211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0957 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0957  squalene/phytoene synthase  100 
 
 		 380 aa  787    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0418  squalene/phytoene synthase family protein  46.34 
 
 		 349 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2156  squalene/phytoene synthase family protein  46.88 
 
 		 564 aa  277  3e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0327  squalene/phytoene synthase family protein  46.04 
 
 		 402 aa  275  7e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479613  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1133  squalene/phytoene synthase family protein  46.04 
 
 		 349 aa  275  8e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1840  squalene/phytoene synthase family protein  46.04 
 
 		 356 aa  275  9e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.156378  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2107  squalene/phytoene synthase family protein  46.04 
 
 		 356 aa  275  9e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.666736  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1762  squalene/phytoene synthase family protein  46.04 
 
 		 513 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265717  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0485  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  45.13 
 
 		 348 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.501561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0843  squalene/phytoene synthase family protein  46.04 
 
 		 516 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336434  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5617  Squalene/phytoene synthase  41.91 
 
 		 353 aa  269  7e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4026  Squalene/phytoene synthase  44.96 
 
 		 388 aa  266  5e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.600735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4328  squalene/phytoene synthase  46.75 
 
 		 367 aa  265  8e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0106814  normal  0.0939133 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3084  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  44.86 
 
 		 350 aa  264  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4104  squalene/phytoene synthase  45.34 
 
 		 355 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.132439  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4262  squalene/phytoene synthase  45.34 
 
 		 355 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0172457  normal  0.1857 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3255  squalene/phytoene synthase  45.34 
 
 		 355 aa  258  8e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3686  squalene/phytoene synthase  44.58 
 
 		 354 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.481699 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4159  squalene/phytoene synthase  44.41 
 
 		 354 aa  256  6e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.283896  normal  0.280623 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5450  squalene/phytoene synthase  44.2 
 
 		 351 aa  256  6e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.035034 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1749  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  43.48 
 
 		 354 aa  253  6e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0364934  normal  0.191421 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0169  squalene/phytoene synthase  33.45 
 
 		 340 aa  159  8e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000509815  normal  0.0348824 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1321  squalene/phytoene synthase  31.04 
 
 		 366 aa  138  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20770  Squalene/phytoene synthase  31.85 
 
 		 377 aa  135  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00645323  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0365  Squalene/phytoene synthase  33.23 
 
 		 299 aa  134  3e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2125  phytoene/squalene synthetase family protein  30.45 
 
 		 347 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1784  Squalene synthase  30.45 
 
 		 401 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2690  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  32.38 
 
 		 373 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.286545  normal  0.217848 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4822  Squalene/phytoene synthase  28.14 
 
 		 360 aa  126  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000193666  normal  0.636776 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0813  squalene synthase  29.17 
 
 		 362 aa  122  9e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.493188  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2280  squalene/phytoene synthase  27.94 
 
 		 359 aa  109  7.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0189  squalene/phytoene synthase  25.48 
 
 		 329 aa  105  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.433494  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0934  Squalene/phytoene synthase  27.3 
 
 		 348 aa  97.8  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2309  Squalene/phytoene synthase  26.17 
 
 		 350 aa  95.1  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1206  Squalene/phytoene synthase  26.25 
 
 		 355 aa  91.3  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000204086  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1173  Squalene/phytoene synthase  25.95 
 
 		 348 aa  89.4  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0892  Squalene/phytoene synthase  23.53 
 
 		 330 aa  82.8  0.000000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000100627  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0523  squalene/phytoene synthase  26.96 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.182071  normal  0.774917 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3765  squalene/phytoene synthase  29.2 
 
 		 349 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.142197  hitchhiker  0.00585073 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4010  squalene/phytoene synthase  28.97 
 
 		 349 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  hitchhiker  0.005496 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0494  phytoene synthase  28.31 
 
 		 342 aa  79  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5681  squalene/phytoene synthase  30.27 
 
 		 344 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450879  hitchhiker  0.0020025 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5178  squalene/phytoene synthase  30.27 
 
 		 286 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3173  squalene synthase HpnD  30.24 
 
 		 282 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.170379  normal  0.798484 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1700  Squalene/phytoene synthase  27.59 
 
 		 355 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.898001  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4554  squalene synthase HpnD  29.89 
 
 		 282 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.124742  normal  0.209496 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3277  squalene/phytoene synthase family protein  29.89 
 
 		 282 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173331  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2102  putative phytoene synthase  29.89 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1491  squalene/phytoene synthase  28.15 
 
 		 275 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.116412  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1131  putative phytoene synthase  29.89 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0886071  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1411  putative phytoene synthase  29.89 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.590662  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3163  squalene/phytoene synthase family protein  29.89 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.395921  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2361  phytoene synthase, putative  29.84 
 
 		 397 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4953  squalene/phytoene synthase  29.96 
 
 		 282 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  normal  0.0913001 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5506  squalene synthase HpnD  29.96 
 
 		 282 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0194601 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0017  squalene/phytoene synthase  30.16 
 
 		 282 aa  72  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0010  putative squalene/phytoene synthase  30.74 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7027  squalene synthase HpnD  31.02 
 
 		 282 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.597423  hitchhiker  0.000000555779 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0276  Squalene/phytoene synthase  25.83 
 
 		 321 aa  70.5  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.54913  normal  0.0299312 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83429  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  26.15 
 
 		 448 aa  70.5  0.00000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.274803  normal  0.0738823 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1752  squalene/phytoene synthase  27.14 
 
 		 337 aa  70.1  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4139  squalene synthase HpnD  30 
 
 		 290 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2703  squalene/phytoene synthase  24.4 
 
 		 324 aa  68.9  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80466  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4263  squalene synthase HpnD  29.34 
 
 		 279 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1746  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  27.27 
 
 		 316 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2043  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  28.32 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.259973  normal  0.118858 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2267  Squalene/phytoene synthase  29.39 
 
 		 292 aa  67  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13160  predicted protein  25.08 
 
 		 314 aa  67  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4808  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  29.03 
 
 		 276 aa  66.6  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000000603288  normal  0.956727 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1894  Squalene/phytoene synthase  27.7 
 
 		 270 aa  67  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.73181e-25 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1262  squalene/phytoene synthase  27.2 
 
 		 348 aa  66.6  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.238367  normal  0.0709995 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2117  squalene/phytoene synthase  27.56 
 
 		 337 aa  66.6  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2244  Phytoene synthase  23.85 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2684  squalene/phytoene synthase  29.58 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.166046  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2967  putative phytoene synthase  30.13 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0902  Squalene/phytoene synthase  27.24 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.883554  normal  0.674566 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3154  squalene synthase HpnD  30.41 
 
 		 285 aa  63.5  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5424  squalene synthase HpnD  27.68 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.766675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0502  Squalene/phytoene synthase  25.79 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3735  squalene/phytoene synthase  28.06 
 
 		 351 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0802479 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4149  phytoene synthase  27.65 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.165993  normal  0.461254 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0519  Squalene/phytoene synthase  25.79 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000172077  unclonable  0.00000000442805 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1718  squalene/phytoene synthase  30.21 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.150887  normal  0.105129 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0937  Squalene/phytoene synthase  23.61 
 
 		 331 aa  62.4  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0100379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2271  squalene/phytoene synthase  27.89 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.3606  normal  0.152656 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0820  squalene/phytoene synthase  25.62 
 
 		 304 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.122884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1694  squalene/phytoene synthase  25.83 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0597183  hitchhiker  0.0000516194 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1356  phytoene desaturase  25 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0299  phytoene synthase  27.19 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.791623  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0145  squalene and phytoene synthase  23.62 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2046  Squalene/phytoene synthase  24.6 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.951992  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5716  squalene/phytoene synthase  25.73 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.038374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1846  squalene/phytoene synthase  28.12 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1618  squalene/phytoene synthase  31.62 
 
 		 364 aa  60.5  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26641  squalene and phytoene synthase  26.67 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0110  hypothetical protein  25.61 
 
 		 345 aa  59.7  0.00000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4080  squalene/phytoene synthase  34.96 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.243563 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2842  squalene/phytoene synthase  26.16 
 
 		 338 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0026  squalene/phytoene synthase  31.71 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3241  squalene synthase HpnD  27.14 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.154532 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>