99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_10396 on replicon BN001306
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001306  ANIA_10396  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01220)  100 
 
 
470 aa  979    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83429  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  46.79 
 
 
448 aa  392  1e-108  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.274803  normal  0.0738823 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05660  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase, putative  46.36 
 
 
542 aa  346  5e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.148096  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31144  predicted protein  39.11 
 
 
456 aa  256  5e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13160  predicted protein  41.58 
 
 
314 aa  223  7e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2125  phytoene/squalene synthetase family protein  30.94 
 
 
347 aa  103  7e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1784  Squalene synthase  30.63 
 
 
401 aa  103  7e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0892  Squalene/phytoene synthase  30.88 
 
 
330 aa  99.8  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000100627  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15920  Squalene synthase  29.1 
 
 
321 aa  98.6  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.13397  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20770  Squalene/phytoene synthase  28.18 
 
 
377 aa  95.1  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00645323  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1206  Squalene/phytoene synthase  25.51 
 
 
355 aa  94.7  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000204086  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1173  Squalene/phytoene synthase  26.77 
 
 
348 aa  89.4  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2280  squalene/phytoene synthase  27.46 
 
 
359 aa  88.6  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0813  squalene synthase  27.27 
 
 
362 aa  86.3  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.493188  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0902  Squalene/phytoene synthase  25.95 
 
 
351 aa  85.9  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.883554  normal  0.674566 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4822  Squalene/phytoene synthase  27.86 
 
 
360 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000193666  normal  0.636776 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2309  Squalene/phytoene synthase  24.37 
 
 
350 aa  78.6  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3686  squalene/phytoene synthase  28.47 
 
 
354 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.481699 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5617  Squalene/phytoene synthase  29.14 
 
 
353 aa  77  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2156  squalene/phytoene synthase family protein  24.68 
 
 
564 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4159  squalene/phytoene synthase  28.85 
 
 
354 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.283896  normal  0.280623 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3255  squalene/phytoene synthase  28.83 
 
 
355 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1321  squalene/phytoene synthase  25.45 
 
 
366 aa  73.9  0.000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4328  squalene/phytoene synthase  27.24 
 
 
367 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0106814  normal  0.0939133 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4104  squalene/phytoene synthase  27.4 
 
 
355 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.132439  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0124  hypothetical protein  31.43 
 
 
345 aa  71.2  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4262  squalene/phytoene synthase  27.4 
 
 
355 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0172457  normal  0.1857 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1749  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  28.67 
 
 
354 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0364934  normal  0.191421 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0418  squalene/phytoene synthase family protein  24.76 
 
 
349 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0110  hypothetical protein  30.48 
 
 
345 aa  68.2  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1762  squalene/phytoene synthase family protein  24.92 
 
 
513 aa  67  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265717  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0934  Squalene/phytoene synthase  22.46 
 
 
348 aa  67  0.0000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3084  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  24.57 
 
 
350 aa  66.6  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0189  squalene/phytoene synthase  27.03 
 
 
329 aa  66.6  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.433494  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0327  squalene/phytoene synthase family protein  24.61 
 
 
402 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479613  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1840  squalene/phytoene synthase family protein  24.13 
 
 
356 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.156378  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2107  squalene/phytoene synthase family protein  24.13 
 
 
356 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.666736  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1133  squalene/phytoene synthase family protein  24.13 
 
 
349 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0843  squalene/phytoene synthase family protein  24.29 
 
 
516 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336434  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0365  Squalene/phytoene synthase  24.51 
 
 
299 aa  64.7  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4026  Squalene/phytoene synthase  25.93 
 
 
388 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.600735  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2690  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  26.48 
 
 
373 aa  62.8  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.286545  normal  0.217848 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5450  squalene/phytoene synthase  24.49 
 
 
351 aa  62  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.035034 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0485  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  23.79 
 
 
348 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.501561  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0519  Squalene/phytoene synthase  26.71 
 
 
270 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000172077  unclonable  0.00000000442805 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0502  Squalene/phytoene synthase  26.71 
 
 
270 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4808  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  26.5 
 
 
276 aa  57.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000000603288  normal  0.956727 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1894  Squalene/phytoene synthase  26.09 
 
 
270 aa  57.4  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.73181e-25 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1827  squalene synthase HpnD  29.23 
 
 
298 aa  54.3  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02151  squalene and phytoene synthase  25.44 
 
 
312 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1509  squalene and phytoene synthase  25.44 
 
 
312 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0957  squalene/phytoene synthase  20.88 
 
 
380 aa  51.2  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2043  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  28.09 
 
 
274 aa  50.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.259973  normal  0.118858 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5424  squalene synthase HpnD  28.5 
 
 
283 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.766675  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0169  squalene/phytoene synthase  24.55 
 
 
340 aa  50.1  0.00008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000509815  normal  0.0348824 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0309  Squalene/phytoene synthase  26.25 
 
 
310 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0309  Phytoene synthase  26.25 
 
 
310 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2964  squalene/phytoene synthase  25.76 
 
 
293 aa  48.5  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00159614  decreased coverage  0.000921441 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3241  squalene synthase HpnD  25.29 
 
 
294 aa  48.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.154532 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01711  squalene and phytoene synthase  26.22 
 
 
302 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.460844  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13432  phytoene synthase phyA  27.66 
 
 
302 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0378  Phytoene synthase  33.7 
 
 
277 aa  47.8  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.883354  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2505  squalene synthase HpnD  41.94 
 
 
279 aa  47.8  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1746  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  25.52 
 
 
316 aa  48.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2572  squalene synthase HpnD  45.31 
 
 
281 aa  47.8  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0455716 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1121  squalene synthase HpnD  40.62 
 
 
279 aa  47.4  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1202  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  40.62 
 
 
279 aa  47.4  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0346934  normal  0.446286 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2017  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  43.55 
 
 
280 aa  47.4  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01601  squalene and phytoene synthase  25.52 
 
 
302 aa  47  0.0007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.37181  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4080  squalene/phytoene synthase  38.96 
 
 
310 aa  47  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.243563 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0820  squalene/phytoene synthase  25.94 
 
 
304 aa  47  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.122884  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1456  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  40.32 
 
 
286 aa  46.6  0.0009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1732  Squalene/phytoene synthase  26.11 
 
 
310 aa  46.2  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.956731  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1711  squalene/phytoene synthase  29.1 
 
 
309 aa  46.2  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.208804 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0145  squalene and phytoene synthase  24.74 
 
 
302 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0070  squalene/phytoene synthase  43.08 
 
 
280 aa  46.2  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00181146  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1158  Squalene/phytoene synthase  27.19 
 
 
310 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01621  squalene and phytoene synthase  25.52 
 
 
302 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1287  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  40.62 
 
 
287 aa  45.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.200444  normal  0.0949052 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1549  squalene/phytoene synthase  40.32 
 
 
279 aa  45.1  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1694  squalene/phytoene synthase  26.77 
 
 
303 aa  45.1  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0597183  hitchhiker  0.0000516194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6667  squalene synthase HpnD  37.66 
 
 
287 aa  45.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.349811  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5716  squalene/phytoene synthase  28.37 
 
 
300 aa  45.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.038374  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1752  squalene/phytoene synthase  25.49 
 
 
337 aa  45.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1469  squalene/phytoene synthase  34.48 
 
 
278 aa  44.7  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.093499 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23110  squalene synthase HpnD  43.55 
 
 
288 aa  44.3  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.246209  normal  0.237195 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3578  squalene/phytoene synthase  28.57 
 
 
311 aa  44.3  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0270096  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0937  Squalene/phytoene synthase  33.33 
 
 
331 aa  44.7  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0100379  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4263  squalene synthase HpnD  36.59 
 
 
279 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7144  squalene synthase HpnD  43.08 
 
 
283 aa  44.3  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3575  squalene/phytoene synthase  32.38 
 
 
279 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0912672  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1047  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  33.33 
 
 
292 aa  44.3  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.477192  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1942  squalene synthase HpnD  38.67 
 
 
283 aa  43.9  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.802248 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2218  squalene synthase HpnD  38.67 
 
 
283 aa  43.9  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.674273  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2212  Phytoene synthase  23.12 
 
 
333 aa  43.9  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306787  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0969  Squalene/phytoene synthase  26.11 
 
 
311 aa  43.9  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1833  squalene synthase HpnD  38.67 
 
 
283 aa  43.5  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1356  phytoene desaturase  35.21 
 
 
311 aa  43.5  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2343  squalene/phytoene synthase  25.33 
 
 
280 aa  43.5  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.149671  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>