More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0260 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1340  chorismate synthase  94.91 
 
 		 386 aa  677    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0260  chorismate synthase  100 
 
 		 373 aa  747    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0578  chorismate synthase  93.03 
 
 		 373 aa  665    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.778585  normal  0.127119 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0644  chorismate synthase  73.19 
 
 		 377 aa  581  1.0000000000000001e-165  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0689  chorismate synthase  70.32 
 
 		 373 aa  551  1e-156  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0139341  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1438  chorismate synthase  51.89 
 
 		 365 aa  394  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1012  chorismate synthase  50.94 
 
 		 366 aa  375  1e-103  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0161  chorismate synthase  49.18 
 
 		 373 aa  377  1e-103  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.900075  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0547  chorismate synthase  45.97 
 
 		 365 aa  343  2e-93  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1623  chorismate synthase  45.56 
 
 		 363 aa  338  9e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3830  chorismate synthase  46.7 
 
 		 358 aa  331  1e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3801  chorismate synthase  45.88 
 
 		 364 aa  328  8e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4112  chorismate synthase  43.84 
 
 		 363 aa  328  1.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356503  normal  0.0141233 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0369  chorismate synthase  45.28 
 
 		 360 aa  326  5e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11018  chorismate synthase  47.11 
 
 		 354 aa  323  3e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1664  chorismate synthase  46.05 
 
 		 362 aa  322  7e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1637  chorismate synthase  46.05 
 
 		 362 aa  322  7e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4576  chorismate synthase  47.66 
 
 		 352 aa  321  9.999999999999999e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1296  chorismate synthase  45.63 
 
 		 334 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.576188  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0212  chorismate synthase  45.33 
 
 		 362 aa  318  9e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.468689 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1952  chorismate synthase  44.78 
 
 		 358 aa  318  1e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3132  chorismate synthase  46.28 
 
 		 357 aa  316  3e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111802  normal  0.087423 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0439  chorismate synthase  44.17 
 
 		 364 aa  317  3e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.178344  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2355  chorismate synthase  44.23 
 
 		 362 aa  316  5e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02461  chorismate synthase  45.84 
 
 		 365 aa  315  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0589  chorismate synthase  45.05 
 
 		 362 aa  313  1.9999999999999998e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3093  chorismate synthase  49.71 
 
 		 367 aa  312  4.999999999999999e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000101466  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02561  chorismate synthase  46.03 
 
 		 364 aa  311  1e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.46541  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1361  chorismate synthase  43.53 
 
 		 362 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.565895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1564  chorismate synthase  47.66 
 
 		 328 aa  310  2e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0226  chorismate synthase  45.9 
 
 		 365 aa  310  2.9999999999999997e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2171  chorismate synthase  43.56 
 
 		 359 aa  309  5.9999999999999995e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1538  chorismate synthase  47.24 
 
 		 366 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02451  chorismate synthase  45.04 
 
 		 365 aa  308  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.642724  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_405  chorismate synthase  42.82 
 
 		 364 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.09813  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1568  chorismate synthase  45.58 
 
 		 364 aa  305  7e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2797  chorismate synthase  44.93 
 
 		 368 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1394  chorismate synthase  44.59 
 
 		 362 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187693  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5072  chorismate synthase  43.41 
 
 		 359 aa  303  2.0000000000000002e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1541  chorismate synthase  45.15 
 
 		 366 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1212  chorismate synthase  44.05 
 
 		 361 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.535517 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1314  chorismate synthase  43.51 
 
 		 361 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2466  chorismate synthase  43.61 
 
 		 361 aa  301  9e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.358807  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0462  chorismate synthase  42.01 
 
 		 364 aa  301  1e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.282213  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2470  chorismate synthase  43.24 
 
 		 361 aa  301  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2866  chorismate synthase  45.6 
 
 		 370 aa  301  1e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02755  chorismate synthase  42.9 
 
 		 365 aa  300  2e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0341392  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0835  chorismate synthase  43.99 
 
 		 362 aa  300  3e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0823  chorismate synthase  41.03 
 
 		 360 aa  300  3e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2938  chorismate synthase  43.13 
 
 		 369 aa  300  3e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05731  chorismate synthase (Eurofung)  40.31 
 
 		 410 aa  300  4e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.430078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4064  chorismate synthase  43.29 
 
 		 359 aa  300  4e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000659407  hitchhiker  0.000000405427 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2168  chorismate synthase  43.44 
 
 		 361 aa  299  5e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02471  chorismate synthase  43.68 
 
 		 363 aa  298  8e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2251  chorismate synthase  44.78 
 
 		 352 aa  298  8e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2149  chorismate synthase  42.82 
 
 		 355 aa  298  1e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0529344  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3438  chorismate synthase  40.22 
 
 		 360 aa  298  1e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000199375 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2222  chorismate synthase  45.05 
 
 		 352 aa  297  2e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1537  chorismate synthase  43.17 
 
 		 364 aa  297  2e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2159  chorismate synthase  44.08 
 
 		 365 aa  297  2e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0846  chorismate synthase  43.97 
 
 		 371 aa  296  3e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.742224 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2819  chorismate synthase  43.01 
 
 		 370 aa  296  3e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0159117  normal  0.634482 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2667  chorismate synthase  44.63 
 
 		 364 aa  296  4e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1510  chorismate synthase  44.08 
 
 		 362 aa  296  5e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2091  chorismate synthase  45.86 
 
 		 371 aa  295  6e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2451  chorismate synthase  43.99 
 
 		 364 aa  295  8e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3619  chorismate synthase  43.29 
 
 		 361 aa  295  8e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000281464  normal  0.087707 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2769  chorismate synthase  43.99 
 
 		 364 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.116753  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1607  chorismate synthase  43.99 
 
 		 364 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  normal  0.360545 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4138  chorismate synthase  42.43 
 
 		 370 aa  295  1e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0341634 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2752  chorismate synthase  43.99 
 
 		 364 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.200726  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2846  chorismate synthase  43.99 
 
 		 364 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000803726 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1408  chorismate synthase  42.32 
 
 		 353 aa  295  1e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.422248 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0041  chorismate synthase  42.82 
 
 		 351 aa  294  1e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0022126  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4332  chorismate synthase  44.38 
 
 		 366 aa  293  3e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.259213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0629  chorismate synthase  42.78 
 
 		 368 aa  292  7e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03114  chorismate synthase  43.05 
 
 		 384 aa  291  1e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0770  chorismate synthase  42.11 
 
 		 366 aa  291  2e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.742046  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4081  chorismate synthase  42.86 
 
 		 356 aa  291  2e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2023  chorismate synthase  45.36 
 
 		 358 aa  290  3e-77  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1142  chorismate synthase  42.43 
 
 		 362 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  0.271094 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1360  chorismate synthase  43.89 
 
 		 366 aa  289  4e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767963  normal  0.499065 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4957  chorismate synthase  43.77 
 
 		 389 aa  289  5.0000000000000004e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0858  chorismate synthase  44.51 
 
 		 366 aa  289  6e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.52804e-17  unclonable  0.0000000936669 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43429  chorismate synthase  41.89 
 
 		 442 aa  289  7e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0435185  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1897  chorismate synthase  40.44 
 
 		 361 aa  288  8e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002863  chorismate synthase  43.05 
 
 		 361 aa  288  1e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0702  chorismate synthase  44.04 
 
 		 366 aa  288  1e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1702  chorismate synthase  42.36 
 
 		 384 aa  288  1e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3275  chorismate synthase  42.32 
 
 		 367 aa  287  2e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1282  chorismate synthase  43.51 
 
 		 391 aa  287  2e-76  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1257  chorismate synthase  46.01 
 
 		 370 aa  287  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.234528  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1974  chorismate synthase  45.21 
 
 		 358 aa  287  2e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0659  chorismate synthase  46.98 
 
 		 358 aa  287  2e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.463158  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1205  chorismate synthase  44.63 
 
 		 360 aa  287  2e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0521105  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1226  chorismate synthase  42.15 
 
 		 366 aa  287  2e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0161922 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2767  chorismate synthase  43.89 
 
 		 366 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1657  chorismate synthase  45.15 
 
 		 366 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112196  normal  0.0287757 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1987  chorismate synthase  45.15 
 
 		 366 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2090  chorismate synthase  40.82 
 
 		 354 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0281395  normal  0.0647066 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>