194 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0937  Squalene/phytoene synthase  25.69 
 
 		 331 aa  60.5  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0100379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1158  Squalene/phytoene synthase  25.2 
 
 		 310 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4931  squalene/phytoene synthase  29.85 
 
 		 303 aa  59.3  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.974749  normal  0.56653 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1486  Phytoene synthase  31.54 
 
 		 280 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000477032 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2501  Phytoene synthase  26.1 
 
 		 293 aa  59.3  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000012826  normal  0.0149177 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_56481  phytoene synthase  32.14 
 
 		 505 aa  59.3  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2505  squalene synthase HpnD  24.9 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1738  squalene/phytoene synthase  30.97 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214205  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4189  Squalene/phytoene synthase  25.1 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.235652 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3578  squalene/phytoene synthase  25 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0270096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1507  Squalene/phytoene synthase  30.09 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.100446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4441  squalene/phytoene synthase  28.97 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2584  squalene/phytoene synthase  24.21 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0158567  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2638  squalene/phytoene synthase  24.21 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.444406  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4080  squalene/phytoene synthase  35.79 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.243563 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2267  Squalene/phytoene synthase  26.38 
 
 		 292 aa  55.5  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>