More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2091 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2091  chorismate synthase  100 
 
 		 371 aa  760    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1568  chorismate synthase  79.5 
 
 		 364 aa  612  9.999999999999999e-175  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2938  chorismate synthase  74.93 
 
 		 369 aa  578  1e-164  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1241  chorismate synthase  73.5 
 
 		 366 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1833  chorismate synthase  78.18 
 
 		 365 aa  573  1.0000000000000001e-162  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.306795  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2244  chorismate synthase  74.1 
 
 		 365 aa  567  1e-161  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2466  chorismate synthase  74.93 
 
 		 361 aa  564  1e-160  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.358807  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1541  chorismate synthase  70.99 
 
 		 366 aa  558  1e-158  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0702  chorismate synthase  72.8 
 
 		 366 aa  556  1e-157  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1226  chorismate synthase  71.15 
 
 		 366 aa  551  1e-156  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0161922 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2043  chorismate synthase  75.35 
 
 		 363 aa  548  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00765141  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1722  chorismate synthase  75.35 
 
 		 363 aa  548  1e-155  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2168  chorismate synthase  71.47 
 
 		 361 aa  548  1e-155  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2159  chorismate synthase  70.64 
 
 		 365 aa  548  1e-155  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1853  chorismate synthase  74.79 
 
 		 363 aa  545  1e-154  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1740  chorismate synthase  72.5 
 
 		 368 aa  546  1e-154  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.544591 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1882  chorismate synthase  74.31 
 
 		 363 aa  544  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.501466  normal  0.394588 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42760  chorismate synthase  74.59 
 
 		 363 aa  546  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1830  chorismate synthase  74.24 
 
 		 363 aa  542  1e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.265321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002863  chorismate synthase  69.53 
 
 		 361 aa  542  1e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1538  chorismate synthase  72.32 
 
 		 366 aa  541  1e-153  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3880  chorismate synthase  74.24 
 
 		 363 aa  542  1e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00247284  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3591  chorismate synthase  73.76 
 
 		 363 aa  542  1e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3150  chorismate synthase  68.19 
 
 		 373 aa  538  9.999999999999999e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1537  chorismate synthase  70.36 
 
 		 364 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1438  chorismate synthase  73.13 
 
 		 363 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0279248 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03114  chorismate synthase  68.7 
 
 		 384 aa  539  9.999999999999999e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1408  chorismate synthase  73.68 
 
 		 363 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.231327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1018  chorismate synthase  71.47 
 
 		 362 aa  538  9.999999999999999e-153  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2667  chorismate synthase  69.53 
 
 		 364 aa  535  1e-151  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1607  chorismate synthase  69.53 
 
 		 364 aa  531  1e-150  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  normal  0.360545 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02755  chorismate synthase  67.77 
 
 		 365 aa  533  1e-150  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0341392  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1814  chorismate synthase  68.23 
 
 		 367 aa  533  1e-150  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2451  chorismate synthase  69.25 
 
 		 364 aa  528  1e-149  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2752  chorismate synthase  69.25 
 
 		 364 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.200726  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2846  chorismate synthase  69.25 
 
 		 364 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000803726 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2769  chorismate synthase  69.25 
 
 		 364 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.116753  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1405  chorismate synthase  71.03 
 
 		 361 aa  527  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.47258  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0377  chorismate synthase  71.03 
 
 		 361 aa  527  1e-148  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2811  chorismate synthase  70.75 
 
 		 361 aa  524  1e-148  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.655428  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1569  chorismate synthase  69.13 
 
 		 366 aa  525  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1360  chorismate synthase  68.85 
 
 		 366 aa  525  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767963  normal  0.499065 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1514  chorismate synthase  71.03 
 
 		 361 aa  527  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.85122  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3374  chorismate synthase  71.03 
 
 		 361 aa  526  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2416  chorismate synthase  70.08 
 
 		 364 aa  523  1e-147  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1453  chorismate synthase  71.31 
 
 		 361 aa  523  1e-147  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.71846  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1699  chorismate synthase  68.98 
 
 		 361 aa  519  1e-146  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3017  chorismate synthase  70.36 
 
 		 364 aa  520  1e-146  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.503026  normal  0.557092 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2767  chorismate synthase  67.76 
 
 		 366 aa  518  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3074  chorismate synthase  67.21 
 
 		 376 aa  514  1.0000000000000001e-145  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0666  chorismate synthase  66.58 
 
 		 366 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0639836  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2593  chorismate synthase  70.75 
 
 		 361 aa  514  1.0000000000000001e-145  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1638  chorismate synthase  69.53 
 
 		 364 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1469  chorismate synthase  70.08 
 
 		 364 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0685488 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1345  chorismate synthase  71.03 
 
 		 361 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.607384  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1689  chorismate synthase  66.67 
 
 		 369 aa  511  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.537327  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02254  chorismate synthase  70.47 
 
 		 361 aa  513  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1327  Chorismate synthase  70.19 
 
 		 361 aa  512  1e-144  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.54496  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1657  chorismate synthase  68.98 
 
 		 366 aa  511  1e-144  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112196  normal  0.0287757 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0401  chorismate synthase  66.67 
 
 		 369 aa  511  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0762  chorismate synthase  66.67 
 
 		 430 aa  511  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0691461  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1323  chorismate synthase  70.47 
 
 		 361 aa  513  1e-144  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1481  chorismate synthase  66.67 
 
 		 369 aa  511  1e-144  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.470447  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0946  chorismate synthase  66.67 
 
 		 369 aa  511  1e-144  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.718045  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0858  chorismate synthase  66.3 
 
 		 366 aa  511  1e-144  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.52804e-17  unclonable  0.0000000936669 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01260  chorismate synthase  67.12 
 
 		 367 aa  513  1e-144  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1867  chorismate synthase  66.67 
 
 		 369 aa  511  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0797858  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1713  chorismate synthase  66.67 
 
 		 369 aa  511  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193941  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2486  chorismate synthase  70.47 
 
 		 361 aa  513  1e-144  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2707  chorismate synthase  70.47 
 
 		 361 aa  511  1e-144  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2624  chorismate synthase  70.47 
 
 		 361 aa  513  1e-144  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02214  hypothetical protein  70.47 
 
 		 361 aa  513  1e-144  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1987  chorismate synthase  69.06 
 
 		 366 aa  513  1e-144  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1138  chorismate synthase  67.93 
 
 		 369 aa  512  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.26701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3470  chorismate synthase  70.47 
 
 		 361 aa  513  1e-144  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2588  chorismate synthase  69.25 
 
 		 364 aa  513  1e-144  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1416  chorismate synthase  70.08 
 
 		 364 aa  513  1e-144  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.25436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1481  chorismate synthase  70.08 
 
 		 364 aa  513  1e-144  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.335191 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2481  chorismate synthase  70.19 
 
 		 361 aa  512  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1257  chorismate synthase  68.65 
 
 		 370 aa  510  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.234528  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1789  chorismate synthase  67.31 
 
 		 366 aa  511  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2614  chorismate synthase  66.12 
 
 		 369 aa  510  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0978  chorismate synthase  67.31 
 
 		 366 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1460  chorismate synthase  67.31 
 
 		 366 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2856  chorismate synthase  67.03 
 
 		 367 aa  509  1e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2877  chorismate synthase  69.06 
 
 		 361 aa  507  9.999999999999999e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0472598  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2626  chorismate synthase  69.36 
 
 		 361 aa  507  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000317199 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4605  chorismate synthase  67.31 
 
 		 366 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0590951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1958  chorismate synthase  68.87 
 
 		 393 aa  505  9.999999999999999e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1381  chorismate synthase  67.31 
 
 		 366 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.674702 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2524  chorismate synthase  69.36 
 
 		 361 aa  507  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2573  chorismate synthase  69.36 
 
 		 361 aa  507  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2737  chorismate synthase  69.36 
 
 		 361 aa  507  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1438  chorismate synthase  67.03 
 
 		 366 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1341  chorismate synthase  67.03 
 
 		 366 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2613  chorismate synthase  69.36 
 
 		 361 aa  507  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.730292  normal  0.55052 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1566  chorismate synthase  68.58 
 
 		 366 aa  499  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1205  chorismate synthase  68.72 
 
 		 360 aa  500  1e-140  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0521105  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1640  chorismate synthase  63.81 
 
 		 363 aa  496  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503125 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1972  chorismate synthase  63.81 
 
 		 363 aa  496  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>