More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_90939 on replicon NC_009047
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009047  PICST_90939  Chorismate synthase  100 
 
 		 377 aa  779    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.352684 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05731  chorismate synthase (Eurofung)  65.99 
 
 		 410 aa  526  1e-148  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.430078  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02650  chorismate synthase, putative  63.8 
 
 		 421 aa  499  1e-140  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0823  chorismate synthase  61.04 
 
 		 360 aa  448  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3438  chorismate synthase  61.58 
 
 		 360 aa  444  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000199375 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0212  chorismate synthase  59.08 
 
 		 362 aa  411  1e-113  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.468689 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02461  chorismate synthase  54.18 
 
 		 365 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2355  chorismate synthase  58.01 
 
 		 362 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02561  chorismate synthase  55.53 
 
 		 364 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.46541  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02451  chorismate synthase  55.04 
 
 		 365 aa  402  1e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.642724  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1664  chorismate synthase  57.22 
 
 		 362 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1623  chorismate synthase  57.22 
 
 		 363 aa  402  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0226  chorismate synthase  54.18 
 
 		 365 aa  401  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1637  chorismate synthase  57.22 
 
 		 362 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0589  chorismate synthase  56.08 
 
 		 362 aa  393  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2866  chorismate synthase  57.5 
 
 		 370 aa  393  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43429  chorismate synthase  55.68 
 
 		 442 aa  394  1e-108  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0435185  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02471  chorismate synthase  55.31 
 
 		 363 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1361  chorismate synthase  55.59 
 
 		 362 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.565895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29930  predicted protein  56.79 
 
 		 458 aa  388  1e-107  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03041  chorismate synthase  55.86 
 
 		 361 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.418255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4112  chorismate synthase  54.52 
 
 		 363 aa  385  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356503  normal  0.0141233 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23791  chorismate synthase  56.1 
 
 		 362 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0240204 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0369  chorismate synthase  53.01 
 
 		 360 aa  385  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1593  chorismate synthase  55.31 
 
 		 361 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.040702  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0835  chorismate synthase  56.91 
 
 		 362 aa  382  1e-105  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2040  chorismate synthase  56.76 
 
 		 364 aa  375  1e-103  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0304  chorismate synthase  55.41 
 
 		 366 aa  371  1e-101  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.21806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2149  chorismate synthase  51.51 
 
 		 355 aa  358  6e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0529344  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11018  chorismate synthase  50.41 
 
 		 354 aa  357  1.9999999999999998e-97  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1897  chorismate synthase  51.62 
 
 		 361 aa  348  6e-95  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4064  chorismate synthase  50.55 
 
 		 359 aa  347  3e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000659407  hitchhiker  0.000000405427 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5072  chorismate synthase  50.55 
 
 		 359 aa  345  8.999999999999999e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4576  chorismate synthase  49.04 
 
 		 352 aa  345  8.999999999999999e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1510  chorismate synthase  50.27 
 
 		 362 aa  343  4e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0161  chorismate synthase  47.73 
 
 		 373 aa  332  6e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.900075  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1438  chorismate synthase  47.09 
 
 		 365 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3830  chorismate synthase  46.99 
 
 		 358 aa  315  8e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1952  chorismate synthase  46.3 
 
 		 358 aa  311  1e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02755  chorismate synthase  43.78 
 
 		 365 aa  310  2e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0341392  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3801  chorismate synthase  47.12 
 
 		 364 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2168  chorismate synthase  43.51 
 
 		 361 aa  299  6e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1012  chorismate synthase  43.53 
 
 		 366 aa  299  7e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002863  chorismate synthase  45.14 
 
 		 361 aa  297  2e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1702  chorismate synthase  44.56 
 
 		 384 aa  296  4e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03114  chorismate synthase  44.86 
 
 		 384 aa  295  7e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1205  chorismate synthase  44.96 
 
 		 360 aa  293  2e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0521105  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2159  chorismate synthase  43.32 
 
 		 365 aa  293  2e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2938  chorismate synthase  42.78 
 
 		 369 aa  292  7e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1541  chorismate synthase  41.73 
 
 		 366 aa  292  7e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3150  chorismate synthase  44.32 
 
 		 373 aa  291  1e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1640  chorismate synthase  42.7 
 
 		 363 aa  291  2e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503125 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1972  chorismate synthase  42.7 
 
 		 363 aa  291  2e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1018  chorismate synthase  43.78 
 
 		 362 aa  290  3e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1538  chorismate synthase  41.14 
 
 		 366 aa  289  4e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0439  chorismate synthase  42.31 
 
 		 364 aa  290  4e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.178344  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0462  chorismate synthase  42.58 
 
 		 364 aa  288  2e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.282213  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0547  chorismate synthase  43.17 
 
 		 365 aa  287  2e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0644  chorismate synthase  41.8 
 
 		 377 aa  286  5e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0689  chorismate synthase  41.26 
 
 		 373 aa  285  9e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0139341  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_405  chorismate synthase  42.31 
 
 		 364 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.09813  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1537  chorismate synthase  42.01 
 
 		 364 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2466  chorismate synthase  41.73 
 
 		 361 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.358807  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1226  chorismate synthase  41.96 
 
 		 366 aa  283  3.0000000000000004e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0161922 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0041  chorismate synthase  45.58 
 
 		 351 aa  283  3.0000000000000004e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0022126  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2752  chorismate synthase  42.23 
 
 		 364 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.200726  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2769  chorismate synthase  42.23 
 
 		 364 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.116753  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2846  chorismate synthase  42.23 
 
 		 364 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000803726 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1607  chorismate synthase  42.23 
 
 		 364 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  normal  0.360545 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1114  chorismate synthase  42.2 
 
 		 395 aa  283  5.000000000000001e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4081  chorismate synthase  44.26 
 
 		 356 aa  282  5.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1568  chorismate synthase  41.42 
 
 		 364 aa  282  7.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2090  chorismate synthase  43.84 
 
 		 354 aa  282  8.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0281395  normal  0.0647066 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0938  chorismate synthase  43.32 
 
 		 352 aa  280  2e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.464022  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1076  chorismate synthase  43.32 
 
 		 352 aa  280  2e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.306004  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0858  chorismate synthase  41.42 
 
 		 366 aa  280  3e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.52804e-17  unclonable  0.0000000936669 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1241  chorismate synthase  42.86 
 
 		 366 aa  280  3e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2667  chorismate synthase  41.96 
 
 		 364 aa  280  3e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3132  chorismate synthase  43.67 
 
 		 357 aa  280  3e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111802  normal  0.087423 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2451  chorismate synthase  41.96 
 
 		 364 aa  280  4e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2251  chorismate synthase  42.51 
 
 		 352 aa  279  6e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2222  chorismate synthase  42.23 
 
 		 352 aa  279  6e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3093  chorismate synthase  45.35 
 
 		 367 aa  278  1e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000101466  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3074  chorismate synthase  40.6 
 
 		 376 aa  278  1e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1514  chorismate synthase  44.41 
 
 		 361 aa  278  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.85122  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1405  chorismate synthase  44.41 
 
 		 361 aa  278  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.47258  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0377  chorismate synthase  44.41 
 
 		 361 aa  278  1e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0762  chorismate synthase  42.59 
 
 		 430 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0691461  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1713  chorismate synthase  42.59 
 
 		 369 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193941  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0401  chorismate synthase  42.59 
 
 		 369 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1481  chorismate synthase  42.59 
 
 		 369 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.470447  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0946  chorismate synthase  42.59 
 
 		 369 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.718045  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1867  chorismate synthase  42.59 
 
 		 369 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0797858  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1689  chorismate synthase  42.59 
 
 		 369 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.537327  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2614  chorismate synthase  42.59 
 
 		 369 aa  277  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2091  chorismate synthase  39.68 
 
 		 371 aa  277  2e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1360  chorismate synthase  41.69 
 
 		 366 aa  277  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767963  normal  0.499065 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1814  chorismate synthase  42.01 
 
 		 367 aa  276  3e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1740  chorismate synthase  41.73 
 
 		 368 aa  276  3e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.544591 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1789  chorismate synthase  41.69 
 
 		 366 aa  276  6e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681987  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>