221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4328 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_4328  squalene/phytoene synthase  100 
 
 		 367 aa  729    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0106814  normal  0.0939133 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3686  squalene/phytoene synthase  86.86 
 
 		 354 aa  608  1e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.481699 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4159  squalene/phytoene synthase  86.86 
 
 		 354 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.283896  normal  0.280623 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3255  squalene/phytoene synthase  84.81 
 
 		 355 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4104  squalene/phytoene synthase  84.53 
 
 		 355 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.132439  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4262  squalene/phytoene synthase  84.53 
 
 		 355 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0172457  normal  0.1857 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1749  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  82.86 
 
 		 354 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0364934  normal  0.191421 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2156  squalene/phytoene synthase family protein  58.03 
 
 		 564 aa  377  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1840  squalene/phytoene synthase family protein  57.22 
 
 		 356 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.156378  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2107  squalene/phytoene synthase family protein  57.22 
 
 		 356 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.666736  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0485  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  58.19 
 
 		 348 aa  368  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.501561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0843  squalene/phytoene synthase family protein  57.22 
 
 		 516 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336434  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1133  squalene/phytoene synthase family protein  58.06 
 
 		 349 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0418  squalene/phytoene synthase family protein  58.36 
 
 		 349 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3084  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  60.67 
 
 		 350 aa  365  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1762  squalene/phytoene synthase family protein  56.94 
 
 		 513 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265717  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0327  squalene/phytoene synthase family protein  56.94 
 
 		 402 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479613  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5450  squalene/phytoene synthase  58.26 
 
 		 351 aa  360  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.035034 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4026  Squalene/phytoene synthase  58.03 
 
 		 388 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.600735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5617  Squalene/phytoene synthase  56.43 
 
 		 353 aa  350  3e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0957  squalene/phytoene synthase  44.57 
 
 		 380 aa  268  1e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0169  squalene/phytoene synthase  30.59 
 
 		 340 aa  154  2.9999999999999998e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000509815  normal  0.0348824 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20770  Squalene/phytoene synthase  33.14 
 
 		 377 aa  128  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00645323  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0365  Squalene/phytoene synthase  33.33 
 
 		 299 aa  125  9e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4822  Squalene/phytoene synthase  28.53 
 
 		 360 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000193666  normal  0.636776 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2280  squalene/phytoene synthase  28.75 
 
 		 359 aa  110  5e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1784  Squalene synthase  29.97 
 
 		 401 aa  109  7.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2125  phytoene/squalene synthetase family protein  29.97 
 
 		 347 aa  109  9.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0813  squalene synthase  29.85 
 
 		 362 aa  108  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.493188  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1321  squalene/phytoene synthase  29.47 
 
 		 366 aa  103  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0189  squalene/phytoene synthase  26.86 
 
 		 329 aa  97.8  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.433494  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2690  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  29.55 
 
 		 373 aa  89.7  7e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.286545  normal  0.217848 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0892  Squalene/phytoene synthase  23.94 
 
 		 330 aa  87.8  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000100627  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1206  Squalene/phytoene synthase  26.75 
 
 		 355 aa  80.5  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000204086  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0934  Squalene/phytoene synthase  28.48 
 
 		 348 aa  76.6  0.0000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10396  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01220)  27.24 
 
 		 470 aa  72.8  0.000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0110  hypothetical protein  24.84 
 
 		 345 aa  72  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4808  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  28.22 
 
 		 276 aa  72.4  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000000603288  normal  0.956727 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2309  Squalene/phytoene synthase  25.63 
 
 		 350 aa  72.4  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0124  hypothetical protein  25.33 
 
 		 345 aa  71.6  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1173  Squalene/phytoene synthase  27.78 
 
 		 348 aa  71.6  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2043  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  27.2 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.259973  normal  0.118858 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13160  predicted protein  29.57 
 
 		 314 aa  66.2  0.0000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0902  Squalene/phytoene synthase  31.47 
 
 		 351 aa  66.2  0.0000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.883554  normal  0.674566 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01581  squalene and phytoene synthase  26.43 
 
 		 313 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1894  Squalene/phytoene synthase  28.99 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.73181e-25 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3241  squalene synthase HpnD  26.85 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.154532 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3154  squalene synthase HpnD  30.23 
 
 		 285 aa  63.5  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0494  phytoene synthase  28.08 
 
 		 342 aa  63.2  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0502  Squalene/phytoene synthase  29.41 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0519  Squalene/phytoene synthase  29.41 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000172077  unclonable  0.00000000442805 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7027  squalene synthase HpnD  29.72 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.597423  hitchhiker  0.000000555779 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4139  squalene synthase HpnD  28.97 
 
 		 290 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1469  squalene/phytoene synthase  27.59 
 
 		 278 aa  61.2  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.093499 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2212  Phytoene synthase  31.1 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306787  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15920  Squalene synthase  24.23 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.13397  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2267  Squalene/phytoene synthase  27.93 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0010  putative squalene/phytoene synthase  29.72 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2967  putative phytoene synthase  29.55 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4263  squalene synthase HpnD  27.85 
 
 		 279 aa  59.3  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0306  squalene/phytoene synthase  27.83 
 
 		 288 aa  58.9  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2102  putative phytoene synthase  28.24 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3163  squalene/phytoene synthase family protein  28.24 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.395921  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1718  squalene/phytoene synthase  29.28 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.150887  normal  0.105129 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1131  putative phytoene synthase  28.24 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0886071  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6349  squalene synthase HpnD  29.43 
 
 		 284 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00743094  normal  0.0909411 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1411  putative phytoene synthase  28.24 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.590662  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83429  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  24.88 
 
 		 448 aa  58.5  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.274803  normal  0.0738823 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3277  squalene/phytoene synthase family protein  28.24 
 
 		 282 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173331  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1491  squalene/phytoene synthase  28.57 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.116412  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0820  squalene/phytoene synthase  29.91 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.122884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0026  squalene/phytoene synthase  35.04 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3310  Phytoene synthase  35.09 
 
 		 317 aa  57.8  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4554  squalene synthase HpnD  26.9 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.124742  normal  0.209496 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3575  squalene/phytoene synthase  28.53 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0912672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1752  squalene/phytoene synthase  31.82 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2271  squalene/phytoene synthase  30 
 
 		 278 aa  57  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.3606  normal  0.152656 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2699  Phytoene synthase  26.55 
 
 		 316 aa  57  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2703  squalene/phytoene synthase  28.31 
 
 		 324 aa  57  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80466  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5681  squalene/phytoene synthase  27.43 
 
 		 344 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450879  hitchhiker  0.0020025 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6444  phytoene synthase  29.68 
 
 		 346 aa  56.6  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.974636 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5178  squalene/phytoene synthase  27.93 
 
 		 286 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1697  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  29.55 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0937  Squalene/phytoene synthase  28.45 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0100379  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05660  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase, putative  26.1 
 
 		 542 aa  55.8  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.148096  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0270  phytoene synthase  30.59 
 
 		 355 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2244  Phytoene synthase  39.51 
 
 		 303 aa  55.8  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2361  phytoene synthase, putative  28.11 
 
 		 397 aa  55.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2684  squalene/phytoene synthase  30.48 
 
 		 278 aa  55.8  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.166046  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4953  squalene/phytoene synthase  28.64 
 
 		 282 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  normal  0.0913001 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1694  squalene/phytoene synthase  31.22 
 
 		 303 aa  55.8  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0597183  hitchhiker  0.0000516194 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7144  squalene synthase HpnD  28.38 
 
 		 283 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01621  squalene and phytoene synthase  25.1 
 
 		 302 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26641  squalene and phytoene synthase  25.4 
 
 		 313 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1512  squalene synthase HpnD  25.35 
 
 		 285 aa  55.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575071  normal  0.0112347 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6667  squalene synthase HpnD  29.09 
 
 		 287 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.349811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0523  squalene/phytoene synthase  27.17 
 
 		 298 aa  55.5  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.182071  normal  0.774917 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2819  Phytoene synthase  30.7 
 
 		 335 aa  55.1  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01601  squalene and phytoene synthase  23.9 
 
 		 302 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.37181  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1601  Squalene/phytoene synthase  38.37 
 
 		 575 aa  54.7  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0484297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>