More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0929 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1455  chorismate synthase  85.79 
 
 		 367 aa  635    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.055382  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0929  chorismate synthase  100 
 
 		 367 aa  754    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000251856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1635  chorismate synthase  83.61 
 
 		 367 aa  620  1e-176  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0500037  hitchhiker  0.00265035 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002863  chorismate synthase  68.31 
 
 		 361 aa  517  1.0000000000000001e-145  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03114  chorismate synthase  68.52 
 
 		 384 aa  512  1e-144  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2168  chorismate synthase  68.8 
 
 		 361 aa  510  1e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1699  chorismate synthase  71.03 
 
 		 361 aa  500  1e-140  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1538  chorismate synthase  65.4 
 
 		 366 aa  498  1e-140  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2667  chorismate synthase  68.33 
 
 		 364 aa  495  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2244  chorismate synthase  69.36 
 
 		 365 aa  496  1e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1568  chorismate synthase  66.03 
 
 		 364 aa  493  9.999999999999999e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02254  chorismate synthase  69.64 
 
 		 361 aa  488  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2877  chorismate synthase  69.42 
 
 		 361 aa  489  1e-137  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0472598  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0702  chorismate synthase  65.03 
 
 		 366 aa  489  1e-137  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3470  chorismate synthase  69.64 
 
 		 361 aa  488  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2624  chorismate synthase  69.64 
 
 		 361 aa  488  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1323  chorismate synthase  69.64 
 
 		 361 aa  488  1e-137  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02214  hypothetical protein  69.64 
 
 		 361 aa  488  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2466  chorismate synthase  66.02 
 
 		 361 aa  488  1e-137  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.358807  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1226  chorismate synthase  63.66 
 
 		 366 aa  489  1e-137  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0161922 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2486  chorismate synthase  69.64 
 
 		 361 aa  488  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519758  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1327  Chorismate synthase  69.64 
 
 		 361 aa  487  1e-136  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.54496  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3374  chorismate synthase  66.67 
 
 		 361 aa  486  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2481  chorismate synthase  69.64 
 
 		 361 aa  487  1e-136  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02755  chorismate synthase  64.03 
 
 		 365 aa  488  1e-136  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0341392  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2707  chorismate synthase  69.36 
 
 		 361 aa  485  1e-136  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2752  chorismate synthase  67.13 
 
 		 364 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.200726  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1607  chorismate synthase  67.13 
 
 		 364 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  normal  0.360545 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1814  chorismate synthase  65.12 
 
 		 367 aa  481  1e-135  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2451  chorismate synthase  66.85 
 
 		 364 aa  481  1e-135  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1241  chorismate synthase  64.9 
 
 		 366 aa  481  1e-135  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2573  chorismate synthase  68.32 
 
 		 361 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2769  chorismate synthase  67.13 
 
 		 364 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.116753  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2846  chorismate synthase  67.13 
 
 		 364 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000803726 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2524  chorismate synthase  68.32 
 
 		 361 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2613  chorismate synthase  68.32 
 
 		 361 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.730292  normal  0.55052 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1537  chorismate synthase  66.57 
 
 		 364 aa  483  1e-135  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2737  chorismate synthase  68.32 
 
 		 361 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1541  chorismate synthase  62.57 
 
 		 366 aa  483  1e-135  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2626  chorismate synthase  68.32 
 
 		 361 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000317199 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2811  chorismate synthase  66.94 
 
 		 361 aa  479  1e-134  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.655428  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3150  chorismate synthase  64.01 
 
 		 373 aa  480  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2593  chorismate synthase  67.97 
 
 		 361 aa  480  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1740  chorismate synthase  64.62 
 
 		 368 aa  479  1e-134  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.544591 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2938  chorismate synthase  63.84 
 
 		 369 aa  479  1e-134  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1569  chorismate synthase  63.76 
 
 		 366 aa  479  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1345  chorismate synthase  67.22 
 
 		 361 aa  480  1e-134  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.607384  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1453  chorismate synthase  66.94 
 
 		 361 aa  477  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.71846  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1405  chorismate synthase  65.84 
 
 		 361 aa  476  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.47258  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1514  chorismate synthase  65.84 
 
 		 361 aa  476  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.85122  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0377  chorismate synthase  65.84 
 
 		 361 aa  476  1e-133  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1205  chorismate synthase  66.76 
 
 		 360 aa  474  1e-133  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0521105  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1018  chorismate synthase  64.44 
 
 		 362 aa  472  1e-132  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2091  chorismate synthase  62.4 
 
 		 371 aa  473  1e-132  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1360  chorismate synthase  62.94 
 
 		 366 aa  473  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767963  normal  0.499065 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2159  chorismate synthase  65.18 
 
 		 365 aa  473  1e-132  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2614  chorismate synthase  61.85 
 
 		 369 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2767  chorismate synthase  62.13 
 
 		 366 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1689  chorismate synthase  61.85 
 
 		 369 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.537327  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0946  chorismate synthase  61.85 
 
 		 369 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.718045  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1867  chorismate synthase  61.85 
 
 		 369 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0797858  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1713  chorismate synthase  61.85 
 
 		 369 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193941  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1481  chorismate synthase  61.85 
 
 		 369 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.470447  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0762  chorismate synthase  61.85 
 
 		 430 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0691461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0401  chorismate synthase  61.85 
 
 		 369 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42760  chorismate synthase  67.57 
 
 		 363 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2043  chorismate synthase  67.77 
 
 		 363 aa  462  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00765141  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1853  chorismate synthase  68.04 
 
 		 363 aa  464  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1722  chorismate synthase  67.68 
 
 		 363 aa  462  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4605  chorismate synthase  61.85 
 
 		 366 aa  462  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0590951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3591  chorismate synthase  66.76 
 
 		 363 aa  463  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3017  chorismate synthase  66.39 
 
 		 364 aa  462  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.503026  normal  0.557092 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1789  chorismate synthase  62.13 
 
 		 366 aa  463  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1640  chorismate synthase  60.93 
 
 		 363 aa  458  9.999999999999999e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503125 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2588  chorismate synthase  66.11 
 
 		 364 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1657  chorismate synthase  61.85 
 
 		 366 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112196  normal  0.0287757 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0938  chorismate synthase  63.38 
 
 		 352 aa  461  9.999999999999999e-129  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.464022  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1381  chorismate synthase  62.4 
 
 		 366 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.674702 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1987  chorismate synthase  62.5 
 
 		 366 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1438  chorismate synthase  61.31 
 
 		 366 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1076  chorismate synthase  63.38 
 
 		 352 aa  461  9.999999999999999e-129  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.306004  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0978  chorismate synthase  61.58 
 
 		 366 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1416  chorismate synthase  66.85 
 
 		 364 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.25436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1481  chorismate synthase  66.85 
 
 		 364 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.335191 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1972  chorismate synthase  60.93 
 
 		 363 aa  458  9.999999999999999e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1341  chorismate synthase  61.58 
 
 		 366 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1460  chorismate synthase  61.58 
 
 		 366 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1469  chorismate synthase  66.85 
 
 		 364 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0685488 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1830  chorismate synthase  66.3 
 
 		 363 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.265321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1408  chorismate synthase  66.57 
 
 		 363 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.231327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1438  chorismate synthase  66.57 
 
 		 363 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0279248 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3880  chorismate synthase  66.3 
 
 		 363 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00247284  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1638  chorismate synthase  64.75 
 
 		 364 aa  455  1e-127  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2416  chorismate synthase  63.66 
 
 		 364 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1958  chorismate synthase  63.49 
 
 		 393 aa  451  1.0000000000000001e-126  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1882  chorismate synthase  65.41 
 
 		 363 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.501466  normal  0.394588 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0977  chorismate synthase  62.3 
 
 		 371 aa  449  1e-125  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1138  chorismate synthase  63.79 
 
 		 369 aa  451  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.26701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1257  chorismate synthase  63.23 
 
 		 370 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.234528  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0871  chorismate synthase  61.2 
 
 		 371 aa  444  1.0000000000000001e-124  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.205918  normal  0.59922 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>