More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4770 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4770  chorismate synthase  100 
 
 		 356 aa  717    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00112305  normal  0.0417622 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0009  chorismate synthase  81.46 
 
 		 356 aa  566  1e-160  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0659  chorismate synthase  79.61 
 
 		 358 aa  561  1.0000000000000001e-159  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.463158  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3132  chorismate synthase  70.87 
 
 		 357 aa  504  9.999999999999999e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111802  normal  0.087423 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0846  chorismate synthase  68.78 
 
 		 371 aa  502  1e-141  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.742224 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1868  chorismate synthase  67.68 
 
 		 373 aa  489  1e-137  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.423516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1314  chorismate synthase  67.68 
 
 		 361 aa  485  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1142  chorismate synthase  66.85 
 
 		 362 aa  482  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  0.271094 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1212  chorismate synthase  67.96 
 
 		 361 aa  478  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.535517 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0586  chorismate synthase  64.09 
 
 		 365 aa  474  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0627  chorismate synthase  64.36 
 
 		 365 aa  477  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0254313 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1394  chorismate synthase  67.4 
 
 		 362 aa  477  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187693  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0392  chorismate synthase  68.6 
 
 		 390 aa  471  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2470  chorismate synthase  66.3 
 
 		 361 aa  472  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4138  chorismate synthase  65.1 
 
 		 370 aa  474  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0341634 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0770  chorismate synthase  66.03 
 
 		 366 aa  473  1e-132  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.742046  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1320  chorismate synthase  69.47 
 
 		 369 aa  468  1.0000000000000001e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0852715  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0428  chorismate synthase  64.92 
 
 		 364 aa  469  1.0000000000000001e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0435  chorismate synthase  64.92 
 
 		 364 aa  469  1.0000000000000001e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2797  chorismate synthase  64.72 
 
 		 368 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0539  chorismate synthase  64.92 
 
 		 364 aa  467  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0730  chorismate synthase  64.92 
 
 		 364 aa  467  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3961  chorismate synthase  67.13 
 
 		 421 aa  465  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168181  normal  0.429407 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2757  chorismate synthase  68.42 
 
 		 366 aa  462  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0933744 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1015  chorismate synthase  66.76 
 
 		 364 aa  461  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4332  chorismate synthase  66.39 
 
 		 366 aa  463  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.259213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3176  chorismate synthase  68.32 
 
 		 366 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0629  chorismate synthase  64.31 
 
 		 368 aa  459  9.999999999999999e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1873  chorismate synthase  68.87 
 
 		 371 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3216  chorismate synthase  69.15 
 
 		 366 aa  456  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.279354  normal  0.10403 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0515  chorismate synthase  64.64 
 
 		 365 aa  456  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2990  chorismate synthase  68.6 
 
 		 366 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0397  chorismate synthase  61.05 
 
 		 364 aa  449  1e-125  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.209987  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2819  chorismate synthase  64.17 
 
 		 370 aa  450  1e-125  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0159117  normal  0.634482 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0057  chorismate synthase  63.33 
 
 		 366 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.14254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1389  chorismate synthase  63.33 
 
 		 366 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0785  chorismate synthase  65.28 
 
 		 365 aa  445  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229169 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3275  chorismate synthase  63.61 
 
 		 367 aa  438  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0331  chorismate synthase  63.33 
 
 		 370 aa  439  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.288386 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0855  chorismate synthase  64.82 
 
 		 363 aa  433  1e-120  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1740  chorismate synthase  61.34 
 
 		 368 aa  421  1e-117  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.544591 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2938  chorismate synthase  59.38 
 
 		 369 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2466  chorismate synthase  58.99 
 
 		 361 aa  416  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.358807  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1226  chorismate synthase  59.94 
 
 		 366 aa  414  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0161922 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002863  chorismate synthase  56.86 
 
 		 361 aa  412  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1568  chorismate synthase  57.66 
 
 		 364 aa  411  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03114  chorismate synthase  57.14 
 
 		 384 aa  413  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3619  chorismate synthase  59.38 
 
 		 361 aa  414  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000281464  normal  0.087707 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1241  chorismate synthase  58.5 
 
 		 366 aa  409  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0702  chorismate synthase  59.38 
 
 		 366 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1018  chorismate synthase  57.14 
 
 		 362 aa  406  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0858  chorismate synthase  59.33 
 
 		 366 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.52804e-17  unclonable  0.0000000936669 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2623  chorismate synthase  61.5 
 
 		 366 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02755  chorismate synthase  56.58 
 
 		 365 aa  405  1.0000000000000001e-112  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0341392  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1538  chorismate synthase  56.79 
 
 		 366 aa  402  1e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1814  chorismate synthase  58.26 
 
 		 367 aa  402  1e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2856  chorismate synthase  58.5 
 
 		 367 aa  402  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2168  chorismate synthase  55.18 
 
 		 361 aa  401  1e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3074  chorismate synthase  57.66 
 
 		 376 aa  399  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1833  chorismate synthase  60.17 
 
 		 365 aa  398  9.999999999999999e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.306795  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2251  chorismate synthase  57.7 
 
 		 352 aa  399  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2222  chorismate synthase  58.26 
 
 		 352 aa  399  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01260  chorismate synthase  58.22 
 
 		 367 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4605  chorismate synthase  57.1 
 
 		 366 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0590951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1789  chorismate synthase  57.1 
 
 		 366 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2159  chorismate synthase  55.74 
 
 		 365 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1699  chorismate synthase  56.86 
 
 		 361 aa  396  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2846  chorismate synthase  54.9 
 
 		 364 aa  394  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000803726 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1514  chorismate synthase  57.66 
 
 		 361 aa  395  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.85122  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2769  chorismate synthase  54.9 
 
 		 364 aa  394  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.116753  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0377  chorismate synthase  57.66 
 
 		 361 aa  395  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1405  chorismate synthase  57.66 
 
 		 361 aa  395  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.47258  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2752  chorismate synthase  54.9 
 
 		 364 aa  394  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.200726  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2244  chorismate synthase  54.9 
 
 		 365 aa  394  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0978  chorismate synthase  56.82 
 
 		 366 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1541  chorismate synthase  55.46 
 
 		 366 aa  397  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1460  chorismate synthase  56.82 
 
 		 366 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0762  chorismate synthase  57.1 
 
 		 430 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0691461  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1689  chorismate synthase  57.1 
 
 		 369 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.537327  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1713  chorismate synthase  57.1 
 
 		 369 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193941  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0401  chorismate synthase  57.1 
 
 		 369 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1569  chorismate synthase  56.82 
 
 		 366 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1438  chorismate synthase  56.55 
 
 		 366 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1481  chorismate synthase  57.1 
 
 		 369 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.470447  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0946  chorismate synthase  57.1 
 
 		 369 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.718045  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1867  chorismate synthase  57.1 
 
 		 369 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0797858  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2614  chorismate synthase  56.82 
 
 		 369 aa  393  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1360  chorismate synthase  57.38 
 
 		 366 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767963  normal  0.499065 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1537  chorismate synthase  54.9 
 
 		 364 aa  392  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2451  chorismate synthase  54.9 
 
 		 364 aa  394  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2667  chorismate synthase  55.46 
 
 		 364 aa  392  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1341  chorismate synthase  56.55 
 
 		 366 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1607  chorismate synthase  54.9 
 
 		 364 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  normal  0.360545 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1381  chorismate synthase  56.82 
 
 		 366 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.674702 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3017  chorismate synthase  57.42 
 
 		 364 aa  389  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.503026  normal  0.557092 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2811  chorismate synthase  57.1 
 
 		 361 aa  389  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.655428  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2995  chorismate synthase  57.38 
 
 		 365 aa  390  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212385 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1972  chorismate synthase  55.74 
 
 		 363 aa  388  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2091  chorismate synthase  54.04 
 
 		 371 aa  390  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1640  chorismate synthase  55.74 
 
 		 363 aa  388  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503125 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>