More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_2149 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_2149  chorismate synthase  100 
 
 		 355 aa  734    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0529344  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4576  chorismate synthase  76.57 
 
 		 352 aa  561  1.0000000000000001e-159  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11018  chorismate synthase  73.94 
 
 		 354 aa  554  1e-156  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0369  chorismate synthase  66.86 
 
 		 360 aa  485  1e-136  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5072  chorismate synthase  67.43 
 
 		 359 aa  475  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4064  chorismate synthase  66.01 
 
 		 359 aa  473  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000659407  hitchhiker  0.000000405427 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1510  chorismate synthase  62.81 
 
 		 362 aa  441  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1623  chorismate synthase  58 
 
 		 363 aa  419  1e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4112  chorismate synthase  55.46 
 
 		 363 aa  400  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356503  normal  0.0141233 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0212  chorismate synthase  56.25 
 
 		 362 aa  387  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.468689 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2466  chorismate synthase  52.66 
 
 		 361 aa  385  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.358807  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02461  chorismate synthase  51.98 
 
 		 365 aa  382  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1637  chorismate synthase  55.52 
 
 		 362 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1814  chorismate synthase  53.35 
 
 		 367 aa  381  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02561  chorismate synthase  52.57 
 
 		 364 aa  382  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.46541  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1361  chorismate synthase  55.08 
 
 		 362 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.565895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2355  chorismate synthase  56.37 
 
 		 362 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0304  chorismate synthase  57.46 
 
 		 366 aa  384  1e-105  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.21806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1538  chorismate synthase  54.11 
 
 		 366 aa  383  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1664  chorismate synthase  55.52 
 
 		 362 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23791  chorismate synthase  54.83 
 
 		 362 aa  378  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0240204 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02451  chorismate synthase  51.41 
 
 		 365 aa  378  1e-104  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.642724  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2040  chorismate synthase  56.9 
 
 		 364 aa  380  1e-104  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0226  chorismate synthase  51.13 
 
 		 365 aa  378  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0589  chorismate synthase  54.55 
 
 		 362 aa  375  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02471  chorismate synthase  51.99 
 
 		 363 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1537  chorismate synthase  52.38 
 
 		 364 aa  375  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2137  chorismate synthase  55.87 
 
 		 361 aa  373  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.146002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1541  chorismate synthase  50.84 
 
 		 366 aa  374  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2866  chorismate synthase  55.4 
 
 		 370 aa  371  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1568  chorismate synthase  52.69 
 
 		 364 aa  373  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1640  chorismate synthase  52.23 
 
 		 363 aa  371  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503125 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1593  chorismate synthase  52.68 
 
 		 361 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.040702  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2938  chorismate synthase  52.51 
 
 		 369 aa  369  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2091  chorismate synthase  52.69 
 
 		 371 aa  369  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1972  chorismate synthase  52.23 
 
 		 363 aa  371  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1226  chorismate synthase  51.69 
 
 		 366 aa  371  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0161922 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0835  chorismate synthase  54.83 
 
 		 362 aa  369  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03041  chorismate synthase  53.24 
 
 		 361 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.418255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1241  chorismate synthase  51.56 
 
 		 366 aa  365  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002863  chorismate synthase  52.54 
 
 		 361 aa  365  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1569  chorismate synthase  51.84 
 
 		 366 aa  365  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1360  chorismate synthase  52.12 
 
 		 366 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767963  normal  0.499065 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02755  chorismate synthase  50.7 
 
 		 365 aa  367  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0341392  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2667  chorismate synthase  51.12 
 
 		 364 aa  367  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2244  chorismate synthase  51.4 
 
 		 365 aa  367  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1018  chorismate synthase  52.41 
 
 		 362 aa  364  1e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0702  chorismate synthase  51.96 
 
 		 366 aa  363  2e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2767  chorismate synthase  51.56 
 
 		 366 aa  363  2e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2159  chorismate synthase  51.56 
 
 		 365 aa  363  2e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1740  chorismate synthase  50.84 
 
 		 368 aa  363  3e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.544591 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03114  chorismate synthase  51.56 
 
 		 384 aa  362  5.0000000000000005e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2168  chorismate synthase  50.85 
 
 		 361 aa  362  5.0000000000000005e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43429  chorismate synthase  52.65 
 
 		 442 aa  360  2e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0435185  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1607  chorismate synthase  50.56 
 
 		 364 aa  359  3e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  normal  0.360545 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2846  chorismate synthase  50.56 
 
 		 364 aa  360  3e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000803726 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2752  chorismate synthase  50.56 
 
 		 364 aa  360  3e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.200726  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29930  predicted protein  52.49 
 
 		 458 aa  360  3e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2769  chorismate synthase  50.56 
 
 		 364 aa  360  3e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.116753  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1789  chorismate synthase  51.56 
 
 		 366 aa  359  4e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4605  chorismate synthase  51.84 
 
 		 366 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0590951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0978  chorismate synthase  51.84 
 
 		 366 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1460  chorismate synthase  51.84 
 
 		 366 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1314  chorismate synthase  55.08 
 
 		 368 aa  357  1.9999999999999998e-97  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1438  chorismate synthase  51.56 
 
 		 366 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2451  chorismate synthase  50.56 
 
 		 364 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1341  chorismate synthase  51.84 
 
 		 366 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3374  chorismate synthase  53.67 
 
 		 361 aa  357  1.9999999999999998e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1381  chorismate synthase  51.56 
 
 		 366 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.674702 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3438  chorismate synthase  53.2 
 
 		 360 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000199375 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1657  chorismate synthase  50.99 
 
 		 366 aa  355  5.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112196  normal  0.0287757 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0762  chorismate synthase  50.99 
 
 		 430 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0691461  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0858  chorismate synthase  50.71 
 
 		 366 aa  355  6.999999999999999e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.52804e-17  unclonable  0.0000000936669 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1689  chorismate synthase  50.99 
 
 		 369 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.537327  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1867  chorismate synthase  50.99 
 
 		 369 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0797858  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1713  chorismate synthase  50.99 
 
 		 369 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193941  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1987  chorismate synthase  50.99 
 
 		 366 aa  355  8.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1481  chorismate synthase  50.99 
 
 		 369 aa  354  1e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.470447  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0946  chorismate synthase  50.99 
 
 		 369 aa  354  1e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.718045  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2811  chorismate synthase  53.67 
 
 		 361 aa  354  1e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.655428  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3150  chorismate synthase  50 
 
 		 373 aa  353  2e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3074  chorismate synthase  50.42 
 
 		 376 aa  353  2e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2614  chorismate synthase  50.71 
 
 		 369 aa  353  2e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3619  chorismate synthase  50.28 
 
 		 361 aa  353  2e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000281464  normal  0.087707 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3017  chorismate synthase  52.51 
 
 		 364 aa  353  2e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.503026  normal  0.557092 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0401  chorismate synthase  50.99 
 
 		 369 aa  352  4e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2707  chorismate synthase  52.79 
 
 		 361 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1699  chorismate synthase  52.97 
 
 		 361 aa  352  7e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02254  chorismate synthase  52.92 
 
 		 361 aa  350  2e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1327  Chorismate synthase  52.92 
 
 		 361 aa  350  2e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.54496  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2624  chorismate synthase  52.92 
 
 		 361 aa  350  2e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2486  chorismate synthase  52.92 
 
 		 361 aa  350  2e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1323  chorismate synthase  52.92 
 
 		 361 aa  350  2e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3470  chorismate synthase  52.92 
 
 		 361 aa  350  2e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2481  chorismate synthase  52.92 
 
 		 361 aa  350  2e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02214  hypothetical protein  52.92 
 
 		 361 aa  350  2e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1897  chorismate synthase  50.85 
 
 		 361 aa  349  3e-95  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1514  chorismate synthase  52.97 
 
 		 361 aa  350  3e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.85122  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0377  chorismate synthase  52.97 
 
 		 361 aa  350  3e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1405  chorismate synthase  52.97 
 
 		 361 aa  350  3e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.47258  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>