68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_13160 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_13160  predicted protein  100 
 
 		 314 aa  648    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31144  predicted protein  47.63 
 
 		 456 aa  279  4e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83429  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  41.96 
 
 		 448 aa  224  1e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.274803  normal  0.0738823 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10396  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01220)  41.58 
 
 		 470 aa  223  4e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05660  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase, putative  41.77 
 
 		 542 aa  223  4e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.148096  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0813  squalene synthase  31.01 
 
 		 362 aa  103  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.493188  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2280  squalene/phytoene synthase  30.03 
 
 		 359 aa  96.3  7e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15920  Squalene synthase  27.67 
 
 		 321 aa  90.5  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.13397  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0892  Squalene/phytoene synthase  23.75 
 
 		 330 aa  85.5  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000100627  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1321  squalene/phytoene synthase  28.93 
 
 		 366 aa  84  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0189  squalene/phytoene synthase  30.84 
 
 		 329 aa  84  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.433494  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20770  Squalene/phytoene synthase  29.11 
 
 		 377 aa  82  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00645323  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4822  Squalene/phytoene synthase  27.8 
 
 		 360 aa  79.3  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000193666  normal  0.636776 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1206  Squalene/phytoene synthase  21.58 
 
 		 355 aa  77.4  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000204086  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2156  squalene/phytoene synthase family protein  29.53 
 
 		 564 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2125  phytoene/squalene synthetase family protein  28.35 
 
 		 347 aa  72.4  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1784  Squalene synthase  28.35 
 
 		 401 aa  72.4  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0934  Squalene/phytoene synthase  21.84 
 
 		 348 aa  72  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2690  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  33.66 
 
 		 373 aa  70.9  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.286545  normal  0.217848 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0327  squalene/phytoene synthase family protein  30.17 
 
 		 402 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479613  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1840  squalene/phytoene synthase family protein  30.26 
 
 		 356 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.156378  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2107  squalene/phytoene synthase family protein  30.26 
 
 		 356 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.666736  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1133  squalene/phytoene synthase family protein  30.26 
 
 		 349 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0843  squalene/phytoene synthase family protein  30.26 
 
 		 516 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336434  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1762  squalene/phytoene synthase family protein  30.26 
 
 		 513 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265717  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0418  squalene/phytoene synthase family protein  28.46 
 
 		 349 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0957  squalene/phytoene synthase  25.08 
 
 		 380 aa  67  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2309  Squalene/phytoene synthase  23.69 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4328  squalene/phytoene synthase  29.57 
 
 		 367 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0106814  normal  0.0939133 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1173  Squalene/phytoene synthase  24.3 
 
 		 348 aa  66.2  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4159  squalene/phytoene synthase  27.31 
 
 		 354 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.283896  normal  0.280623 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3686  squalene/phytoene synthase  27.31 
 
 		 354 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.481699 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1749  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  28.67 
 
 		 354 aa  62  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0364934  normal  0.191421 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4262  squalene/phytoene synthase  27.05 
 
 		 355 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0172457  normal  0.1857 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3255  squalene/phytoene synthase  26.95 
 
 		 355 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4104  squalene/phytoene synthase  27.05 
 
 		 355 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.132439  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0365  Squalene/phytoene synthase  27.7 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4026  Squalene/phytoene synthase  27.61 
 
 		 388 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.600735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0169  squalene/phytoene synthase  23.94 
 
 		 340 aa  58.5  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000509815  normal  0.0348824 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5450  squalene/phytoene synthase  28.62 
 
 		 351 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.035034 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0124  hypothetical protein  28.08 
 
 		 345 aa  57.8  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5617  Squalene/phytoene synthase  27.35 
 
 		 353 aa  57.4  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0110  hypothetical protein  27.67 
 
 		 345 aa  55.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0485  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  25.42 
 
 		 348 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.501561  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2505  squalene synthase HpnD  41.43 
 
 		 279 aa  53.1  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2572  squalene synthase HpnD  40.85 
 
 		 281 aa  53.1  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0455716 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2043  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  26.93 
 
 		 274 aa  52.4  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.259973  normal  0.118858 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0902  Squalene/phytoene synthase  25.12 
 
 		 351 aa  52.4  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.883554  normal  0.674566 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2964  squalene/phytoene synthase  27.62 
 
 		 293 aa  50.4  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00159614  decreased coverage  0.000921441 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2549  squalene synthase HpnD  35.34 
 
 		 278 aa  49.3  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412385 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3578  squalene/phytoene synthase  25.12 
 
 		 311 aa  49.7  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0270096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1456  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  43.75 
 
 		 286 aa  48.5  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1202  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  40 
 
 		 279 aa  48.5  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0346934  normal  0.446286 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5716  squalene/phytoene synthase  25.59 
 
 		 300 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.038374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1121  squalene synthase HpnD  40 
 
 		 279 aa  48.5  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0502  Squalene/phytoene synthase  28.03 
 
 		 270 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2017  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  41.27 
 
 		 280 aa  47.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0519  Squalene/phytoene synthase  28.03 
 
 		 270 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000172077  unclonable  0.00000000442805 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1694  squalene/phytoene synthase  25.37 
 
 		 303 aa  47  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0597183  hitchhiker  0.0000516194 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23110  squalene synthase HpnD  32.98 
 
 		 288 aa  47  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.246209  normal  0.237195 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0820  squalene/phytoene synthase  26.7 
 
 		 304 aa  46.6  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.122884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1371  squalene/phytoene synthase  34.48 
 
 		 302 aa  47  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0070  squalene/phytoene synthase  38.57 
 
 		 280 aa  46.2  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00181146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3084  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  27.18 
 
 		 350 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1894  Squalene/phytoene synthase  28.02 
 
 		 270 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.73181e-25 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1549  squalene/phytoene synthase  40.62 
 
 		 279 aa  44.3  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0306  squalene/phytoene synthase  37.5 
 
 		 288 aa  43.5  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1047  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  30.3 
 
 		 292 aa  43.5  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.477192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>