119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_83429 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009044  PICST_83429  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  100 
 
 		 448 aa  928    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.274803  normal  0.0738823 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10396  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01220)  46.79 
 
 		 470 aa  392  1e-108  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05660  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase, putative  46.76 
 
 		 542 aa  348  2e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.148096  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31144  predicted protein  39.49 
 
 		 456 aa  269  8.999999999999999e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13160  predicted protein  41.96 
 
 		 314 aa  224  2e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20770  Squalene/phytoene synthase  29.69 
 
 		 377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00645323  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0892  Squalene/phytoene synthase  29.04 
 
 		 330 aa  106  8e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000100627  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2280  squalene/phytoene synthase  26.99 
 
 		 359 aa  93.6  7e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2125  phytoene/squalene synthetase family protein  26.69 
 
 		 347 aa  92.8  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1784  Squalene synthase  26.69 
 
 		 401 aa  92.8  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15920  Squalene synthase  28.96 
 
 		 321 aa  92.4  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.13397  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0813  squalene synthase  24.61 
 
 		 362 aa  82.4  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.493188  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1173  Squalene/phytoene synthase  24.11 
 
 		 348 aa  80.9  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2309  Squalene/phytoene synthase  23.77 
 
 		 350 aa  78.6  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2156  squalene/phytoene synthase family protein  23.66 
 
 		 564 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1206  Squalene/phytoene synthase  24.28 
 
 		 355 aa  76.3  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000204086  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4822  Squalene/phytoene synthase  27.55 
 
 		 360 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000193666  normal  0.636776 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0418  squalene/phytoene synthase family protein  24.6 
 
 		 349 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2690  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  24.26 
 
 		 373 aa  74.3  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.286545  normal  0.217848 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1894  Squalene/phytoene synthase  33.82 
 
 		 270 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.73181e-25 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0902  Squalene/phytoene synthase  27.54 
 
 		 351 aa  72.4  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.883554  normal  0.674566 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4808  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  28.47 
 
 		 276 aa  72  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000000603288  normal  0.956727 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0843  squalene/phytoene synthase family protein  24.27 
 
 		 516 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336434  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1762  squalene/phytoene synthase family protein  23.7 
 
 		 513 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265717  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0957  squalene/phytoene synthase  26.15 
 
 		 380 aa  70.5  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0934  Squalene/phytoene synthase  23.08 
 
 		 348 aa  70.5  0.00000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1133  squalene/phytoene synthase family protein  24.27 
 
 		 349 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0327  squalene/phytoene synthase family protein  23.7 
 
 		 402 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479613  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1840  squalene/phytoene synthase family protein  24.27 
 
 		 356 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.156378  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2107  squalene/phytoene synthase family protein  24.27 
 
 		 356 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.666736  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0169  squalene/phytoene synthase  27.23 
 
 		 340 aa  68.2  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000509815  normal  0.0348824 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0189  squalene/phytoene synthase  30.23 
 
 		 329 aa  67.4  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.433494  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5450  squalene/phytoene synthase  25.74 
 
 		 351 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.035034 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0365  Squalene/phytoene synthase  27.78 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4159  squalene/phytoene synthase  23.53 
 
 		 354 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.283896  normal  0.280623 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1321  squalene/phytoene synthase  23.34 
 
 		 366 aa  62  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1749  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  25.23 
 
 		 354 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0364934  normal  0.191421 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0519  Squalene/phytoene synthase  29.38 
 
 		 270 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000172077  unclonable  0.00000000442805 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5617  Squalene/phytoene synthase  22.48 
 
 		 353 aa  62  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2043  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  29.3 
 
 		 274 aa  62.4  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.259973  normal  0.118858 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0502  Squalene/phytoene synthase  29.38 
 
 		 270 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1827  squalene synthase HpnD  25.56 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3686  squalene/phytoene synthase  23.92 
 
 		 354 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.481699 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0485  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  22.29 
 
 		 348 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.501561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4104  squalene/phytoene synthase  24.9 
 
 		 355 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.132439  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4262  squalene/phytoene synthase  24.9 
 
 		 355 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0172457  normal  0.1857 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3255  squalene/phytoene synthase  24.9 
 
 		 355 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3084  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  24.23 
 
 		 350 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4328  squalene/phytoene synthase  24.88 
 
 		 367 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0106814  normal  0.0939133 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4026  Squalene/phytoene synthase  23.95 
 
 		 388 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.600735  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0124  hypothetical protein  27.83 
 
 		 345 aa  56.6  0.0000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2684  squalene/phytoene synthase  26.84 
 
 		 278 aa  55.1  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.166046  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5716  squalene/phytoene synthase  27.01 
 
 		 300 aa  54.3  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.038374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2212  Phytoene synthase  27.7 
 
 		 333 aa  54.3  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306787  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0110  hypothetical protein  28.91 
 
 		 345 aa  53.9  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2267  Squalene/phytoene synthase  44 
 
 		 292 aa  52.8  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1718  squalene/phytoene synthase  25.68 
 
 		 279 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.150887  normal  0.105129 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2964  squalene/phytoene synthase  27.6 
 
 		 293 aa  52.4  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00159614  decreased coverage  0.000921441 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7144  squalene synthase HpnD  26.4 
 
 		 283 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5424  squalene synthase HpnD  27.41 
 
 		 283 aa  52  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.766675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3241  squalene synthase HpnD  27.05 
 
 		 294 aa  52  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.154532 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2967  putative phytoene synthase  24.88 
 
 		 279 aa  51.2  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3578  squalene/phytoene synthase  26.26 
 
 		 311 aa  51.6  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0270096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4149  phytoene synthase  26.67 
 
 		 282 aa  50.8  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.165993  normal  0.461254 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2117  squalene/phytoene synthase  27.27 
 
 		 337 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6349  squalene synthase HpnD  26.7 
 
 		 284 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00743094  normal  0.0909411 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1833  squalene synthase HpnD  25.37 
 
 		 283 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1047  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  36.84 
 
 		 292 aa  50.4  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.477192  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2819  Phytoene synthase  24.88 
 
 		 335 aa  50.1  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1942  squalene synthase HpnD  25.87 
 
 		 283 aa  50.4  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.802248 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2218  squalene synthase HpnD  25.87 
 
 		 283 aa  50.4  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.674273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0523  squalene/phytoene synthase  22.73 
 
 		 298 aa  50.1  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.182071  normal  0.774917 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0820  squalene/phytoene synthase  25.85 
 
 		 304 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.122884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2017  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  26.56 
 
 		 280 aa  49.7  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2271  squalene/phytoene synthase  27.23 
 
 		 278 aa  48.5  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.3606  normal  0.152656 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2584  squalene/phytoene synthase  22.86 
 
 		 287 aa  48.9  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0158567  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2638  squalene/phytoene synthase  22.86 
 
 		 287 aa  48.9  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.444406  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4080  squalene/phytoene synthase  26.44 
 
 		 310 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.243563 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1752  squalene/phytoene synthase  25.62 
 
 		 337 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0309  Phytoene synthase  27.31 
 
 		 310 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3154  squalene synthase HpnD  24.75 
 
 		 285 aa  48.9  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4263  squalene synthase HpnD  27.55 
 
 		 279 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0309  Squalene/phytoene synthase  27.31 
 
 		 310 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1724  squalene/phytoene synthase  25.08 
 
 		 279 aa  48.5  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.949729  normal  0.0688647 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2703  squalene/phytoene synthase  26.37 
 
 		 324 aa  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80466  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4139  squalene synthase HpnD  26.29 
 
 		 290 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4953  squalene/phytoene synthase  26.84 
 
 		 301 aa  47.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.251638  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2102  putative phytoene synthase  25.25 
 
 		 282 aa  47  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1491  squalene/phytoene synthase  25.25 
 
 		 275 aa  47  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.116412  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2361  phytoene synthase, putative  25.64 
 
 		 397 aa  47  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1131  putative phytoene synthase  25.25 
 
 		 282 aa  47  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0886071  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1411  putative phytoene synthase  25.25 
 
 		 282 aa  47  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.590662  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3277  squalene/phytoene synthase family protein  25.25 
 
 		 282 aa  47  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173331  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3163  squalene/phytoene synthase family protein  25.25 
 
 		 282 aa  47  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.395921  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01581  squalene and phytoene synthase  26.54 
 
 		 313 aa  47  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0017  squalene/phytoene synthase  24.02 
 
 		 282 aa  46.6  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3575  squalene/phytoene synthase  26.7 
 
 		 279 aa  46.6  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0912672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5178  squalene/phytoene synthase  24.62 
 
 		 286 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5681  squalene/phytoene synthase  24.62 
 
 		 344 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450879  hitchhiker  0.0020025 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1700  Squalene/phytoene synthase  26.21 
 
 		 355 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.898001  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>