More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3830 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3830  chorismate synthase  100 
 
 		 358 aa  726    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1952  chorismate synthase  91.04 
 
 		 358 aa  666    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3801  chorismate synthase  82.58 
 
 		 364 aa  607  9.999999999999999e-173  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4081  chorismate synthase  66.85 
 
 		 356 aa  479  1e-134  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1438  chorismate synthase  59.55 
 
 		 365 aa  409  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0161  chorismate synthase  56.18 
 
 		 373 aa  402  1e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.900075  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1012  chorismate synthase  56.18 
 
 		 366 aa  397  1e-109  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1623  chorismate synthase  54.78 
 
 		 363 aa  392  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4112  chorismate synthase  54.62 
 
 		 363 aa  390  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356503  normal  0.0141233 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2355  chorismate synthase  55.37 
 
 		 362 aa  388  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0589  chorismate synthase  55.37 
 
 		 362 aa  385  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0369  chorismate synthase  51.12 
 
 		 360 aa  387  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1361  chorismate synthase  54.93 
 
 		 362 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.565895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1637  chorismate synthase  53.67 
 
 		 362 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1664  chorismate synthase  53.67 
 
 		 362 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1640  chorismate synthase  53.82 
 
 		 363 aa  375  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503125 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1972  chorismate synthase  53.82 
 
 		 363 aa  375  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1702  chorismate synthase  51.74 
 
 		 384 aa  377  1e-103  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2866  chorismate synthase  54.8 
 
 		 370 aa  375  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0835  chorismate synthase  54.37 
 
 		 362 aa  375  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02461  chorismate synthase  50.85 
 
 		 365 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4064  chorismate synthase  51.68 
 
 		 359 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000659407  hitchhiker  0.000000405427 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1947  chorismate synthase  55.24 
 
 		 354 aa  372  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02451  chorismate synthase  50.85 
 
 		 365 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.642724  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03114  chorismate synthase  54.11 
 
 		 384 aa  372  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2752  chorismate synthase  53.82 
 
 		 364 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.200726  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02471  chorismate synthase  51.83 
 
 		 363 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1607  chorismate synthase  54.11 
 
 		 364 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  normal  0.360545 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11018  chorismate synthase  51.94 
 
 		 354 aa  370  1e-101  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2938  chorismate synthase  53.35 
 
 		 369 aa  368  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2168  chorismate synthase  53.54 
 
 		 361 aa  368  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002863  chorismate synthase  53.82 
 
 		 361 aa  370  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0226  chorismate synthase  51.14 
 
 		 365 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2846  chorismate synthase  53.82 
 
 		 364 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000803726 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1537  chorismate synthase  52.97 
 
 		 364 aa  371  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2769  chorismate synthase  53.82 
 
 		 364 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.116753  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2159  chorismate synthase  54.11 
 
 		 365 aa  370  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2451  chorismate synthase  53.82 
 
 		 364 aa  368  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5072  chorismate synthase  52.38 
 
 		 359 aa  366  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02561  chorismate synthase  50.29 
 
 		 364 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.46541  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1510  chorismate synthase  52.89 
 
 		 362 aa  367  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0212  chorismate synthase  53.52 
 
 		 362 aa  367  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.468689 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1076  chorismate synthase  52.81 
 
 		 352 aa  367  1e-100  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.306004  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0938  chorismate synthase  52.81 
 
 		 352 aa  367  1e-100  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.464022  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2667  chorismate synthase  53.26 
 
 		 364 aa  365  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03041  chorismate synthase  51.83 
 
 		 361 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.418255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02755  chorismate synthase  52.41 
 
 		 365 aa  364  1e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0341392  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1593  chorismate synthase  51.27 
 
 		 361 aa  363  3e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.040702  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4576  chorismate synthase  50 
 
 		 352 aa  361  1e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2244  chorismate synthase  51.84 
 
 		 365 aa  360  2e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1525  chorismate synthase  53.54 
 
 		 385 aa  360  2e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0632175 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23791  chorismate synthase  51.27 
 
 		 362 aa  359  4e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0240204 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2251  chorismate synthase  52.41 
 
 		 352 aa  359  5e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0858  chorismate synthase  51.56 
 
 		 366 aa  359  5e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.52804e-17  unclonable  0.0000000936669 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0041  chorismate synthase  53.58 
 
 		 351 aa  359  5e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0022126  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2090  chorismate synthase  52.84 
 
 		 354 aa  358  8e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0281395  normal  0.0647066 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2222  chorismate synthase  52.69 
 
 		 352 aa  358  9.999999999999999e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2040  chorismate synthase  52.94 
 
 		 364 aa  357  1.9999999999999998e-97  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0702  chorismate synthase  53.54 
 
 		 366 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1699  chorismate synthase  54.96 
 
 		 361 aa  355  5e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0304  chorismate synthase  52.38 
 
 		 366 aa  355  8.999999999999999e-97  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.21806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1469  chorismate synthase  54.96 
 
 		 364 aa  354  1e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0685488 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2588  chorismate synthase  54.19 
 
 		 364 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1416  chorismate synthase  54.67 
 
 		 364 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.25436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1481  chorismate synthase  54.67 
 
 		 364 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.335191 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0823  chorismate synthase  50 
 
 		 360 aa  352  8e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2767  chorismate synthase  51.56 
 
 		 366 aa  351  1e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2091  chorismate synthase  50.14 
 
 		 371 aa  351  1e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1569  chorismate synthase  52.41 
 
 		 366 aa  351  1e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1541  chorismate synthase  50.71 
 
 		 366 aa  351  1e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1018  chorismate synthase  50.99 
 
 		 362 aa  351  1e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1568  chorismate synthase  50.14 
 
 		 364 aa  351  1e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3017  chorismate synthase  53.63 
 
 		 364 aa  350  2e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.503026  normal  0.557092 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1360  chorismate synthase  51.84 
 
 		 366 aa  350  3e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767963  normal  0.499065 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0770  chorismate synthase  51.24 
 
 		 366 aa  349  4e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.742046  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1638  chorismate synthase  53.07 
 
 		 364 aa  348  7e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2416  chorismate synthase  53.78 
 
 		 364 aa  347  1e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2470  chorismate synthase  52.5 
 
 		 361 aa  347  2e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1241  chorismate synthase  51.56 
 
 		 366 aa  347  2e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1814  chorismate synthase  53.11 
 
 		 367 aa  347  2e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2797  chorismate synthase  51.12 
 
 		 368 aa  346  4e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0401  chorismate synthase  50.99 
 
 		 369 aa  345  8e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02254  chorismate synthase  53.82 
 
 		 361 aa  345  8.999999999999999e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1345  chorismate synthase  54.39 
 
 		 361 aa  345  8.999999999999999e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.607384  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2486  chorismate synthase  53.82 
 
 		 361 aa  345  8.999999999999999e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02214  hypothetical protein  53.82 
 
 		 361 aa  345  8.999999999999999e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3470  chorismate synthase  53.82 
 
 		 361 aa  345  8.999999999999999e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1323  chorismate synthase  53.82 
 
 		 361 aa  345  8.999999999999999e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3150  chorismate synthase  49.86 
 
 		 373 aa  344  1e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1789  chorismate synthase  51.27 
 
 		 366 aa  344  1e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3132  chorismate synthase  51.13 
 
 		 357 aa  345  1e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111802  normal  0.087423 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2624  chorismate synthase  53.82 
 
 		 361 aa  344  1e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1327  Chorismate synthase  53.54 
 
 		 361 aa  343  2e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.54496  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0762  chorismate synthase  50.99 
 
 		 430 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0691461  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0946  chorismate synthase  50.99 
 
 		 369 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.718045  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1481  chorismate synthase  50.99 
 
 		 369 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.470447  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2481  chorismate synthase  53.54 
 
 		 361 aa  343  2e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2877  chorismate synthase  54.11 
 
 		 361 aa  343  2.9999999999999997e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0472598  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0846  chorismate synthase  50 
 
 		 371 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.742224 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43429  chorismate synthase  50.42 
 
 		 442 aa  343  2.9999999999999997e-93  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0435185  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>