More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1314 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1314  chorismate synthase  100 
 
 
368 aa  758    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2149  chorismate synthase  55.08 
 
 
355 aa  397  1e-109  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0529344  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0369  chorismate synthase  51.96 
 
 
360 aa  393  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11018  chorismate synthase  54.52 
 
 
354 aa  393  1e-108  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4576  chorismate synthase  53.8 
 
 
352 aa  391  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4064  chorismate synthase  54.34 
 
 
359 aa  385  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000659407  hitchhiker  0.000000405427 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5072  chorismate synthase  56.13 
 
 
359 aa  380  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1623  chorismate synthase  52.65 
 
 
363 aa  374  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1510  chorismate synthase  54.04 
 
 
362 aa  363  2e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2355  chorismate synthase  52.37 
 
 
362 aa  363  2e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3801  chorismate synthase  50.14 
 
 
364 aa  361  1e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2466  chorismate synthase  50.14 
 
 
361 aa  361  1e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.358807  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0161  chorismate synthase  50.81 
 
 
373 aa  355  5.999999999999999e-97  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.900075  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4112  chorismate synthase  50.14 
 
 
363 aa  355  7.999999999999999e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356503  normal  0.0141233 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1952  chorismate synthase  50.84 
 
 
358 aa  355  7.999999999999999e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1361  chorismate synthase  50.56 
 
 
362 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.565895  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3830  chorismate synthase  50.7 
 
 
358 aa  351  1e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02451  chorismate synthase  47.9 
 
 
365 aa  350  2e-95  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.642724  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02461  chorismate synthase  47.47 
 
 
365 aa  350  3e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1241  chorismate synthase  48.6 
 
 
366 aa  350  3e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1664  chorismate synthase  50.42 
 
 
362 aa  348  6e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1637  chorismate synthase  50.42 
 
 
362 aa  348  6e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2938  chorismate synthase  49.16 
 
 
369 aa  348  9e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1538  chorismate synthase  49.03 
 
 
366 aa  348  1e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0226  chorismate synthase  48.04 
 
 
365 aa  348  1e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02561  chorismate synthase  47.77 
 
 
364 aa  348  1e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.46541  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1640  chorismate synthase  48.03 
 
 
363 aa  346  5e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000503125 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1972  chorismate synthase  48.03 
 
 
363 aa  346  5e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02755  chorismate synthase  48.88 
 
 
365 aa  343  2.9999999999999997e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0341392  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2797  chorismate synthase  49.3 
 
 
368 aa  342  8e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0589  chorismate synthase  49.31 
 
 
362 aa  338  5.9999999999999996e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0846  chorismate synthase  48.06 
 
 
371 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.742224 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1142  chorismate synthase  49.31 
 
 
362 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  0.271094 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3093  chorismate synthase  51.95 
 
 
367 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000101466  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1541  chorismate synthase  49.58 
 
 
366 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0835  chorismate synthase  49.04 
 
 
362 aa  336  2.9999999999999997e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02471  chorismate synthase  46.8 
 
 
363 aa  336  3.9999999999999995e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4081  chorismate synthase  48.88 
 
 
356 aa  335  5e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1012  chorismate synthase  48.5 
 
 
366 aa  336  5e-91  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0659  chorismate synthase  51.12 
 
 
358 aa  335  5.999999999999999e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.463158  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002863  chorismate synthase  48.73 
 
 
361 aa  335  7e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1568  chorismate synthase  47.61 
 
 
364 aa  335  9e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03114  chorismate synthase  47.89 
 
 
384 aa  334  1e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0702  chorismate synthase  49.01 
 
 
366 aa  334  1e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3150  chorismate synthase  47.86 
 
 
373 aa  334  1e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2090  chorismate synthase  48.59 
 
 
354 aa  334  1e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0281395  normal  0.0647066 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1018  chorismate synthase  49.44 
 
 
362 aa  335  1e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3961  chorismate synthase  51.25 
 
 
421 aa  333  2e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168181  normal  0.429407 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1740  chorismate synthase  47.61 
 
 
368 aa  333  2e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.544591 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4138  chorismate synthase  49.17 
 
 
370 aa  333  3e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0341634 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1868  chorismate synthase  48.06 
 
 
373 aa  333  3e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.423516  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0212  chorismate synthase  49.72 
 
 
362 aa  333  3e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.468689 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3074  chorismate synthase  48.31 
 
 
376 aa  333  3e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1814  chorismate synthase  49.44 
 
 
367 aa  332  5e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03041  chorismate synthase  48.47 
 
 
361 aa  332  5e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.418255  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1438  chorismate synthase  49.44 
 
 
365 aa  332  6e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2866  chorismate synthase  48.75 
 
 
370 aa  332  9e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2091  chorismate synthase  47.37 
 
 
371 aa  331  1e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2040  chorismate synthase  47.65 
 
 
364 aa  330  2e-89  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2470  chorismate synthase  49.03 
 
 
361 aa  330  2e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23791  chorismate synthase  46.67 
 
 
362 aa  329  4e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0240204 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0770  chorismate synthase  47.79 
 
 
366 aa  329  4e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.742046  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1537  chorismate synthase  47.47 
 
 
364 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2137  chorismate synthase  50.56 
 
 
361 aa  328  7e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.146002  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2168  chorismate synthase  47.61 
 
 
361 aa  328  7e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3132  chorismate synthase  48.73 
 
 
357 aa  328  8e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111802  normal  0.087423 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1593  chorismate synthase  48.19 
 
 
361 aa  328  9e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.040702  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1987  chorismate synthase  46.17 
 
 
366 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1314  chorismate synthase  48.2 
 
 
361 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1657  chorismate synthase  46.3 
 
 
366 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112196  normal  0.0287757 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3619  chorismate synthase  48.19 
 
 
361 aa  327  2.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000281464  normal  0.087707 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1296  chorismate synthase  48.86 
 
 
334 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.576188  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1226  chorismate synthase  46.94 
 
 
366 aa  326  4.0000000000000003e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0161922 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0304  chorismate synthase  47.65 
 
 
366 aa  326  5e-88  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.21806  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0858  chorismate synthase  46.91 
 
 
366 aa  325  6e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.52804e-17  unclonable  0.0000000936669 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3176  chorismate synthase  52.63 
 
 
366 aa  325  6e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0629  chorismate synthase  48.35 
 
 
368 aa  325  8.000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2023  chorismate synthase  49.72 
 
 
358 aa  325  9e-88  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3438  chorismate synthase  47.16 
 
 
360 aa  324  1e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000199375 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2757  chorismate synthase  50.42 
 
 
366 aa  325  1e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0933744 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2856  chorismate synthase  47.75 
 
 
367 aa  323  2e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0009  chorismate synthase  50.42 
 
 
356 aa  324  2e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0823  chorismate synthase  46.88 
 
 
360 aa  323  2e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0547  chorismate synthase  47.9 
 
 
365 aa  323  3e-87  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2171  chorismate synthase  47.34 
 
 
359 aa  323  3e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2752  chorismate synthase  46.63 
 
 
364 aa  323  4e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.200726  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2846  chorismate synthase  46.63 
 
 
364 aa  323  4e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000803726 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2769  chorismate synthase  46.63 
 
 
364 aa  323  4e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.116753  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1607  chorismate synthase  46.63 
 
 
364 aa  322  5e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  normal  0.360545 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2667  chorismate synthase  46.07 
 
 
364 aa  322  6e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3374  chorismate synthase  48.31 
 
 
361 aa  322  7e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4770  chorismate synthase  49.16 
 
 
356 aa  322  8e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00112305  normal  0.0417622 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1212  chorismate synthase  47.65 
 
 
361 aa  322  8e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.535517 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43429  chorismate synthase  49.04 
 
 
442 aa  322  8e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0435185  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1689  chorismate synthase  47.47 
 
 
369 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.537327  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1713  chorismate synthase  47.47 
 
 
369 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193941  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1867  chorismate synthase  47.47 
 
 
369 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0797858  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2614  chorismate synthase  47.47 
 
 
369 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0401  chorismate synthase  47.47 
 
 
369 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0946  chorismate synthase  47.47 
 
 
369 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.718045  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>