More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2866 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_2866  chorismate synthase  100 
 
 		 370 aa  762    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2355  chorismate synthase  81.77 
 
 		 362 aa  615  1e-175  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0589  chorismate synthase  82.32 
 
 		 362 aa  617  1e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1637  chorismate synthase  81.06 
 
 		 362 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1664  chorismate synthase  81.06 
 
 		 362 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1361  chorismate synthase  80.66 
 
 		 362 aa  597  1e-170  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.565895  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0835  chorismate synthase  80.11 
 
 		 362 aa  591  1e-168  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0212  chorismate synthase  77.78 
 
 		 362 aa  570  1e-161  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.468689 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02471  chorismate synthase  67.41 
 
 		 363 aa  504  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02561  chorismate synthase  64.56 
 
 		 364 aa  501  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.46541  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02451  chorismate synthase  63.09 
 
 		 365 aa  496  1e-139  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.642724  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02461  chorismate synthase  62.74 
 
 		 365 aa  495  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0226  chorismate synthase  63.29 
 
 		 365 aa  495  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0304  chorismate synthase  68.23 
 
 		 366 aa  493  9.999999999999999e-139  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.21806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29930  predicted protein  64.27 
 
 		 458 aa  488  1e-137  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2040  chorismate synthase  67.4 
 
 		 364 aa  487  1e-136  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23791  chorismate synthase  65.28 
 
 		 362 aa  482  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0240204 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43429  chorismate synthase  63.86 
 
 		 442 aa  481  1e-134  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0435185  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4112  chorismate synthase  61.43 
 
 		 363 aa  476  1e-133  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356503  normal  0.0141233 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03041  chorismate synthase  65.18 
 
 		 361 aa  474  1e-133  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.418255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1593  chorismate synthase  64.62 
 
 		 361 aa  470  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.040702  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1623  chorismate synthase  62.26 
 
 		 363 aa  464  9.999999999999999e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0369  chorismate synthase  56.34 
 
 		 360 aa  427  1e-118  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1897  chorismate synthase  59.33 
 
 		 361 aa  423  1e-117  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0823  chorismate synthase  57.58 
 
 		 360 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3438  chorismate synthase  57.58 
 
 		 360 aa  412  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000199375 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5072  chorismate synthase  55.08 
 
 		 359 aa  402  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1510  chorismate synthase  57.7 
 
 		 362 aa  401  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4064  chorismate synthase  54.08 
 
 		 359 aa  396  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000659407  hitchhiker  0.000000405427 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11018  chorismate synthase  54.67 
 
 		 354 aa  395  1e-109  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90939  Chorismate synthase  57.5 
 
 		 377 aa  392  1e-108  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.352684 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3830  chorismate synthase  54.8 
 
 		 358 aa  390  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2149  chorismate synthase  55.4 
 
 		 355 aa  385  1e-106  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0529344  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1952  chorismate synthase  54.52 
 
 		 358 aa  385  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1702  chorismate synthase  51.99 
 
 		 384 aa  383  1e-105  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3801  chorismate synthase  54.24 
 
 		 364 aa  382  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1438  chorismate synthase  55.08 
 
 		 365 aa  380  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4576  chorismate synthase  53.41 
 
 		 352 aa  378  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05731  chorismate synthase (Eurofung)  51.94 
 
 		 410 aa  372  1e-102  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.430078  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02650  chorismate synthase, putative  52.97 
 
 		 421 aa  372  1e-102  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03114  chorismate synthase  51.1 
 
 		 384 aa  369  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0161  chorismate synthase  51.64 
 
 		 373 aa  370  1e-101  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.900075  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002863  chorismate synthase  51.1 
 
 		 361 aa  367  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3150  chorismate synthase  50.67 
 
 		 373 aa  357  1.9999999999999998e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2168  chorismate synthase  48.77 
 
 		 361 aa  357  1.9999999999999998e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1814  chorismate synthase  49.86 
 
 		 367 aa  355  6.999999999999999e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1537  chorismate synthase  48.77 
 
 		 364 aa  353  2e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2159  chorismate synthase  49.45 
 
 		 365 aa  354  2e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2667  chorismate synthase  48.49 
 
 		 364 aa  352  4e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3132  chorismate synthase  50.56 
 
 		 357 aa  352  8.999999999999999e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111802  normal  0.087423 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1538  chorismate synthase  49.58 
 
 		 366 aa  351  1e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02755  chorismate synthase  47.79 
 
 		 365 aa  351  1e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0341392  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1226  chorismate synthase  48.22 
 
 		 366 aa  351  1e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0161922 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4138  chorismate synthase  49.86 
 
 		 370 aa  351  1e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0341634 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2470  chorismate synthase  49.72 
 
 		 361 aa  350  3e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2244  chorismate synthase  48.74 
 
 		 365 aa  350  3e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1568  chorismate synthase  47.9 
 
 		 364 aa  349  4e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1012  chorismate synthase  50.56 
 
 		 366 aa  348  1e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2769  chorismate synthase  47.95 
 
 		 364 aa  347  2e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.116753  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2846  chorismate synthase  47.95 
 
 		 364 aa  347  2e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000803726 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1607  chorismate synthase  47.95 
 
 		 364 aa  347  2e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  normal  0.360545 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1314  chorismate synthase  49.17 
 
 		 361 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2752  chorismate synthase  47.95 
 
 		 364 aa  347  2e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.200726  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1394  chorismate synthase  49.72 
 
 		 362 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187693  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2938  chorismate synthase  49.02 
 
 		 369 aa  346  4e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4081  chorismate synthase  51.13 
 
 		 356 aa  346  4e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1541  chorismate synthase  46.56 
 
 		 366 aa  345  6e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0702  chorismate synthase  49.86 
 
 		 366 aa  345  8e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2811  chorismate synthase  50.82 
 
 		 361 aa  344  1e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.655428  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0858  chorismate synthase  47.77 
 
 		 366 aa  344  2e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.52804e-17  unclonable  0.0000000936669 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0629  chorismate synthase  49.18 
 
 		 368 aa  343  2e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1740  chorismate synthase  47.9 
 
 		 368 aa  344  2e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.544591 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2451  chorismate synthase  47.93 
 
 		 364 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1212  chorismate synthase  48.07 
 
 		 361 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.535517 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0770  chorismate synthase  49.18 
 
 		 366 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.742046  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1018  chorismate synthase  47.62 
 
 		 362 aa  343  2.9999999999999997e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2767  chorismate synthase  46.93 
 
 		 366 aa  342  7e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1360  chorismate synthase  47.49 
 
 		 366 aa  341  1e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767963  normal  0.499065 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1453  chorismate synthase  50.82 
 
 		 361 aa  341  1e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.71846  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1481  chorismate synthase  46.28 
 
 		 369 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.470447  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0946  chorismate synthase  46.28 
 
 		 369 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.718045  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2466  chorismate synthase  47.34 
 
 		 361 aa  340  2e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.358807  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1657  chorismate synthase  46.3 
 
 		 366 aa  340  2e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112196  normal  0.0287757 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1241  chorismate synthase  46.7 
 
 		 366 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1987  chorismate synthase  46.3 
 
 		 366 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2757  chorismate synthase  50.69 
 
 		 366 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0933744 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0762  chorismate synthase  46.28 
 
 		 430 aa  339  4e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0691461  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1205  chorismate synthase  49.17 
 
 		 360 aa  339  4e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0521105  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1947  chorismate synthase  51.55 
 
 		 354 aa  339  5e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1341  chorismate synthase  46.58 
 
 		 366 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1713  chorismate synthase  46.28 
 
 		 369 aa  338  7e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193941  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1867  chorismate synthase  46.28 
 
 		 369 aa  338  7e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0797858  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1689  chorismate synthase  46.28 
 
 		 369 aa  338  7e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.537327  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1868  chorismate synthase  47.79 
 
 		 373 aa  338  8e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.423516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0846  chorismate synthase  47.12 
 
 		 371 aa  338  8e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.742224 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2091  chorismate synthase  46.01 
 
 		 371 aa  338  8e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2416  chorismate synthase  49.86 
 
 		 364 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0401  chorismate synthase  46.28 
 
 		 369 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2222  chorismate synthase  47.49 
 
 		 352 aa  338  9.999999999999999e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2797  chorismate synthase  46.69 
 
 		 368 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>