More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_02451 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_02451  chorismate synthase  100 
 
 
365 aa  749    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.642724  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02461  chorismate synthase  97.53 
 
 
365 aa  733    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0226  chorismate synthase  94.49 
 
 
365 aa  709    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02561  chorismate synthase  86.78 
 
 
364 aa  666    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.46541  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02471  chorismate synthase  72.93 
 
 
363 aa  561  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03041  chorismate synthase  70.83 
 
 
361 aa  525  1e-148  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.418255  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23791  chorismate synthase  68.51 
 
 
362 aa  523  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0240204 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1593  chorismate synthase  70 
 
 
361 aa  520  1e-146  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.040702  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0304  chorismate synthase  69.78 
 
 
366 aa  517  1.0000000000000001e-145  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.21806  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2040  chorismate synthase  70.05 
 
 
364 aa  512  1e-144  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0589  chorismate synthase  65.29 
 
 
362 aa  490  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0212  chorismate synthase  65.83 
 
 
362 aa  489  1e-137  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.468689 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2355  chorismate synthase  64.19 
 
 
362 aa  482  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1637  chorismate synthase  64.74 
 
 
362 aa  484  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1664  chorismate synthase  64.74 
 
 
362 aa  484  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29930  predicted protein  65.11 
 
 
458 aa  481  1e-135  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1361  chorismate synthase  63.46 
 
 
362 aa  478  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.565895  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2866  chorismate synthase  63.09 
 
 
370 aa  475  1e-133  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0835  chorismate synthase  63.64 
 
 
362 aa  468  1.0000000000000001e-131  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43429  chorismate synthase  59.62 
 
 
442 aa  462  1e-129  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0435185  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1623  chorismate synthase  59.72 
 
 
363 aa  454  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4112  chorismate synthase  57.14 
 
 
363 aa  443  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356503  normal  0.0141233 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0823  chorismate synthase  55.21 
 
 
360 aa  420  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3438  chorismate synthase  54.93 
 
 
360 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000199375 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1897  chorismate synthase  57.5 
 
 
361 aa  409  1e-113  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0369  chorismate synthase  53.91 
 
 
360 aa  410  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05731  chorismate synthase (Eurofung)  51.81 
 
 
410 aa  389  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.430078  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5072  chorismate synthase  53.39 
 
 
359 aa  385  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90939  Chorismate synthase  55.04 
 
 
377 aa  385  1e-106  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.352684 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4064  chorismate synthase  52.23 
 
 
359 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000659407  hitchhiker  0.000000405427 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02650  chorismate synthase, putative  51.47 
 
 
421 aa  381  1e-105  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1510  chorismate synthase  54.62 
 
 
362 aa  382  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2149  chorismate synthase  51.41 
 
 
355 aa  378  1e-104  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0529344  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1952  chorismate synthase  50.85 
 
 
358 aa  379  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11018  chorismate synthase  51.99 
 
 
354 aa  376  1e-103  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4576  chorismate synthase  51.13 
 
 
352 aa  371  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3830  chorismate synthase  50.85 
 
 
358 aa  374  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3801  chorismate synthase  51.7 
 
 
364 aa  372  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0161  chorismate synthase  51.78 
 
 
373 aa  358  9.999999999999999e-98  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.900075  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1438  chorismate synthase  52.69 
 
 
365 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1702  chorismate synthase  47.15 
 
 
384 aa  344  2e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2251  chorismate synthase  49.44 
 
 
352 aa  341  1e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2222  chorismate synthase  49.44 
 
 
352 aa  341  1e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02755  chorismate synthase  47.9 
 
 
365 aa  337  1.9999999999999998e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0341392  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1640  chorismate synthase  46.22 
 
 
363 aa  333  2e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000503125 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03114  chorismate synthase  48.46 
 
 
384 aa  333  2e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1972  chorismate synthase  46.22 
 
 
363 aa  333  2e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002863  chorismate synthase  48.74 
 
 
361 aa  332  5e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1538  chorismate synthase  48.74 
 
 
366 aa  331  1e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1012  chorismate synthase  48.73 
 
 
366 aa  331  1e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4081  chorismate synthase  48.88 
 
 
356 aa  330  2e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1541  chorismate synthase  46.22 
 
 
366 aa  328  6e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2159  chorismate synthase  48.18 
 
 
365 aa  325  6e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1537  chorismate synthase  46.81 
 
 
364 aa  325  1e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1568  chorismate synthase  46.22 
 
 
364 aa  323  4e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1740  chorismate synthase  46.5 
 
 
368 aa  322  6e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.544591 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2466  chorismate synthase  46.67 
 
 
361 aa  322  6e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.358807  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0547  chorismate synthase  47.08 
 
 
365 aa  322  8e-87  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1814  chorismate synthase  47.06 
 
 
367 aa  322  8e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1607  chorismate synthase  48.74 
 
 
364 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  normal  0.360545 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0871  chorismate synthase  47.21 
 
 
371 aa  321  9.999999999999999e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.205918  normal  0.59922 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1226  chorismate synthase  45.81 
 
 
366 aa  321  9.999999999999999e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0161922 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2752  chorismate synthase  48.46 
 
 
364 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.200726  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2846  chorismate synthase  48.46 
 
 
364 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000803726 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2769  chorismate synthase  48.46 
 
 
364 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.116753  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2451  chorismate synthase  48.74 
 
 
364 aa  320  3e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3161  chorismate synthase  46.37 
 
 
364 aa  319  5e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2995  chorismate synthase  45.53 
 
 
365 aa  319  5e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.212385 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2667  chorismate synthase  47.34 
 
 
364 aa  319  6e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2168  chorismate synthase  46.5 
 
 
361 aa  318  7e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1241  chorismate synthase  45.53 
 
 
366 aa  318  7.999999999999999e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0702  chorismate synthase  46.5 
 
 
366 aa  318  1e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2938  chorismate synthase  46.5 
 
 
369 aa  318  1e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2623  chorismate synthase  46.52 
 
 
366 aa  317  1e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4957  chorismate synthase  44.97 
 
 
389 aa  317  2e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1018  chorismate synthase  45.66 
 
 
362 aa  317  2e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1657  chorismate synthase  44.69 
 
 
366 aa  317  3e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112196  normal  0.0287757 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1525  chorismate synthase  44.69 
 
 
385 aa  317  3e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0632175 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3132  chorismate synthase  46.5 
 
 
357 aa  316  4e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111802  normal  0.087423 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1076  chorismate synthase  47.06 
 
 
352 aa  316  4e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.306004  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1987  chorismate synthase  44.69 
 
 
366 aa  316  4e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3150  chorismate synthase  45.48 
 
 
373 aa  316  5e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0938  chorismate synthase  47.06 
 
 
352 aa  316  5e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.464022  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1360  chorismate synthase  44.41 
 
 
366 aa  315  6e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767963  normal  0.499065 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0858  chorismate synthase  44.41 
 
 
366 aa  315  8e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.52804e-17  unclonable  0.0000000936669 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1205  chorismate synthase  48.34 
 
 
360 aa  315  8e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0521105  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2091  chorismate synthase  45.1 
 
 
371 aa  314  9.999999999999999e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1314  chorismate synthase  47.9 
 
 
368 aa  314  1.9999999999999998e-84  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2797  chorismate synthase  44.41 
 
 
368 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2767  chorismate synthase  44.13 
 
 
366 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2244  chorismate synthase  45.38 
 
 
365 aa  314  1.9999999999999998e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0977  chorismate synthase  46.37 
 
 
371 aa  313  3.9999999999999997e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1381  chorismate synthase  44.69 
 
 
366 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.674702 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0041  chorismate synthase  47.73 
 
 
351 aa  312  6.999999999999999e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0022126  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0439  chorismate synthase  45.38 
 
 
364 aa  311  7.999999999999999e-84  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.178344  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0644  chorismate synthase  44.84 
 
 
377 aa  311  1e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1789  chorismate synthase  43.58 
 
 
366 aa  311  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681987  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4138  chorismate synthase  45.03 
 
 
370 aa  311  1e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0341634 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0978  chorismate synthase  44.41 
 
 
366 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2470  chorismate synthase  45.45 
 
 
361 aa  311  1e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>