More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3438 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0823  chorismate synthase  94.72 
 
 		 360 aa  690    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3438  chorismate synthase  100 
 
 		 360 aa  730    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000199375 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02650  chorismate synthase, putative  60.8 
 
 		 421 aa  457  1e-127  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05731  chorismate synthase (Eurofung)  59.84 
 
 		 410 aa  438  9.999999999999999e-123  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.430078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90939  Chorismate synthase  61.58 
 
 		 377 aa  426  1e-118  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.352684 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1637  chorismate synthase  59.38 
 
 		 362 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1664  chorismate synthase  59.38 
 
 		 362 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02461  chorismate synthase  54.65 
 
 		 365 aa  415  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02561  chorismate synthase  55.59 
 
 		 364 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.46541  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02451  chorismate synthase  54.93 
 
 		 365 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.642724  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1623  chorismate synthase  59.05 
 
 		 363 aa  412  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0226  chorismate synthase  54.65 
 
 		 365 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0212  chorismate synthase  59.94 
 
 		 362 aa  414  1e-114  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.468689 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4112  chorismate synthase  59.89 
 
 		 363 aa  410  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356503  normal  0.0141233 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1361  chorismate synthase  57.91 
 
 		 362 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.565895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2355  chorismate synthase  57.87 
 
 		 362 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23791  chorismate synthase  56.86 
 
 		 362 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0240204 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0589  chorismate synthase  56.46 
 
 		 362 aa  398  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2866  chorismate synthase  57.58 
 
 		 370 aa  400  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02471  chorismate synthase  56.3 
 
 		 363 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2040  chorismate synthase  56.42 
 
 		 364 aa  392  1e-108  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0304  chorismate synthase  56.7 
 
 		 366 aa  392  1e-108  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.21806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29930  predicted protein  56.9 
 
 		 458 aa  385  1e-106  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0835  chorismate synthase  55.9 
 
 		 362 aa  385  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0369  chorismate synthase  53.33 
 
 		 360 aa  384  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03041  chorismate synthase  55.62 
 
 		 361 aa  382  1e-105  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.418255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1593  chorismate synthase  55.06 
 
 		 361 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.040702  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43429  chorismate synthase  55.43 
 
 		 442 aa  376  1e-103  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0435185  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1897  chorismate synthase  55.28 
 
 		 361 aa  374  1e-102  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4064  chorismate synthase  53.89 
 
 		 359 aa  360  2e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000659407  hitchhiker  0.000000405427 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5072  chorismate synthase  52.94 
 
 		 359 aa  358  8e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2149  chorismate synthase  53.2 
 
 		 355 aa  357  2.9999999999999997e-97  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0529344  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1510  chorismate synthase  51.94 
 
 		 362 aa  355  6.999999999999999e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0161  chorismate synthase  49.73 
 
 		 373 aa  352  4e-96  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.900075  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4576  chorismate synthase  51.57 
 
 		 352 aa  352  7e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1438  chorismate synthase  50.85 
 
 		 365 aa  350  2e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11018  chorismate synthase  49.72 
 
 		 354 aa  345  8e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1952  chorismate synthase  49.16 
 
 		 358 aa  342  4e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3830  chorismate synthase  48.6 
 
 		 358 aa  341  1e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3801  chorismate synthase  48.6 
 
 		 364 aa  329  4e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1012  chorismate synthase  47.61 
 
 		 366 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03114  chorismate synthase  47.03 
 
 		 384 aa  326  5e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002863  chorismate synthase  46.74 
 
 		 361 aa  322  6e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1702  chorismate synthase  46.76 
 
 		 384 aa  320  1.9999999999999998e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1740  chorismate synthase  49.86 
 
 		 368 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.544591 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0644  chorismate synthase  43.99 
 
 		 377 aa  318  1e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1814  chorismate synthase  50.14 
 
 		 367 aa  317  2e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1538  chorismate synthase  46.46 
 
 		 366 aa  317  2e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3150  chorismate synthase  46.93 
 
 		 373 aa  316  4e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2251  chorismate synthase  47.18 
 
 		 352 aa  314  9.999999999999999e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2222  chorismate synthase  47.18 
 
 		 352 aa  314  9.999999999999999e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2168  chorismate synthase  46.18 
 
 		 361 aa  315  9.999999999999999e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1541  chorismate synthase  45.33 
 
 		 366 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02755  chorismate synthase  46.46 
 
 		 365 aa  315  9.999999999999999e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0341392  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2159  chorismate synthase  46.46 
 
 		 365 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1640  chorismate synthase  47.59 
 
 		 363 aa  311  6.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503125 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1972  chorismate synthase  47.59 
 
 		 363 aa  311  6.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1018  chorismate synthase  45.04 
 
 		 362 aa  312  6.999999999999999e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4081  chorismate synthase  46.93 
 
 		 356 aa  311  9e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1226  chorismate synthase  48.44 
 
 		 366 aa  310  2e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0161922 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2624  chorismate synthase  48.73 
 
 		 361 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02254  chorismate synthase  48.73 
 
 		 361 aa  309  4e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2486  chorismate synthase  48.73 
 
 		 361 aa  309  4e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02214  hypothetical protein  48.73 
 
 		 361 aa  309  4e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3470  chorismate synthase  48.73 
 
 		 361 aa  309  4e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1323  chorismate synthase  48.73 
 
 		 361 aa  309  4e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1568  chorismate synthase  45.61 
 
 		 364 aa  310  4e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1537  chorismate synthase  45.89 
 
 		 364 aa  309  5e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0547  chorismate synthase  44.26 
 
 		 365 aa  309  5.9999999999999995e-83  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1327  Chorismate synthase  48.44 
 
 		 361 aa  308  8e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.54496  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2481  chorismate synthase  48.44 
 
 		 361 aa  308  8e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0938  chorismate synthase  45.94 
 
 		 352 aa  308  1.0000000000000001e-82  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.464022  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1076  chorismate synthase  45.94 
 
 		 352 aa  307  2.0000000000000002e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.306004  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2938  chorismate synthase  46.74 
 
 		 369 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2466  chorismate synthase  46.74 
 
 		 361 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.358807  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0702  chorismate synthase  47.59 
 
 		 366 aa  306  3e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2707  chorismate synthase  48.44 
 
 		 361 aa  306  3e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1241  chorismate synthase  46.18 
 
 		 366 aa  305  9.000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2846  chorismate synthase  45.04 
 
 		 364 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000803726 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3374  chorismate synthase  47.88 
 
 		 361 aa  303  2.0000000000000002e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2752  chorismate synthase  45.04 
 
 		 364 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.200726  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1607  chorismate synthase  45.04 
 
 		 364 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  normal  0.360545 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2769  chorismate synthase  45.04 
 
 		 364 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.116753  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0666  chorismate synthase  46.74 
 
 		 366 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0639836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2767  chorismate synthase  46.18 
 
 		 366 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1699  chorismate synthase  47.03 
 
 		 361 aa  302  5.000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2573  chorismate synthase  47.88 
 
 		 361 aa  302  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2737  chorismate synthase  47.88 
 
 		 361 aa  302  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2613  chorismate synthase  47.88 
 
 		 361 aa  302  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.730292  normal  0.55052 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2524  chorismate synthase  47.88 
 
 		 361 aa  302  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2626  chorismate synthase  47.88 
 
 		 361 aa  302  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000317199 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1438  chorismate synthase  45.61 
 
 		 366 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2593  chorismate synthase  48.73 
 
 		 361 aa  301  1e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0978  chorismate synthase  45.61 
 
 		 366 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2667  chorismate synthase  45.33 
 
 		 364 aa  301  1e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1460  chorismate synthase  45.61 
 
 		 366 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2451  chorismate synthase  44.76 
 
 		 364 aa  300  2e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0858  chorismate synthase  45.33 
 
 		 366 aa  301  2e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.52804e-17  unclonable  0.0000000936669 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1569  chorismate synthase  45.61 
 
 		 366 aa  300  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1657  chorismate synthase  45.89 
 
 		 366 aa  301  2e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112196  normal  0.0287757 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>