More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4112 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4112  chorismate synthase  100 
 
 		 363 aa  728    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356503  normal  0.0141233 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0212  chorismate synthase  66.67 
 
 		 362 aa  494  1e-139  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.468689 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2355  chorismate synthase  63.91 
 
 		 362 aa  486  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1637  chorismate synthase  62.09 
 
 		 362 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1664  chorismate synthase  62.09 
 
 		 362 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0589  chorismate synthase  62.81 
 
 		 362 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1361  chorismate synthase  62.81 
 
 		 362 aa  467  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.565895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2866  chorismate synthase  61.43 
 
 		 370 aa  461  1e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43429  chorismate synthase  62.74 
 
 		 442 aa  455  1e-127  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0435185  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1623  chorismate synthase  63.19 
 
 		 363 aa  451  1.0000000000000001e-126  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02461  chorismate synthase  57.69 
 
 		 365 aa  449  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0835  chorismate synthase  60.61 
 
 		 362 aa  448  1e-125  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02471  chorismate synthase  59.62 
 
 		 363 aa  449  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0304  chorismate synthase  62.74 
 
 		 366 aa  447  1.0000000000000001e-124  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.21806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02561  chorismate synthase  56.32 
 
 		 364 aa  444  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.46541  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02451  chorismate synthase  57.14 
 
 		 365 aa  443  1e-123  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.642724  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0226  chorismate synthase  56.71 
 
 		 365 aa  441  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0369  chorismate synthase  57.94 
 
 		 360 aa  442  1e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23791  chorismate synthase  60.33 
 
 		 362 aa  441  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0240204 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03041  chorismate synthase  59.5 
 
 		 361 aa  441  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.418255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2040  chorismate synthase  61.1 
 
 		 364 aa  436  1e-121  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1593  chorismate synthase  58.68 
 
 		 361 aa  434  1e-120  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.040702  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29930  predicted protein  59.5 
 
 		 458 aa  424  1e-118  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1897  chorismate synthase  61.71 
 
 		 361 aa  424  1e-118  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5072  chorismate synthase  59.1 
 
 		 359 aa  422  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4064  chorismate synthase  56.55 
 
 		 359 aa  418  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000659407  hitchhiker  0.000000405427 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0823  chorismate synthase  60.45 
 
 		 360 aa  408  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3438  chorismate synthase  59.89 
 
 		 360 aa  410  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000199375 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1510  chorismate synthase  58.5 
 
 		 362 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2149  chorismate synthase  55.46 
 
 		 355 aa  400  9.999999999999999e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0529344  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3801  chorismate synthase  56.02 
 
 		 364 aa  397  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1952  chorismate synthase  55.46 
 
 		 358 aa  392  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4576  chorismate synthase  53.5 
 
 		 352 aa  391  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3830  chorismate synthase  54.62 
 
 		 358 aa  390  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0161  chorismate synthase  56.28 
 
 		 373 aa  389  1e-107  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.900075  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3132  chorismate synthase  55.12 
 
 		 357 aa  381  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111802  normal  0.087423 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1438  chorismate synthase  54.78 
 
 		 365 aa  380  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11018  chorismate synthase  52.38 
 
 		 354 aa  379  1e-104  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0659  chorismate synthase  56.47 
 
 		 358 aa  378  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.463158  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1568  chorismate synthase  53.31 
 
 		 364 aa  375  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90939  Chorismate synthase  54.52 
 
 		 377 aa  371  1e-102  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.352684 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1541  chorismate synthase  51.39 
 
 		 366 aa  374  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4138  chorismate synthase  54.64 
 
 		 370 aa  374  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0341634 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03114  chorismate synthase  51.39 
 
 		 384 aa  369  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002863  chorismate synthase  51.67 
 
 		 361 aa  368  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2091  chorismate synthase  50.83 
 
 		 371 aa  366  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1740  chorismate synthase  54.17 
 
 		 368 aa  365  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.544591 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2470  chorismate synthase  52.86 
 
 		 361 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2168  chorismate synthase  51.67 
 
 		 361 aa  367  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1226  chorismate synthase  53.46 
 
 		 366 aa  366  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0161922 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02650  chorismate synthase, putative  52.66 
 
 		 421 aa  364  1e-99  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05731  chorismate synthase (Eurofung)  52.76 
 
 		 410 aa  363  3e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.430078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1394  chorismate synthase  52.59 
 
 		 362 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187693  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0858  chorismate synthase  52.21 
 
 		 366 aa  362  5.0000000000000005e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.52804e-17  unclonable  0.0000000936669 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2938  chorismate synthase  51.94 
 
 		 369 aa  362  6e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3150  chorismate synthase  51.66 
 
 		 373 aa  361  1e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4081  chorismate synthase  53.5 
 
 		 356 aa  361  1e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0009  chorismate synthase  55.12 
 
 		 356 aa  361  1e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1212  chorismate synthase  51.77 
 
 		 361 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.535517 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1702  chorismate synthase  50.66 
 
 		 384 aa  359  3e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1018  chorismate synthase  51.11 
 
 		 362 aa  360  3e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2466  chorismate synthase  52.09 
 
 		 361 aa  359  4e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.358807  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1320  chorismate synthase  54.25 
 
 		 369 aa  358  5e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0852715  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0846  chorismate synthase  51.48 
 
 		 371 aa  358  6e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.742224 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1314  chorismate synthase  52.04 
 
 		 361 aa  358  6e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02755  chorismate synthase  50.28 
 
 		 365 aa  358  6e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0341392  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0702  chorismate synthase  53.33 
 
 		 366 aa  358  8e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2244  chorismate synthase  51.11 
 
 		 365 aa  358  9.999999999999999e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2757  chorismate synthase  54.86 
 
 		 366 aa  354  1e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0933744 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0392  chorismate synthase  55.56 
 
 		 390 aa  354  1e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1814  chorismate synthase  53.33 
 
 		 367 aa  354  1e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2811  chorismate synthase  53.31 
 
 		 361 aa  354  1e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.655428  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0730  chorismate synthase  51.77 
 
 		 364 aa  354  1e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1972  chorismate synthase  52.22 
 
 		 363 aa  353  2e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1640  chorismate synthase  52.22 
 
 		 363 aa  353  2e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503125 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0629  chorismate synthase  52.55 
 
 		 368 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1537  chorismate synthase  50.56 
 
 		 364 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2159  chorismate synthase  50.56 
 
 		 365 aa  353  4e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1538  chorismate synthase  50.68 
 
 		 366 aa  352  7e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0770  chorismate synthase  50.95 
 
 		 366 aa  352  7e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.742046  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1699  chorismate synthase  53.61 
 
 		 361 aa  351  8.999999999999999e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1012  chorismate synthase  50.42 
 
 		 366 aa  351  8.999999999999999e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1241  chorismate synthase  50.55 
 
 		 366 aa  350  2e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1405  chorismate synthase  51.93 
 
 		 361 aa  350  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.47258  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1514  chorismate synthase  51.93 
 
 		 361 aa  350  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.85122  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0377  chorismate synthase  51.93 
 
 		 361 aa  350  2e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0938  chorismate synthase  51.38 
 
 		 352 aa  349  3e-95  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.464022  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1076  chorismate synthase  51.38 
 
 		 352 aa  349  4e-95  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.306004  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2251  chorismate synthase  50.69 
 
 		 352 aa  349  4e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2222  chorismate synthase  50.42 
 
 		 352 aa  349  4e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4770  chorismate synthase  53.46 
 
 		 356 aa  349  5e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00112305  normal  0.0417622 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1833  chorismate synthase  53.04 
 
 		 365 aa  348  8e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.306795  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2995  chorismate synthase  51.38 
 
 		 365 aa  348  1e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212385 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01260  chorismate synthase  51.37 
 
 		 367 aa  348  1e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1657  chorismate synthase  51.1 
 
 		 366 aa  347  2e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112196  normal  0.0287757 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1987  chorismate synthase  51.1 
 
 		 366 aa  347  2e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1868  chorismate synthase  51.9 
 
 		 373 aa  347  2e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.423516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1607  chorismate synthase  49.72 
 
 		 364 aa  347  2e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  normal  0.360545 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1142  chorismate synthase  50.68 
 
 		 362 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  0.271094 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1453  chorismate synthase  52.49 
 
 		 361 aa  347  2e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.71846  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>