More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4576 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4576  chorismate synthase  100 
 
 		 352 aa  724    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11018  chorismate synthase  78 
 
 		 354 aa  577  1.0000000000000001e-163  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2149  chorismate synthase  76.57 
 
 		 355 aa  561  1.0000000000000001e-159  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0529344  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0369  chorismate synthase  67.42 
 
 		 360 aa  492  9.999999999999999e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4064  chorismate synthase  65.35 
 
 		 359 aa  464  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000659407  hitchhiker  0.000000405427 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5072  chorismate synthase  63.46 
 
 		 359 aa  449  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1510  chorismate synthase  63.61 
 
 		 362 aa  442  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1623  chorismate synthase  55.43 
 
 		 363 aa  406  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1541  chorismate synthase  54.67 
 
 		 366 aa  396  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4112  chorismate synthase  53.5 
 
 		 363 aa  391  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356503  normal  0.0141233 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02755  chorismate synthase  54.11 
 
 		 365 aa  384  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0341392  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2355  chorismate synthase  53.41 
 
 		 362 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0212  chorismate synthase  53.69 
 
 		 362 aa  378  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.468689 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2091  chorismate synthase  53.26 
 
 		 371 aa  380  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002863  chorismate synthase  52.97 
 
 		 361 aa  377  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1538  chorismate synthase  53.26 
 
 		 366 aa  377  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1568  chorismate synthase  52.97 
 
 		 364 aa  377  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03114  chorismate synthase  52.69 
 
 		 384 aa  376  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02461  chorismate synthase  51.41 
 
 		 365 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2168  chorismate synthase  51.84 
 
 		 361 aa  372  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2244  chorismate synthase  53.26 
 
 		 365 aa  372  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0226  chorismate synthase  51.41 
 
 		 365 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02471  chorismate synthase  51.7 
 
 		 363 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02451  chorismate synthase  51.13 
 
 		 365 aa  371  1e-102  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.642724  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0835  chorismate synthase  53.69 
 
 		 362 aa  369  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1814  chorismate synthase  51.69 
 
 		 367 aa  368  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3150  chorismate synthase  51.81 
 
 		 373 aa  368  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0589  chorismate synthase  52.56 
 
 		 362 aa  370  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2938  chorismate synthase  51.56 
 
 		 369 aa  369  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23791  chorismate synthase  52.84 
 
 		 362 aa  371  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0240204 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2466  chorismate synthase  51.42 
 
 		 361 aa  371  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.358807  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2159  chorismate synthase  53.54 
 
 		 365 aa  370  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1640  chorismate synthase  51.13 
 
 		 363 aa  365  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503125 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1361  chorismate synthase  51.41 
 
 		 362 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.565895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02561  chorismate synthase  50.14 
 
 		 364 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.46541  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1972  chorismate synthase  51.13 
 
 		 363 aa  365  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1537  chorismate synthase  52.69 
 
 		 364 aa  367  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1226  chorismate synthase  49.86 
 
 		 366 aa  367  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0161922 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2667  chorismate synthase  52.41 
 
 		 364 aa  365  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2866  chorismate synthase  53.41 
 
 		 370 aa  364  1e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1637  chorismate synthase  51.7 
 
 		 362 aa  364  1e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1664  chorismate synthase  51.7 
 
 		 362 aa  364  1e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1638  chorismate synthase  55.81 
 
 		 364 aa  364  2e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1607  chorismate synthase  52.41 
 
 		 364 aa  363  3e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  normal  0.360545 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2451  chorismate synthase  52.41 
 
 		 364 aa  362  4e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03041  chorismate synthase  51.7 
 
 		 361 aa  362  4e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.418255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2769  chorismate synthase  52.41 
 
 		 364 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.116753  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2752  chorismate synthase  52.41 
 
 		 364 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.200726  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2846  chorismate synthase  52.41 
 
 		 364 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000803726 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3830  chorismate synthase  50 
 
 		 358 aa  361  1e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1740  chorismate synthase  50.14 
 
 		 368 aa  360  1e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.544591 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1593  chorismate synthase  51.14 
 
 		 361 aa  360  2e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.040702  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1699  chorismate synthase  54.11 
 
 		 361 aa  360  2e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3017  chorismate synthase  55.52 
 
 		 364 aa  360  3e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.503026  normal  0.557092 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0547  chorismate synthase  50.14 
 
 		 365 aa  360  3e-98  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1952  chorismate synthase  51.12 
 
 		 358 aa  359  4e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0702  chorismate synthase  52.12 
 
 		 366 aa  359  5e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0858  chorismate synthase  50.99 
 
 		 366 aa  358  6e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.52804e-17  unclonable  0.0000000936669 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2040  chorismate synthase  53.11 
 
 		 364 aa  357  9.999999999999999e-98  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0304  chorismate synthase  53.39 
 
 		 366 aa  357  9.999999999999999e-98  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.21806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1018  chorismate synthase  51.84 
 
 		 362 aa  355  5.999999999999999e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2416  chorismate synthase  53.39 
 
 		 364 aa  355  1e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43429  chorismate synthase  51.25 
 
 		 442 aa  354  1e-96  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0435185  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3801  chorismate synthase  49.44 
 
 		 364 aa  353  2e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3619  chorismate synthase  50.14 
 
 		 361 aa  353  2e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000281464  normal  0.087707 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29930  predicted protein  51.26 
 
 		 458 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1314  chorismate synthase  53.8 
 
 		 368 aa  352  5e-96  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2811  chorismate synthase  52.97 
 
 		 361 aa  352  5e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.655428  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3438  chorismate synthase  51.57 
 
 		 360 aa  352  7e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000199375 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1469  chorismate synthase  54.11 
 
 		 364 aa  352  7e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0685488 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2588  chorismate synthase  53.54 
 
 		 364 aa  352  8e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2470  chorismate synthase  49.3 
 
 		 361 aa  351  8.999999999999999e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1416  chorismate synthase  54.11 
 
 		 364 aa  351  8.999999999999999e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.25436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1481  chorismate synthase  54.11 
 
 		 364 aa  351  8.999999999999999e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.335191 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0846  chorismate synthase  47.78 
 
 		 371 aa  351  1e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.742224 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1360  chorismate synthase  49.58 
 
 		 366 aa  350  3e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767963  normal  0.499065 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1241  chorismate synthase  50.42 
 
 		 366 aa  349  4e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3374  chorismate synthase  52.41 
 
 		 361 aa  348  6e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2797  chorismate synthase  47.9 
 
 		 368 aa  348  8e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0823  chorismate synthase  51.56 
 
 		 360 aa  348  9e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1453  chorismate synthase  52.41 
 
 		 361 aa  348  9e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.71846  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1702  chorismate synthase  47.31 
 
 		 384 aa  347  1e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1569  chorismate synthase  50.14 
 
 		 366 aa  346  3e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2767  chorismate synthase  49.29 
 
 		 366 aa  346  3e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0770  chorismate synthase  46.69 
 
 		 366 aa  346  3e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.742046  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3132  chorismate synthase  48.45 
 
 		 357 aa  345  5e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111802  normal  0.087423 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1987  chorismate synthase  49.86 
 
 		 366 aa  345  6e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1405  chorismate synthase  51.56 
 
 		 361 aa  345  7e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.47258  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0377  chorismate synthase  51.56 
 
 		 361 aa  345  7e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1514  chorismate synthase  51.56 
 
 		 361 aa  345  7e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.85122  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3074  chorismate synthase  49.58 
 
 		 376 aa  344  1e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1833  chorismate synthase  52.12 
 
 		 365 aa  344  1e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.306795  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1205  chorismate synthase  52.54 
 
 		 360 aa  345  1e-93  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0521105  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0938  chorismate synthase  50.57 
 
 		 352 aa  344  2e-93  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.464022  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1076  chorismate synthase  50.57 
 
 		 352 aa  344  2e-93  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.306004  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2137  chorismate synthase  51.84 
 
 		 361 aa  343  2e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.146002  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1657  chorismate synthase  49.58 
 
 		 366 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112196  normal  0.0287757 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4605  chorismate synthase  50.14 
 
 		 366 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0590951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1958  chorismate synthase  51.41 
 
 		 393 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0978  chorismate synthase  50.14 
 
 		 366 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>