More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3093 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3093  chorismate synthase  100 
 
 		 367 aa  750    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000101466  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0369  chorismate synthase  51.68 
 
 		 360 aa  394  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0161  chorismate synthase  52.69 
 
 		 373 aa  386  1e-106  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.900075  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1438  chorismate synthase  55.65 
 
 		 365 aa  383  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4064  chorismate synthase  54.75 
 
 		 359 aa  379  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000659407  hitchhiker  0.000000405427 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1012  chorismate synthase  54.8 
 
 		 366 aa  375  1e-103  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11018  chorismate synthase  53.54 
 
 		 354 aa  374  1e-102  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1952  chorismate synthase  50.14 
 
 		 358 aa  368  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3801  chorismate synthase  50.14 
 
 		 364 aa  369  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3830  chorismate synthase  49.86 
 
 		 358 aa  370  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2355  chorismate synthase  53.69 
 
 		 362 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1623  chorismate synthase  51.57 
 
 		 363 aa  365  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4081  chorismate synthase  51.8 
 
 		 356 aa  362  4e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2090  chorismate synthase  51.52 
 
 		 354 aa  361  1e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0281395  normal  0.0647066 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1664  chorismate synthase  52.27 
 
 		 362 aa  359  5e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1637  chorismate synthase  52.27 
 
 		 362 aa  359  5e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4576  chorismate synthase  50.71 
 
 		 352 aa  357  9.999999999999999e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0589  chorismate synthase  52.27 
 
 		 362 aa  358  9.999999999999999e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0212  chorismate synthase  53.98 
 
 		 362 aa  358  9.999999999999999e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.468689 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1510  chorismate synthase  52.88 
 
 		 362 aa  355  5e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0644  chorismate synthase  49.73 
 
 		 377 aa  355  6.999999999999999e-97  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0835  chorismate synthase  52.56 
 
 		 362 aa  354  1e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0041  chorismate synthase  53.56 
 
 		 351 aa  355  1e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0022126  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5072  chorismate synthase  51.53 
 
 		 359 aa  352  7e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1361  chorismate synthase  50.28 
 
 		 362 aa  349  4e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.565895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4112  chorismate synthase  48.31 
 
 		 363 aa  349  5e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356503  normal  0.0141233 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02755  chorismate synthase  51.42 
 
 		 365 aa  349  5e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0341392  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1408  chorismate synthase  51.81 
 
 		 353 aa  346  3e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.422248 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1538  chorismate synthase  49.32 
 
 		 366 aa  346  3e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2797  chorismate synthase  50.14 
 
 		 368 aa  346  3e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2149  chorismate synthase  49.58 
 
 		 355 aa  344  1e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0529344  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2866  chorismate synthase  51.14 
 
 		 370 aa  344  1e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3132  chorismate synthase  51.28 
 
 		 357 aa  344  2e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111802  normal  0.087423 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02471  chorismate synthase  50.28 
 
 		 363 aa  344  2e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0858  chorismate synthase  50.42 
 
 		 366 aa  340  2e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.52804e-17  unclonable  0.0000000936669 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2466  chorismate synthase  48.63 
 
 		 361 aa  340  2e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.358807  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0226  chorismate synthase  50 
 
 		 365 aa  339  4e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1740  chorismate synthase  49.17 
 
 		 368 aa  338  5.9999999999999996e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.544591 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1947  chorismate synthase  53.89 
 
 		 354 aa  338  9e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02561  chorismate synthase  50.56 
 
 		 364 aa  338  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.46541  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0689  chorismate synthase  48.77 
 
 		 373 aa  337  9.999999999999999e-92  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0139341  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0659  chorismate synthase  52.12 
 
 		 358 aa  338  9.999999999999999e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.463158  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2171  chorismate synthase  49.03 
 
 		 359 aa  337  9.999999999999999e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1314  chorismate synthase  52.38 
 
 		 368 aa  337  1.9999999999999998e-91  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02461  chorismate synthase  49.16 
 
 		 365 aa  336  5e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2244  chorismate synthase  48.9 
 
 		 365 aa  335  5e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0586  chorismate synthase  48.74 
 
 		 365 aa  335  7e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2251  chorismate synthase  50.99 
 
 		 352 aa  334  1e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2938  chorismate synthase  48.61 
 
 		 369 aa  334  1e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2023  chorismate synthase  50.95 
 
 		 358 aa  335  1e-90  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2819  chorismate synthase  50.14 
 
 		 370 aa  335  1e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0159117  normal  0.634482 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0702  chorismate synthase  48.22 
 
 		 366 aa  334  2e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3150  chorismate synthase  47.99 
 
 		 373 aa  333  2e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0428  chorismate synthase  50.7 
 
 		 364 aa  334  2e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0435  chorismate synthase  50.7 
 
 		 364 aa  334  2e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0304  chorismate synthase  50.85 
 
 		 366 aa  333  2e-90  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.21806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0627  chorismate synthase  48.46 
 
 		 365 aa  333  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0254313 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3619  chorismate synthase  50.14 
 
 		 361 aa  334  2e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000281464  normal  0.087707 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0823  chorismate synthase  48.01 
 
 		 360 aa  333  3e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1541  chorismate synthase  48.58 
 
 		 366 aa  333  3e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03114  chorismate synthase  49.15 
 
 		 384 aa  333  4e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2222  chorismate synthase  50.99 
 
 		 352 aa  332  4e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02451  chorismate synthase  48.88 
 
 		 365 aa  332  5e-90  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.642724  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1568  chorismate synthase  48.58 
 
 		 364 aa  332  6e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0009  chorismate synthase  51 
 
 		 356 aa  332  7.000000000000001e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1018  chorismate synthase  49.58 
 
 		 362 aa  332  9e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3438  chorismate synthase  48.3 
 
 		 360 aa  331  1e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000199375 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4332  chorismate synthase  49.86 
 
 		 366 aa  331  1e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.259213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2040  chorismate synthase  51.13 
 
 		 364 aa  330  2e-89  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0846  chorismate synthase  49.02 
 
 		 371 aa  330  2e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.742224 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1702  chorismate synthase  48.43 
 
 		 384 aa  330  2e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002863  chorismate synthase  48.58 
 
 		 361 aa  330  3e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1814  chorismate synthase  48.78 
 
 		 367 aa  329  4e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4770  chorismate synthase  49.86 
 
 		 356 aa  329  4e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00112305  normal  0.0417622 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0539  chorismate synthase  50.42 
 
 		 364 aa  329  4e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1015  chorismate synthase  50.28 
 
 		 364 aa  329  5.0000000000000004e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1640  chorismate synthase  47.5 
 
 		 363 aa  329  5.0000000000000004e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503125 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1972  chorismate synthase  47.5 
 
 		 363 aa  329  5.0000000000000004e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2159  chorismate synthase  47.9 
 
 		 365 aa  328  7e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2846  chorismate synthase  48.1 
 
 		 364 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000803726 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2769  chorismate synthase  48.1 
 
 		 364 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.116753  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0439  chorismate synthase  49.43 
 
 		 364 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.178344  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2752  chorismate synthase  48.1 
 
 		 364 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.200726  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1607  chorismate synthase  48.1 
 
 		 364 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  normal  0.360545 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1537  chorismate synthase  48.73 
 
 		 364 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_405  chorismate synthase  48.33 
 
 		 364 aa  326  3e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.09813  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0397  chorismate synthase  47.34 
 
 		 364 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.209987  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2667  chorismate synthase  47.15 
 
 		 364 aa  326  5e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2877  chorismate synthase  50.56 
 
 		 354 aa  325  7e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1741  chorismate synthase  48.07 
 
 		 356 aa  325  8.000000000000001e-88  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1314  chorismate synthase  49.3 
 
 		 361 aa  325  9e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2451  chorismate synthase  47.83 
 
 		 364 aa  325  9e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23791  chorismate synthase  49.43 
 
 		 362 aa  324  1e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0240204 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4138  chorismate synthase  47.75 
 
 		 370 aa  323  2e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0341634 
 
 
-
 
NC_002936  DET0462  chorismate synthase  48.06 
 
 		 364 aa  323  3e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.282213  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2470  chorismate synthase  49.3 
 
 		 361 aa  323  3e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1241  chorismate synthase  47.44 
 
 		 366 aa  323  4e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1142  chorismate synthase  48.74 
 
 		 362 aa  323  4e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  0.271094 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1226  chorismate synthase  48.18 
 
 		 366 aa  323  4e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0161922 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1657  chorismate synthase  48.3 
 
 		 366 aa  322  6e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112196  normal  0.0287757 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>