More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0439 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0462  chorismate synthase  92.86 
 
 		 364 aa  694    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.282213  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0439  chorismate synthase  100 
 
 		 364 aa  741    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.178344  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_405  chorismate synthase  93.13 
 
 		 364 aa  701    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.09813  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0547  chorismate synthase  50.97 
 
 		 365 aa  387  1e-106  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1438  chorismate synthase  50.97 
 
 		 365 aa  370  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0161  chorismate synthase  50.41 
 
 		 373 aa  369  1e-101  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.900075  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1012  chorismate synthase  50.28 
 
 		 366 aa  360  2e-98  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3801  chorismate synthase  48.73 
 
 		 364 aa  336  2.9999999999999997e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0689  chorismate synthase  46.88 
 
 		 373 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0139341  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1623  chorismate synthase  45.63 
 
 		 363 aa  325  7e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3830  chorismate synthase  46.46 
 
 		 358 aa  322  7e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0644  chorismate synthase  44.74 
 
 		 377 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0691  chorismate synthase  44.13 
 
 		 357 aa  317  2e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0522046  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0530  chorismate synthase  44.66 
 
 		 365 aa  317  3e-85  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.910862  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1282  chorismate synthase  46.2 
 
 		 391 aa  315  6e-85  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0690  chorismate synthase  43.82 
 
 		 357 aa  315  6e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140082  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0823  chorismate synthase  44.94 
 
 		 360 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1952  chorismate synthase  46.89 
 
 		 358 aa  313  2.9999999999999996e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02451  chorismate synthase  45.38 
 
 		 365 aa  311  7.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.642724  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02561  chorismate synthase  45.1 
 
 		 364 aa  310  2e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.46541  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02461  chorismate synthase  45.1 
 
 		 365 aa  309  4e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10150  chorismate synthase  46.3 
 
 		 362 aa  307  2.0000000000000002e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.107827  hitchhiker  0.00000077932 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1637  chorismate synthase  46.63 
 
 		 362 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1664  chorismate synthase  46.63 
 
 		 362 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0212  chorismate synthase  47.75 
 
 		 362 aa  306  4.0000000000000004e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.468689 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02471  chorismate synthase  47.37 
 
 		 363 aa  304  1.0000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0226  chorismate synthase  45.38 
 
 		 365 aa  305  1.0000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2119  chorismate synthase  45.13 
 
 		 368 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2355  chorismate synthase  46.91 
 
 		 362 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0369  chorismate synthase  43.38 
 
 		 360 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1702  chorismate synthase  44.62 
 
 		 384 aa  303  4.0000000000000003e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4576  chorismate synthase  45.45 
 
 		 352 aa  302  6.000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0589  chorismate synthase  45.79 
 
 		 362 aa  302  7.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2149  chorismate synthase  44.76 
 
 		 355 aa  302  8.000000000000001e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0529344  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11018  chorismate synthase  45.45 
 
 		 354 aa  301  9e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4081  chorismate synthase  47.03 
 
 		 356 aa  301  1e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4112  chorismate synthase  45.83 
 
 		 363 aa  301  2e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356503  normal  0.0141233 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3438  chorismate synthase  44.69 
 
 		 360 aa  299  4e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000199375 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0879  chorismate synthase  45.25 
 
 		 368 aa  299  4e-80  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5072  chorismate synthase  45.56 
 
 		 359 aa  299  5e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1361  chorismate synthase  45.07 
 
 		 362 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.565895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1649  chorismate synthase  46.39 
 
 		 357 aa  296  3e-79  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0108012 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1943  chorismate synthase  44.2 
 
 		 332 aa  296  4e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3093  chorismate synthase  48.5 
 
 		 367 aa  296  5e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000101466  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23791  chorismate synthase  45.22 
 
 		 362 aa  295  1e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0240204 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1763  chorismate synthase  43.45 
 
 		 365 aa  291  9e-78  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1510  chorismate synthase  46.22 
 
 		 362 aa  291  1e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0835  chorismate synthase  45.51 
 
 		 362 aa  291  1e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03041  chorismate synthase  44.94 
 
 		 361 aa  290  3e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.418255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2866  chorismate synthase  45.51 
 
 		 370 aa  290  3e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1593  chorismate synthase  44.94 
 
 		 361 aa  289  4e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.040702  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02755  chorismate synthase  44.79 
 
 		 365 aa  288  8e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0341392  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0578  chorismate synthase  44.17 
 
 		 373 aa  287  2e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.778585  normal  0.127119 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4064  chorismate synthase  44.97 
 
 		 359 aa  287  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000659407  hitchhiker  0.000000405427 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1010  chorismate synthase  40.22 
 
 		 369 aa  286  2.9999999999999996e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0494741  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0041  chorismate synthase  47.88 
 
 		 351 aa  286  5e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0022126  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0732  chorismate synthase  42.86 
 
 		 394 aa  285  5.999999999999999e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0075518  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2466  chorismate synthase  43.22 
 
 		 361 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.358807  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2938  chorismate synthase  43.91 
 
 		 369 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1340  chorismate synthase  43.36 
 
 		 386 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0780  chorismate synthase  42.62 
 
 		 365 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.151802  normal  0.220812 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1814  chorismate synthase  45.04 
 
 		 367 aa  282  6.000000000000001e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2420  chorismate synthase  43.89 
 
 		 366 aa  282  6.000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0349388  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1568  chorismate synthase  44.38 
 
 		 364 aa  280  2e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0304  chorismate synthase  45.3 
 
 		 366 aa  281  2e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.21806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2427  chorismate synthase  41.07 
 
 		 392 aa  281  2e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00147882  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2040  chorismate synthase  45.3 
 
 		 364 aa  279  5e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1360  chorismate synthase  43.79 
 
 		 366 aa  279  5e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767963  normal  0.499065 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2090  chorismate synthase  44.92 
 
 		 354 aa  279  7e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0281395  normal  0.0647066 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0260  chorismate synthase  44.17 
 
 		 373 aa  278  7e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1873  chorismate synthase  45.58 
 
 		 390 aa  278  8e-74  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.485609 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1541  chorismate synthase  43.34 
 
 		 366 aa  278  8e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2168  chorismate synthase  42.49 
 
 		 361 aa  278  1e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2171  chorismate synthase  44.38 
 
 		 359 aa  277  2e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90939  Chorismate synthase  42.31 
 
 		 377 aa  277  2e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.352684 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1640  chorismate synthase  42.21 
 
 		 363 aa  276  4e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503125 
 
 
-
 
NC_002950  PG1314  chorismate synthase  46.37 
 
 		 368 aa  276  4e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1972  chorismate synthase  42.21 
 
 		 363 aa  276  4e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1789  chorismate synthase  43.06 
 
 		 366 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681987  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0702  chorismate synthase  44.51 
 
 		 366 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2767  chorismate synthase  42.49 
 
 		 366 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2091  chorismate synthase  41.41 
 
 		 371 aa  273  3e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1897  chorismate synthase  42.98 
 
 		 361 aa  273  3e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1947  chorismate synthase  46.46 
 
 		 354 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2159  chorismate synthase  43.5 
 
 		 365 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29930  predicted protein  43.18 
 
 		 458 aa  272  5.000000000000001e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1538  chorismate synthase  41.62 
 
 		 366 aa  272  6e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0770  chorismate synthase  43.77 
 
 		 366 aa  272  6e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.742046  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002863  chorismate synthase  42.78 
 
 		 361 aa  272  7e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1569  chorismate synthase  42.21 
 
 		 366 aa  272  7e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1537  chorismate synthase  43.02 
 
 		 364 aa  271  1e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1381  chorismate synthase  42.49 
 
 		 366 aa  270  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.674702 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0978  chorismate synthase  42.49 
 
 		 366 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1460  chorismate synthase  42.49 
 
 		 366 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1241  chorismate synthase  42.54 
 
 		 366 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0629  chorismate synthase  44.08 
 
 		 368 aa  270  4e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1564  chorismate synthase  45.3 
 
 		 328 aa  270  4e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03114  chorismate synthase  42.49 
 
 		 384 aa  270  4e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1974  chorismate synthase  44.76 
 
 		 358 aa  269  5e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2251  chorismate synthase  43.06 
 
 		 352 aa  269  5e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>