More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0212 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0212  chorismate synthase  100 
 
 		 362 aa  738    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.468689 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1637  chorismate synthase  80.39 
 
 		 362 aa  595  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1664  chorismate synthase  80.39 
 
 		 362 aa  595  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0589  chorismate synthase  80.78 
 
 		 362 aa  587  1e-167  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2355  chorismate synthase  81.34 
 
 		 362 aa  585  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0835  chorismate synthase  79.11 
 
 		 362 aa  565  1e-160  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2866  chorismate synthase  77.78 
 
 		 370 aa  562  1.0000000000000001e-159  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1361  chorismate synthase  77.99 
 
 		 362 aa  560  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.565895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02471  chorismate synthase  70.17 
 
 		 363 aa  531  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2040  chorismate synthase  73.9 
 
 		 364 aa  529  1e-149  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0304  chorismate synthase  73.63 
 
 		 366 aa  528  1e-149  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.21806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23791  chorismate synthase  70.44 
 
 		 362 aa  520  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0240204 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02561  chorismate synthase  65.65 
 
 		 364 aa  506  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.46541  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43429  chorismate synthase  69.32 
 
 		 442 aa  505  9.999999999999999e-143  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0435185  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02461  chorismate synthase  65.56 
 
 		 365 aa  505  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0226  chorismate synthase  65.56 
 
 		 365 aa  504  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29930  predicted protein  69.34 
 
 		 458 aa  503  1e-141  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02451  chorismate synthase  65.83 
 
 		 365 aa  503  1e-141  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.642724  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4112  chorismate synthase  66.67 
 
 		 363 aa  502  1e-141  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356503  normal  0.0141233 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03041  chorismate synthase  69.44 
 
 		 361 aa  503  1e-141  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.418255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1593  chorismate synthase  69.08 
 
 		 361 aa  499  1e-140  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.040702  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1623  chorismate synthase  63.81 
 
 		 363 aa  458  9.999999999999999e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0369  chorismate synthase  57.98 
 
 		 360 aa  442  1e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1897  chorismate synthase  62.5 
 
 		 361 aa  426  1e-118  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0823  chorismate synthase  59.66 
 
 		 360 aa  418  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3438  chorismate synthase  59.94 
 
 		 360 aa  420  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000199375 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4064  chorismate synthase  58.26 
 
 		 359 aa  419  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000659407  hitchhiker  0.000000405427 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5072  chorismate synthase  58.76 
 
 		 359 aa  406  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90939  Chorismate synthase  59.08 
 
 		 377 aa  402  1e-111  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.352684 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1510  chorismate synthase  57.73 
 
 		 362 aa  397  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1702  chorismate synthase  53.7 
 
 		 384 aa  393  1e-108  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2149  chorismate synthase  56.25 
 
 		 355 aa  392  1e-108  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0529344  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3801  chorismate synthase  55.4 
 
 		 364 aa  391  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11018  chorismate synthase  53.8 
 
 		 354 aa  387  1e-106  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02650  chorismate synthase, putative  54.11 
 
 		 421 aa  386  1e-106  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05731  chorismate synthase (Eurofung)  53.89 
 
 		 410 aa  384  1e-105  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.430078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4576  chorismate synthase  53.69 
 
 		 352 aa  384  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1952  chorismate synthase  54.08 
 
 		 358 aa  378  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3830  chorismate synthase  53.52 
 
 		 358 aa  375  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0161  chorismate synthase  53.8 
 
 		 373 aa  376  1e-103  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.900075  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1438  chorismate synthase  55.21 
 
 		 365 aa  373  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1018  chorismate synthase  51.26 
 
 		 362 aa  362  4e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1541  chorismate synthase  50.14 
 
 		 366 aa  362  6e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002863  chorismate synthase  50.98 
 
 		 361 aa  360  3e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03114  chorismate synthase  50.7 
 
 		 384 aa  358  8e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4081  chorismate synthase  53.93 
 
 		 356 aa  358  9.999999999999999e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3132  chorismate synthase  52.25 
 
 		 357 aa  356  3.9999999999999996e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111802  normal  0.087423 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02755  chorismate synthase  49.18 
 
 		 365 aa  355  8.999999999999999e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0341392  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1640  chorismate synthase  50.98 
 
 		 363 aa  354  1e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503125 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1972  chorismate synthase  50.98 
 
 		 363 aa  354  1e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2168  chorismate synthase  49.58 
 
 		 361 aa  354  1e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3150  chorismate synthase  50.69 
 
 		 373 aa  353  4e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2091  chorismate synthase  48.46 
 
 		 371 aa  351  1e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1341  chorismate synthase  50.56 
 
 		 366 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2159  chorismate synthase  49.58 
 
 		 365 aa  350  2e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0978  chorismate synthase  50.28 
 
 		 366 aa  348  6e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1460  chorismate synthase  50.28 
 
 		 366 aa  348  6e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1537  chorismate synthase  49.3 
 
 		 364 aa  348  9e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1394  chorismate synthase  51.38 
 
 		 362 aa  348  9e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187693  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1438  chorismate synthase  50.28 
 
 		 366 aa  347  1e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4605  chorismate synthase  50 
 
 		 366 aa  347  2e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0590951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1538  chorismate synthase  49.3 
 
 		 366 aa  347  2e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2811  chorismate synthase  52.23 
 
 		 361 aa  347  2e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.655428  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1789  chorismate synthase  50 
 
 		 366 aa  347  2e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2244  chorismate synthase  48.74 
 
 		 365 aa  347  2e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1381  chorismate synthase  50.56 
 
 		 366 aa  346  3e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.674702 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1607  chorismate synthase  49.3 
 
 		 364 aa  346  3e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  normal  0.360545 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2470  chorismate synthase  50.28 
 
 		 361 aa  346  4e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0946  chorismate synthase  49.44 
 
 		 369 aa  346  4e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.718045  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2938  chorismate synthase  50.7 
 
 		 369 aa  346  4e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1481  chorismate synthase  49.44 
 
 		 369 aa  346  4e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.470447  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1360  chorismate synthase  49.72 
 
 		 366 aa  346  4e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767963  normal  0.499065 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0762  chorismate synthase  49.44 
 
 		 430 aa  345  5e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0691461  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2752  chorismate synthase  49.02 
 
 		 364 aa  345  6e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.200726  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2846  chorismate synthase  49.02 
 
 		 364 aa  345  6e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000803726 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2769  chorismate synthase  49.02 
 
 		 364 aa  345  6e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.116753  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2767  chorismate synthase  49.16 
 
 		 366 aa  345  8e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1568  chorismate synthase  49.02 
 
 		 364 aa  345  8.999999999999999e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1212  chorismate synthase  50.28 
 
 		 361 aa  344  1e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.535517 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1867  chorismate synthase  49.16 
 
 		 369 aa  343  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0797858  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1713  chorismate synthase  49.16 
 
 		 369 aa  343  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193941  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1226  chorismate synthase  49.58 
 
 		 366 aa  343  2e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0161922 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1689  chorismate synthase  49.16 
 
 		 369 aa  343  2e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.537327  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1814  chorismate synthase  50.7 
 
 		 367 aa  343  2.9999999999999997e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1453  chorismate synthase  52.51 
 
 		 361 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.71846  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2614  chorismate synthase  49.16 
 
 		 369 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2451  chorismate synthase  49.02 
 
 		 364 aa  343  4e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2251  chorismate synthase  49.72 
 
 		 352 aa  343  4e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2222  chorismate synthase  49.44 
 
 		 352 aa  342  4e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1569  chorismate synthase  48.88 
 
 		 366 aa  342  5e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1076  chorismate synthase  49.58 
 
 		 352 aa  342  5e-93  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.306004  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1205  chorismate synthase  51.1 
 
 		 360 aa  342  5e-93  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0521105  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0401  chorismate synthase  49.16 
 
 		 369 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0938  chorismate synthase  49.58 
 
 		 352 aa  342  5.999999999999999e-93  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.464022  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1241  chorismate synthase  49.72 
 
 		 366 aa  342  7e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1525  chorismate synthase  48.6 
 
 		 385 aa  341  9e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0632175 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0702  chorismate synthase  50.42 
 
 		 366 aa  341  1e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2667  chorismate synthase  48.74 
 
 		 364 aa  341  1e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1257  chorismate synthase  50.84 
 
 		 370 aa  340  2e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.234528  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1740  chorismate synthase  49.3 
 
 		 368 aa  339  2.9999999999999998e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.544591 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>