69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl0110 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp0124  hypothetical protein  96.81 
 
 		 345 aa  687    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0110  hypothetical protein  100 
 
 		 345 aa  711    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2280  squalene/phytoene synthase  24 
 
 		 359 aa  102  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1173  Squalene/phytoene synthase  26.59 
 
 		 348 aa  98.6  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1321  squalene/phytoene synthase  27.76 
 
 		 366 aa  94  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1206  Squalene/phytoene synthase  23.79 
 
 		 355 aa  93.6  5e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000204086  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20770  Squalene/phytoene synthase  26.54 
 
 		 377 aa  89.7  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00645323  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2309  Squalene/phytoene synthase  25.64 
 
 		 350 aa  86.3  7e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0934  Squalene/phytoene synthase  25.99 
 
 		 348 aa  84  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0813  squalene synthase  26.46 
 
 		 362 aa  78.6  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.493188  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1784  Squalene synthase  23.97 
 
 		 401 aa  76.3  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2125  phytoene/squalene synthetase family protein  23.97 
 
 		 347 aa  75.9  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3686  squalene/phytoene synthase  25.9 
 
 		 354 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.481699 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4159  squalene/phytoene synthase  25.3 
 
 		 354 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.283896  normal  0.280623 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3084  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  23.62 
 
 		 350 aa  72.8  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4328  squalene/phytoene synthase  24.84 
 
 		 367 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0106814  normal  0.0939133 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2690  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  26.35 
 
 		 373 aa  72  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.286545  normal  0.217848 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0189  squalene/phytoene synthase  26.16 
 
 		 329 aa  70.5  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.433494  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1894  Squalene/phytoene synthase  28.57 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.73181e-25 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0902  Squalene/phytoene synthase  23.61 
 
 		 351 aa  69.7  0.00000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.883554  normal  0.674566 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4104  squalene/phytoene synthase  24.64 
 
 		 355 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.132439  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4262  squalene/phytoene synthase  24.64 
 
 		 355 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0172457  normal  0.1857 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3255  squalene/phytoene synthase  24.64 
 
 		 355 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0365  Squalene/phytoene synthase  27.06 
 
 		 299 aa  68.2  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10396  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01220)  30.48 
 
 		 470 aa  68.2  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0327  squalene/phytoene synthase family protein  25.68 
 
 		 402 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479613  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5450  squalene/phytoene synthase  24.91 
 
 		 351 aa  67  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.035034 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1762  squalene/phytoene synthase family protein  25.34 
 
 		 513 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265717  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0892  Squalene/phytoene synthase  25.08 
 
 		 330 aa  65.5  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000100627  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15920  Squalene synthase  26.35 
 
 		 321 aa  65.9  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.13397  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0418  squalene/phytoene synthase family protein  25.34 
 
 		 349 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2107  squalene/phytoene synthase family protein  25.34 
 
 		 356 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.666736  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1840  squalene/phytoene synthase family protein  25.34 
 
 		 356 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.156378  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0485  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  23.26 
 
 		 348 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.501561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1133  squalene/phytoene synthase family protein  25.34 
 
 		 349 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0843  squalene/phytoene synthase family protein  25.34 
 
 		 516 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336434  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4822  Squalene/phytoene synthase  25.35 
 
 		 360 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000193666  normal  0.636776 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5617  Squalene/phytoene synthase  25.82 
 
 		 353 aa  62.8  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4808  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  28.29 
 
 		 276 aa  62  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000000603288  normal  0.956727 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1749  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  23.8 
 
 		 354 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0364934  normal  0.191421 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2043  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  28.14 
 
 		 274 aa  62.4  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.259973  normal  0.118858 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2156  squalene/phytoene synthase family protein  24.46 
 
 		 564 aa  62  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0957  squalene/phytoene synthase  25.61 
 
 		 380 aa  59.7  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4026  Squalene/phytoene synthase  21.75 
 
 		 388 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.600735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13160  predicted protein  27.67 
 
 		 314 aa  55.5  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0519  Squalene/phytoene synthase  25.56 
 
 		 270 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000172077  unclonable  0.00000000442805 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0502  Squalene/phytoene synthase  25.56 
 
 		 270 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31144  predicted protein  23.47 
 
 		 456 aa  54.3  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83429  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  28.91 
 
 		 448 aa  53.9  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.274803  normal  0.0738823 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0169  squalene/phytoene synthase  23.26 
 
 		 340 aa  51.6  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000509815  normal  0.0348824 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1827  squalene synthase HpnD  33.7 
 
 		 298 aa  49.7  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7144  squalene synthase HpnD  34.74 
 
 		 283 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05660  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase, putative  27.09 
 
 		 542 aa  47.4  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.148096  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0118  squalene/phytoene synthase  27.59 
 
 		 290 aa  47.8  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5716  squalene/phytoene synthase  26.11 
 
 		 300 aa  47  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.038374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3241  squalene synthase HpnD  34.41 
 
 		 294 aa  47  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.154532 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6349  squalene synthase HpnD  32.26 
 
 		 284 aa  47  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00743094  normal  0.0909411 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1512  squalene synthase HpnD  31.11 
 
 		 285 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575071  normal  0.0112347 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3173  squalene synthase HpnD  27.59 
 
 		 282 aa  44.3  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.170379  normal  0.798484 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1942  squalene synthase HpnD  34.41 
 
 		 283 aa  44.7  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.802248 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2218  squalene synthase HpnD  34.41 
 
 		 283 aa  44.7  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.674273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26641  squalene and phytoene synthase  29.09 
 
 		 313 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1524  putative terpenoid synthase  29.01 
 
 		 293 aa  43.9  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1833  squalene synthase HpnD  33.33 
 
 		 283 aa  43.5  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2549  squalene synthase HpnD  33.33 
 
 		 278 aa  43.1  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412385 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2271  squalene/phytoene synthase  31.68 
 
 		 278 aa  43.1  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.3606  normal  0.152656 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23110  squalene synthase HpnD  21.24 
 
 		 288 aa  42.7  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.246209  normal  0.237195 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0820  squalene/phytoene synthase  24.65 
 
 		 304 aa  42.7  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.122884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3578  squalene/phytoene synthase  22.79 
 
 		 311 aa  42.7  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0270096  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>