More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1593 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1593  chorismate synthase  100 
 
 		 361 aa  741    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.040702  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03041  chorismate synthase  98.61 
 
 		 361 aa  732    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.418255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02471  chorismate synthase  75.77 
 
 		 363 aa  578  1e-164  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23791  chorismate synthase  76.88 
 
 		 362 aa  571  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0240204 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2040  chorismate synthase  78.67 
 
 		 364 aa  567  1e-160  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0304  chorismate synthase  76.18 
 
 		 366 aa  554  1e-156  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.21806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02461  chorismate synthase  70 
 
 		 365 aa  541  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02451  chorismate synthase  70 
 
 		 365 aa  540  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.642724  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02561  chorismate synthase  69.72 
 
 		 364 aa  537  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.46541  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0226  chorismate synthase  69.17 
 
 		 365 aa  535  1e-151  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0212  chorismate synthase  69.08 
 
 		 362 aa  506  9.999999999999999e-143  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.468689 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0589  chorismate synthase  65.46 
 
 		 362 aa  487  1e-136  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1664  chorismate synthase  65.74 
 
 		 362 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2355  chorismate synthase  66.3 
 
 		 362 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1637  chorismate synthase  65.74 
 
 		 362 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1361  chorismate synthase  63.79 
 
 		 362 aa  474  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.565895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2866  chorismate synthase  64.62 
 
 		 370 aa  470  1.0000000000000001e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0835  chorismate synthase  64.62 
 
 		 362 aa  467  9.999999999999999e-131  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1623  chorismate synthase  60.45 
 
 		 363 aa  454  1.0000000000000001e-126  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29930  predicted protein  61.67 
 
 		 458 aa  450  1e-125  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4112  chorismate synthase  58.68 
 
 		 363 aa  448  1e-125  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356503  normal  0.0141233 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43429  chorismate synthase  60.22 
 
 		 442 aa  443  1e-123  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0435185  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1897  chorismate synthase  58.77 
 
 		 361 aa  409  1e-113  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0369  chorismate synthase  53.09 
 
 		 360 aa  400  9.999999999999999e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4064  chorismate synthase  55.34 
 
 		 359 aa  398  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000659407  hitchhiker  0.000000405427 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0823  chorismate synthase  55.34 
 
 		 360 aa  397  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5072  chorismate synthase  55.08 
 
 		 359 aa  392  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3438  chorismate synthase  55.06 
 
 		 360 aa  392  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000199375 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05731  chorismate synthase (Eurofung)  53.51 
 
 		 410 aa  385  1e-106  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.430078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2149  chorismate synthase  52.68 
 
 		 355 aa  382  1e-105  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0529344  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3801  chorismate synthase  51.82 
 
 		 364 aa  380  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1952  chorismate synthase  51.27 
 
 		 358 aa  379  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90939  Chorismate synthase  55.31 
 
 		 377 aa  380  1e-104  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.352684 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11018  chorismate synthase  52.11 
 
 		 354 aa  379  1e-104  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3830  chorismate synthase  51.27 
 
 		 358 aa  378  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4576  chorismate synthase  51.14 
 
 		 352 aa  374  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1510  chorismate synthase  54.14 
 
 		 362 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02650  chorismate synthase, putative  51.61 
 
 		 421 aa  370  1e-101  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1702  chorismate synthase  48.27 
 
 		 384 aa  353  2e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1438  chorismate synthase  50.56 
 
 		 365 aa  351  1e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0161  chorismate synthase  48.64 
 
 		 373 aa  347  2e-94  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.900075  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1568  chorismate synthase  48.06 
 
 		 364 aa  345  8e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2091  chorismate synthase  47.9 
 
 		 371 aa  345  1e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2168  chorismate synthase  48.46 
 
 		 361 aa  343  2.9999999999999997e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03114  chorismate synthase  48.18 
 
 		 384 aa  342  8e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002863  chorismate synthase  48.46 
 
 		 361 aa  342  9e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3150  chorismate synthase  48.63 
 
 		 373 aa  341  1e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1541  chorismate synthase  48.06 
 
 		 366 aa  340  2e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1640  chorismate synthase  48.07 
 
 		 363 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503125 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1972  chorismate synthase  48.07 
 
 		 363 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02755  chorismate synthase  46.41 
 
 		 365 aa  335  5e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0341392  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1018  chorismate synthase  46.78 
 
 		 362 aa  334  1e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2938  chorismate synthase  47.78 
 
 		 369 aa  334  1e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4081  chorismate synthase  49.3 
 
 		 356 aa  333  2e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2159  chorismate synthase  47.62 
 
 		 365 aa  332  5e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1987  chorismate synthase  46.94 
 
 		 366 aa  331  1e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0770  chorismate synthase  47.25 
 
 		 366 aa  331  2e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.742046  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1657  chorismate synthase  46.67 
 
 		 366 aa  330  2e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112196  normal  0.0287757 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1226  chorismate synthase  46.67 
 
 		 366 aa  330  2e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0161922 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2667  chorismate synthase  46.67 
 
 		 364 aa  330  2e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1241  chorismate synthase  46.67 
 
 		 366 aa  330  3e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1012  chorismate synthase  49.72 
 
 		 366 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1525  chorismate synthase  45.56 
 
 		 385 aa  328  8e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0632175 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1538  chorismate synthase  46.11 
 
 		 366 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1360  chorismate synthase  45.56 
 
 		 366 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767963  normal  0.499065 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1537  chorismate synthase  45.94 
 
 		 364 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1789  chorismate synthase  45.28 
 
 		 366 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2244  chorismate synthase  46.11 
 
 		 365 aa  326  4.0000000000000003e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3161  chorismate synthase  46.39 
 
 		 364 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0702  chorismate synthase  47.5 
 
 		 366 aa  325  5e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0858  chorismate synthase  46.11 
 
 		 366 aa  325  5e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.52804e-17  unclonable  0.0000000936669 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1740  chorismate synthase  46.11 
 
 		 368 aa  325  6e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.544591 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2470  chorismate synthase  46.32 
 
 		 361 aa  325  7e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1814  chorismate synthase  48.07 
 
 		 367 aa  325  7e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2856  chorismate synthase  46.24 
 
 		 367 aa  325  7e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1607  chorismate synthase  46.67 
 
 		 364 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  normal  0.360545 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1381  chorismate synthase  45.56 
 
 		 366 aa  324  1e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.674702 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2451  chorismate synthase  46.67 
 
 		 364 aa  324  1e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0978  chorismate synthase  45.28 
 
 		 366 aa  324  1e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1460  chorismate synthase  45.28 
 
 		 366 aa  324  1e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3619  chorismate synthase  46.67 
 
 		 361 aa  324  1e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000281464  normal  0.087707 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2846  chorismate synthase  46.39 
 
 		 364 aa  324  2e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000803726 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2752  chorismate synthase  46.39 
 
 		 364 aa  324  2e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.200726  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2769  chorismate synthase  46.39 
 
 		 364 aa  324  2e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.116753  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2767  chorismate synthase  44.44 
 
 		 366 aa  323  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01260  chorismate synthase  44.85 
 
 		 367 aa  322  5e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4605  chorismate synthase  45.28 
 
 		 366 aa  322  5e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0590951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1569  chorismate synthase  44.72 
 
 		 366 aa  322  6e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2995  chorismate synthase  45.28 
 
 		 365 aa  322  6e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212385 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1438  chorismate synthase  45 
 
 		 366 aa  322  6e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1341  chorismate synthase  45 
 
 		 366 aa  322  7e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1699  chorismate synthase  48.74 
 
 		 361 aa  322  8e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1257  chorismate synthase  46.67 
 
 		 370 aa  322  9.000000000000001e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.234528  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2466  chorismate synthase  44.35 
 
 		 361 aa  321  9.999999999999999e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.358807  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3074  chorismate synthase  45.28 
 
 		 376 aa  321  9.999999999999999e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0629  chorismate synthase  45.82 
 
 		 368 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1076  chorismate synthase  45.66 
 
 		 352 aa  320  1.9999999999999998e-86  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.306004  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0871  chorismate synthase  46.67 
 
 		 371 aa  320  3e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.205918  normal  0.59922 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0938  chorismate synthase  45.66 
 
 		 352 aa  320  3e-86  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.464022  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4957  chorismate synthase  44.17 
 
 		 389 aa  319  3.9999999999999996e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>