More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4064 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4064  chorismate synthase  100 
 
 		 359 aa  743    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000659407  hitchhiker  0.000000405427 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5072  chorismate synthase  80.5 
 
 		 359 aa  584  1e-166  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0369  chorismate synthase  71.03 
 
 		 360 aa  547  1e-155  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11018  chorismate synthase  65.92 
 
 		 354 aa  491  1e-137  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2149  chorismate synthase  66.01 
 
 		 355 aa  490  1e-137  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0529344  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4576  chorismate synthase  65.35 
 
 		 352 aa  482  1e-135  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1510  chorismate synthase  64.27 
 
 		 362 aa  463  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4112  chorismate synthase  56.55 
 
 		 363 aa  435  1e-121  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356503  normal  0.0141233 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2355  chorismate synthase  58.87 
 
 		 362 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0212  chorismate synthase  58.26 
 
 		 362 aa  424  1e-117  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.468689 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1623  chorismate synthase  56.62 
 
 		 363 aa  422  1e-117  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0835  chorismate synthase  58.87 
 
 		 362 aa  420  1e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1637  chorismate synthase  57.63 
 
 		 362 aa  420  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1664  chorismate synthase  57.63 
 
 		 362 aa  420  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1361  chorismate synthase  56.58 
 
 		 362 aa  415  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.565895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0589  chorismate synthase  56.34 
 
 		 362 aa  411  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02471  chorismate synthase  55.06 
 
 		 363 aa  413  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23791  chorismate synthase  56.18 
 
 		 362 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0240204 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2040  chorismate synthase  57.54 
 
 		 364 aa  407  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0304  chorismate synthase  57.26 
 
 		 366 aa  405  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.21806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0226  chorismate synthase  52.79 
 
 		 365 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02461  chorismate synthase  51.96 
 
 		 365 aa  402  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02561  chorismate synthase  53.07 
 
 		 364 aa  403  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.46541  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02451  chorismate synthase  52.23 
 
 		 365 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.642724  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03041  chorismate synthase  55.62 
 
 		 361 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.418255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1593  chorismate synthase  55.34 
 
 		 361 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.040702  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2866  chorismate synthase  54.08 
 
 		 370 aa  395  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29930  predicted protein  57.06 
 
 		 458 aa  393  1e-108  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1952  chorismate synthase  52.51 
 
 		 358 aa  394  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3801  chorismate synthase  51.96 
 
 		 364 aa  390  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3830  chorismate synthase  51.68 
 
 		 358 aa  389  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4081  chorismate synthase  55.59 
 
 		 356 aa  389  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1972  chorismate synthase  54.49 
 
 		 363 aa  384  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1640  chorismate synthase  54.49 
 
 		 363 aa  384  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503125 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1568  chorismate synthase  54.08 
 
 		 364 aa  384  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1541  chorismate synthase  54.93 
 
 		 366 aa  382  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43429  chorismate synthase  55.9 
 
 		 442 aa  380  1e-104  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0435185  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1897  chorismate synthase  53.89 
 
 		 361 aa  378  1e-103  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3438  chorismate synthase  53.89 
 
 		 360 aa  376  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000199375 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0161  chorismate synthase  50.54 
 
 		 373 aa  377  1e-103  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.900075  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2244  chorismate synthase  52.25 
 
 		 365 aa  370  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1438  chorismate synthase  51.12 
 
 		 365 aa  369  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2938  chorismate synthase  51.81 
 
 		 369 aa  370  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2091  chorismate synthase  52.39 
 
 		 371 aa  369  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0823  chorismate synthase  53.07 
 
 		 360 aa  370  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2466  chorismate synthase  51.4 
 
 		 361 aa  369  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.358807  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1241  chorismate synthase  51.97 
 
 		 366 aa  368  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002863  chorismate synthase  52.11 
 
 		 361 aa  366  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1657  chorismate synthase  53.09 
 
 		 366 aa  368  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112196  normal  0.0287757 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1987  chorismate synthase  53.09 
 
 		 366 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03114  chorismate synthase  51.83 
 
 		 384 aa  365  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1740  chorismate synthase  51.83 
 
 		 368 aa  366  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.544591 
 
 
-
 
NC_002950  PG1314  chorismate synthase  54.34 
 
 		 368 aa  363  2e-99  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0702  chorismate synthase  52.39 
 
 		 366 aa  363  2e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1789  chorismate synthase  53.65 
 
 		 366 aa  363  2e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1538  chorismate synthase  51.4 
 
 		 366 aa  362  4e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0762  chorismate synthase  52.53 
 
 		 430 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0691461  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1226  chorismate synthase  50 
 
 		 366 aa  362  6e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0161922 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0401  chorismate synthase  52.53 
 
 		 369 aa  361  8e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1481  chorismate synthase  52.53 
 
 		 369 aa  361  9e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.470447  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0946  chorismate synthase  52.53 
 
 		 369 aa  361  9e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.718045  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1381  chorismate synthase  52.81 
 
 		 366 aa  361  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.674702 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0978  chorismate synthase  53.37 
 
 		 366 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1460  chorismate synthase  53.37 
 
 		 366 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1702  chorismate synthase  50.13 
 
 		 384 aa  361  1e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2797  chorismate synthase  50.42 
 
 		 368 aa  360  2e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1341  chorismate synthase  53.37 
 
 		 366 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4605  chorismate synthase  53.09 
 
 		 366 aa  359  4e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0590951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02755  chorismate synthase  51.69 
 
 		 365 aa  358  5e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0341392  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1814  chorismate synthase  51.97 
 
 		 367 aa  359  5e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2168  chorismate synthase  51.83 
 
 		 361 aa  358  7e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1438  chorismate synthase  53.09 
 
 		 366 aa  358  8e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1689  chorismate synthase  52.25 
 
 		 369 aa  358  8e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.537327  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1867  chorismate synthase  52.25 
 
 		 369 aa  358  8e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0797858  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1713  chorismate synthase  52.25 
 
 		 369 aa  358  8e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193941  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0858  chorismate synthase  50.56 
 
 		 366 aa  358  9e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.52804e-17  unclonable  0.0000000936669 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1833  chorismate synthase  54.65 
 
 		 365 aa  358  9e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.306795  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1394  chorismate synthase  50.97 
 
 		 362 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187693  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0846  chorismate synthase  49.58 
 
 		 371 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.742224 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3132  chorismate synthase  49.44 
 
 		 357 aa  357  1.9999999999999998e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111802  normal  0.087423 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2614  chorismate synthase  51.69 
 
 		 369 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1360  chorismate synthase  52.53 
 
 		 366 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767963  normal  0.499065 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3619  chorismate synthase  51.52 
 
 		 361 aa  357  2.9999999999999997e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000281464  normal  0.087707 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3150  chorismate synthase  51.25 
 
 		 373 aa  356  3.9999999999999996e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3093  chorismate synthase  54.35 
 
 		 367 aa  356  3.9999999999999996e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000101466  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05731  chorismate synthase (Eurofung)  50.92 
 
 		 410 aa  354  1e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.430078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1142  chorismate synthase  49.86 
 
 		 362 aa  354  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  0.271094 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1958  chorismate synthase  52.1 
 
 		 393 aa  353  2e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1212  chorismate synthase  49.86 
 
 		 361 aa  354  2e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.535517 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4138  chorismate synthase  48.88 
 
 		 370 aa  354  2e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0341634 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1699  chorismate synthase  53.8 
 
 		 361 aa  353  2e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2470  chorismate synthase  50.14 
 
 		 361 aa  353  2e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1569  chorismate synthase  52.81 
 
 		 366 aa  353  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0547  chorismate synthase  49.72 
 
 		 365 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2767  chorismate synthase  51.69 
 
 		 366 aa  353  4e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3074  chorismate synthase  50.42 
 
 		 376 aa  352  8e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0770  chorismate synthase  49.45 
 
 		 366 aa  351  1e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.742046  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1537  chorismate synthase  50.84 
 
 		 364 aa  350  2e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90939  Chorismate synthase  50.55 
 
 		 377 aa  349  4e-95  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.352684 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1314  chorismate synthase  49.03 
 
 		 361 aa  349  4e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>