More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1702 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1702  chorismate synthase  100 
 
 		 384 aa  785    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2355  chorismate synthase  53.33 
 
 		 362 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0212  chorismate synthase  53.7 
 
 		 362 aa  387  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.468689 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3801  chorismate synthase  52.01 
 
 		 364 aa  384  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1637  chorismate synthase  53.6 
 
 		 362 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1664  chorismate synthase  53.6 
 
 		 362 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0589  chorismate synthase  53.72 
 
 		 362 aa  380  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3830  chorismate synthase  51.74 
 
 		 358 aa  377  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1361  chorismate synthase  52.56 
 
 		 362 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.565895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1952  chorismate synthase  52.01 
 
 		 358 aa  374  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2866  chorismate synthase  51.99 
 
 		 370 aa  369  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3150  chorismate synthase  51.85 
 
 		 373 aa  365  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0369  chorismate synthase  50 
 
 		 360 aa  365  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2168  chorismate synthase  52.79 
 
 		 361 aa  364  1e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002863  chorismate synthase  51.72 
 
 		 361 aa  362  6e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5072  chorismate synthase  52.43 
 
 		 359 aa  360  2e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1537  chorismate synthase  50.4 
 
 		 364 aa  359  3e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3374  chorismate synthase  55.03 
 
 		 361 aa  359  4e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4112  chorismate synthase  50.66 
 
 		 363 aa  359  4e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356503  normal  0.0141233 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0161  chorismate synthase  51.58 
 
 		 373 aa  359  5e-98  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.900075  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03114  chorismate synthase  51.19 
 
 		 384 aa  358  6e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2811  chorismate synthase  54.97 
 
 		 361 aa  358  7e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.655428  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0835  chorismate synthase  52.27 
 
 		 362 aa  358  9e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1607  chorismate synthase  50.4 
 
 		 364 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  normal  0.360545 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2846  chorismate synthase  50.13 
 
 		 364 aa  355  5e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000803726 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1453  chorismate synthase  54.71 
 
 		 361 aa  355  5e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.71846  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2769  chorismate synthase  50.13 
 
 		 364 aa  355  5e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.116753  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2752  chorismate synthase  50.13 
 
 		 364 aa  355  5e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.200726  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2451  chorismate synthase  50.13 
 
 		 364 aa  354  2e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11018  chorismate synthase  48.26 
 
 		 354 aa  353  2.9999999999999997e-96  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0377  chorismate synthase  53.32 
 
 		 361 aa  352  4e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1514  chorismate synthase  53.32 
 
 		 361 aa  352  4e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.85122  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1541  chorismate synthase  48.94 
 
 		 366 aa  352  4e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1405  chorismate synthase  53.32 
 
 		 361 aa  352  4e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.47258  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02254  chorismate synthase  54.91 
 
 		 361 aa  352  5e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3470  chorismate synthase  54.91 
 
 		 361 aa  352  5e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02214  hypothetical protein  54.91 
 
 		 361 aa  352  5e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2486  chorismate synthase  54.91 
 
 		 361 aa  352  5e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1323  chorismate synthase  54.91 
 
 		 361 aa  352  5e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1438  chorismate synthase  51.87 
 
 		 365 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2624  chorismate synthase  54.91 
 
 		 361 aa  352  5.9999999999999994e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1327  Chorismate synthase  54.64 
 
 		 361 aa  351  1e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.54496  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1623  chorismate synthase  48.93 
 
 		 363 aa  351  1e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2481  chorismate synthase  54.64 
 
 		 361 aa  351  1e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2667  chorismate synthase  50.13 
 
 		 364 aa  351  1e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02755  chorismate synthase  49.07 
 
 		 365 aa  350  3e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0341392  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1510  chorismate synthase  51.47 
 
 		 362 aa  349  5e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2149  chorismate synthase  48.92 
 
 		 355 aa  349  5e-95  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0529344  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43429  chorismate synthase  51.21 
 
 		 442 aa  349  6e-95  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0435185  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1814  chorismate synthase  50.53 
 
 		 367 aa  349  6e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2573  chorismate synthase  53.17 
 
 		 361 aa  348  7e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2626  chorismate synthase  53.17 
 
 		 361 aa  348  7e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000317199 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2938  chorismate synthase  50.79 
 
 		 369 aa  348  1e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4576  chorismate synthase  47.31 
 
 		 352 aa  347  1e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0702  chorismate synthase  51.32 
 
 		 366 aa  347  2e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1345  chorismate synthase  54.11 
 
 		 361 aa  347  2e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.607384  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0929  chorismate synthase  52.38 
 
 		 367 aa  347  2e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000251856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1740  chorismate synthase  50 
 
 		 368 aa  347  2e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.544591 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2613  chorismate synthase  52.91 
 
 		 361 aa  347  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.730292  normal  0.55052 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2524  chorismate synthase  52.91 
 
 		 361 aa  347  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2737  chorismate synthase  52.91 
 
 		 361 aa  347  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2707  chorismate synthase  54.11 
 
 		 361 aa  347  3e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2159  chorismate synthase  48.81 
 
 		 365 aa  346  4e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1455  chorismate synthase  51.59 
 
 		 367 aa  346  5e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.055382  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1635  chorismate synthase  49.47 
 
 		 367 aa  345  6e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0500037  hitchhiker  0.00265035 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29930  predicted protein  49.35 
 
 		 458 aa  344  1e-93  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2091  chorismate synthase  49.34 
 
 		 371 aa  345  1e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1018  chorismate synthase  49.21 
 
 		 362 aa  345  1e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02451  chorismate synthase  47.15 
 
 		 365 aa  344  2e-93  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.642724  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02471  chorismate synthase  49.07 
 
 		 363 aa  344  2e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2466  chorismate synthase  50.26 
 
 		 361 aa  343  2e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.358807  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4064  chorismate synthase  50.13 
 
 		 359 aa  344  2e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000659407  hitchhiker  0.000000405427 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02561  chorismate synthase  47.68 
 
 		 364 aa  343  2.9999999999999997e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.46541  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0226  chorismate synthase  47.15 
 
 		 365 aa  343  2.9999999999999997e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4081  chorismate synthase  50.94 
 
 		 356 aa  343  2.9999999999999997e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02461  chorismate synthase  47.15 
 
 		 365 aa  343  4e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1640  chorismate synthase  47.88 
 
 		 363 aa  342  4e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503125 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1972  chorismate synthase  47.88 
 
 		 363 aa  342  4e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1568  chorismate synthase  49.47 
 
 		 364 aa  343  4e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0938  chorismate synthase  48.68 
 
 		 352 aa  342  8e-93  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.464022  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1012  chorismate synthase  48.66 
 
 		 366 aa  342  9e-93  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1076  chorismate synthase  48.68 
 
 		 352 aa  341  1e-92  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.306004  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03041  chorismate synthase  48.8 
 
 		 361 aa  341  1e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.418255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2040  chorismate synthase  49.47 
 
 		 364 aa  340  2e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1593  chorismate synthase  48.27 
 
 		 361 aa  340  2.9999999999999998e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.040702  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0304  chorismate synthase  49.47 
 
 		 366 aa  340  2.9999999999999998e-92  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.21806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2877  chorismate synthase  52.38 
 
 		 361 aa  339  4e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0472598  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1241  chorismate synthase  49.34 
 
 		 366 aa  339  4e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1699  chorismate synthase  51.72 
 
 		 361 aa  339  4e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3619  chorismate synthase  50.53 
 
 		 361 aa  338  9e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000281464  normal  0.087707 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1538  chorismate synthase  47.75 
 
 		 366 aa  337  9.999999999999999e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2593  chorismate synthase  50.26 
 
 		 361 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2244  chorismate synthase  48.68 
 
 		 365 aa  337  1.9999999999999998e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2623  chorismate synthase  51.19 
 
 		 366 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0858  chorismate synthase  47.45 
 
 		 366 aa  336  3.9999999999999995e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.52804e-17  unclonable  0.0000000936669 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42760  chorismate synthase  51.59 
 
 		 363 aa  335  7e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3132  chorismate synthase  50.93 
 
 		 357 aa  335  9e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111802  normal  0.087423 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1853  chorismate synthase  51.85 
 
 		 363 aa  333  2e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1481  chorismate synthase  50.4 
 
 		 364 aa  333  2e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.335191 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1226  chorismate synthase  49.47 
 
 		 366 aa  334  2e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0161922 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>