More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0644 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_0644  chorismate synthase  100 
 
 		 377 aa  761    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1340  chorismate synthase  73.73 
 
 		 386 aa  551  1e-156  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0578  chorismate synthase  72.92 
 
 		 373 aa  548  1e-155  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.778585  normal  0.127119 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0689  chorismate synthase  68.98 
 
 		 373 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0139341  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0260  chorismate synthase  73.19 
 
 		 373 aa  533  1e-150  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1438  chorismate synthase  53.35 
 
 		 365 aa  411  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1012  chorismate synthase  51.74 
 
 		 366 aa  390  1e-107  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0161  chorismate synthase  50.14 
 
 		 373 aa  388  1e-106  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.900075  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0547  chorismate synthase  46.9 
 
 		 365 aa  340  2e-92  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3801  chorismate synthase  46.98 
 
 		 364 aa  336  2.9999999999999997e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1623  chorismate synthase  44.41 
 
 		 363 aa  336  2.9999999999999997e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0369  chorismate synthase  46.09 
 
 		 360 aa  334  2e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1664  chorismate synthase  47.7 
 
 		 362 aa  332  6e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1637  chorismate synthase  47.7 
 
 		 362 aa  332  6e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1296  chorismate synthase  46.72 
 
 		 334 aa  332  8e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.576188  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3830  chorismate synthase  45.6 
 
 		 358 aa  327  3e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1361  chorismate synthase  45.21 
 
 		 362 aa  323  3e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.565895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3093  chorismate synthase  50.14 
 
 		 367 aa  323  4e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000101466  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2171  chorismate synthase  45.08 
 
 		 359 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0439  chorismate synthase  44.74 
 
 		 364 aa  319  3.9999999999999996e-86  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.178344  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0589  chorismate synthase  46.17 
 
 		 362 aa  318  9e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0212  chorismate synthase  45.08 
 
 		 362 aa  318  1e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.468689 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0823  chorismate synthase  43.72 
 
 		 360 aa  318  1e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3438  chorismate synthase  43.99 
 
 		 360 aa  318  1e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000199375 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4112  chorismate synthase  43.17 
 
 		 363 aa  318  1e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356503  normal  0.0141233 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1952  chorismate synthase  45.05 
 
 		 358 aa  317  3e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2355  chorismate synthase  44.54 
 
 		 362 aa  316  4e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_405  chorismate synthase  44.2 
 
 		 364 aa  315  9.999999999999999e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.09813  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11018  chorismate synthase  45.3 
 
 		 354 aa  313  2.9999999999999996e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0835  chorismate synthase  46.17 
 
 		 362 aa  313  4.999999999999999e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5072  chorismate synthase  43.72 
 
 		 359 aa  311  9e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02451  chorismate synthase  44.84 
 
 		 365 aa  311  1e-83  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.642724  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4576  chorismate synthase  46.56 
 
 		 352 aa  311  1e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2866  chorismate synthase  46.05 
 
 		 370 aa  311  2e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0041  chorismate synthase  46.7 
 
 		 351 aa  311  2e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0022126  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3132  chorismate synthase  44.08 
 
 		 357 aa  310  4e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111802  normal  0.087423 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1408  chorismate synthase  44.47 
 
 		 353 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.422248 
 
 
-
 
NC_002936  DET0462  chorismate synthase  43.67 
 
 		 364 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.282213  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02461  chorismate synthase  44.02 
 
 		 365 aa  307  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1564  chorismate synthase  45.73 
 
 		 328 aa  307  2.0000000000000002e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3619  chorismate synthase  44.44 
 
 		 361 aa  306  5.0000000000000004e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000281464  normal  0.087707 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1537  chorismate synthase  42.33 
 
 		 364 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1282  chorismate synthase  44.83 
 
 		 391 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02471  chorismate synthase  43.72 
 
 		 363 aa  304  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1314  chorismate synthase  45.14 
 
 		 361 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2667  chorismate synthase  43.72 
 
 		 364 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4064  chorismate synthase  43.78 
 
 		 359 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000659407  hitchhiker  0.000000405427 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2159  chorismate synthase  43.17 
 
 		 365 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02561  chorismate synthase  43.21 
 
 		 364 aa  303  4.0000000000000003e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.46541  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02755  chorismate synthase  42.63 
 
 		 365 aa  303  4.0000000000000003e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0341392  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0226  chorismate synthase  43.48 
 
 		 365 aa  303  5.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3150  chorismate synthase  45.63 
 
 		 373 aa  302  6.000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1538  chorismate synthase  42.98 
 
 		 366 aa  301  9e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23791  chorismate synthase  43.87 
 
 		 362 aa  301  1e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0240204 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2090  chorismate synthase  43.63 
 
 		 354 aa  300  2e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0281395  normal  0.0647066 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1568  chorismate synthase  44.6 
 
 		 364 aa  301  2e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2466  chorismate synthase  43.13 
 
 		 361 aa  301  2e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.358807  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1541  chorismate synthase  44.35 
 
 		 366 aa  301  2e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2040  chorismate synthase  44.69 
 
 		 364 aa  300  3e-80  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1394  chorismate synthase  45.14 
 
 		 362 aa  299  4e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187693  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1607  chorismate synthase  42.62 
 
 		 364 aa  299  6e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  normal  0.360545 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2451  chorismate synthase  42.62 
 
 		 364 aa  298  7e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4081  chorismate synthase  44.23 
 
 		 356 aa  298  8e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2846  chorismate synthase  42.62 
 
 		 364 aa  298  9e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000803726 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2752  chorismate synthase  42.62 
 
 		 364 aa  298  9e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.200726  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2769  chorismate synthase  42.62 
 
 		 364 aa  298  9e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.116753  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2149  chorismate synthase  43.84 
 
 		 355 aa  297  2e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0529344  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2470  chorismate synthase  43.51 
 
 		 361 aa  296  3e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2877  chorismate synthase  44.96 
 
 		 354 aa  296  4e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2222  chorismate synthase  43.06 
 
 		 352 aa  296  5e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1226  chorismate synthase  44.48 
 
 		 366 aa  295  6e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0161922 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1702  chorismate synthase  41.71 
 
 		 384 aa  296  6e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2938  chorismate synthase  42.15 
 
 		 369 aa  295  7e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03114  chorismate synthase  42.51 
 
 		 384 aa  295  7e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1212  chorismate synthase  44.32 
 
 		 361 aa  295  7e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.535517 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002863  chorismate synthase  42.51 
 
 		 361 aa  295  7e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2168  chorismate synthase  41.69 
 
 		 361 aa  295  8e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0846  chorismate synthase  43.78 
 
 		 371 aa  295  1e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.742224 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2797  chorismate synthase  43.05 
 
 		 368 aa  295  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2251  chorismate synthase  42.78 
 
 		 352 aa  294  2e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0629  chorismate synthase  44.39 
 
 		 368 aa  293  2e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0770  chorismate synthase  44.5 
 
 		 366 aa  293  4e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.742046  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0858  chorismate synthase  43.33 
 
 		 366 aa  292  7e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.52804e-17  unclonable  0.0000000936669 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1740  chorismate synthase  42.98 
 
 		 368 aa  291  9e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.544591 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1510  chorismate synthase  43.68 
 
 		 362 aa  291  9e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1814  chorismate synthase  43.01 
 
 		 367 aa  291  1e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2091  chorismate synthase  43.29 
 
 		 371 aa  291  1e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0702  chorismate synthase  43.89 
 
 		 366 aa  290  2e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1593  chorismate synthase  43.87 
 
 		 361 aa  291  2e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.040702  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1638  chorismate synthase  44.81 
 
 		 364 aa  290  2e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0304  chorismate synthase  42.66 
 
 		 366 aa  290  3e-77  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.21806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2819  chorismate synthase  43.56 
 
 		 370 aa  290  3e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0159117  normal  0.634482 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1947  chorismate synthase  44.95 
 
 		 354 aa  290  4e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03041  chorismate synthase  43.87 
 
 		 361 aa  290  4e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.418255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2244  chorismate synthase  42.42 
 
 		 365 aa  288  8e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4138  chorismate synthase  43.24 
 
 		 370 aa  288  1e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0341634 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1018  chorismate synthase  42.62 
 
 		 362 aa  288  1e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0730  chorismate synthase  43.75 
 
 		 364 aa  287  2e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1897  chorismate synthase  41.6 
 
 		 361 aa  287  2e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1142  chorismate synthase  43.88 
 
 		 362 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  0.271094 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>