More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03114 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2168  chorismate synthase  87.26 
 
 
361 aa  664    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03114  chorismate synthase  100 
 
 
384 aa  791    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002863  chorismate synthase  97.51 
 
 
361 aa  726    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1699  chorismate synthase  90.58 
 
 
361 aa  656    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2159  chorismate synthase  77.99 
 
 
365 aa  599  1e-170  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2752  chorismate synthase  76.73 
 
 
364 aa  592  1e-168  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.200726  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1607  chorismate synthase  76.73 
 
 
364 aa  593  1e-168  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  normal  0.360545 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2769  chorismate synthase  76.73 
 
 
364 aa  592  1e-168  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.116753  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2846  chorismate synthase  76.73 
 
 
364 aa  592  1e-168  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000803726 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2451  chorismate synthase  76.45 
 
 
364 aa  589  1e-167  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1537  chorismate synthase  76.18 
 
 
364 aa  590  1e-167  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2667  chorismate synthase  77.29 
 
 
364 aa  589  1e-167  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2416  chorismate synthase  78.67 
 
 
364 aa  578  1e-164  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2588  chorismate synthase  78.39 
 
 
364 aa  580  1e-164  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02755  chorismate synthase  75.62 
 
 
365 aa  576  1.0000000000000001e-163  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0341392  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3017  chorismate synthase  77.29 
 
 
364 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.503026  normal  0.557092 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1327  Chorismate synthase  78.61 
 
 
361 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.54496  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2481  chorismate synthase  78.61 
 
 
361 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2811  chorismate synthase  77.5 
 
 
361 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.655428  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1638  chorismate synthase  77.29 
 
 
364 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1416  chorismate synthase  78.27 
 
 
364 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.25436  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1481  chorismate synthase  78.27 
 
 
364 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.335191 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1469  chorismate synthase  78.27 
 
 
364 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0685488 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1018  chorismate synthase  74.79 
 
 
362 aa  571  1.0000000000000001e-162  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02254  chorismate synthase  78.33 
 
 
361 aa  570  1e-161  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02214  hypothetical protein  78.33 
 
 
361 aa  570  1e-161  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2624  chorismate synthase  78.33 
 
 
361 aa  570  1e-161  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1514  chorismate synthase  78.06 
 
 
361 aa  571  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.85122  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2573  chorismate synthase  78.33 
 
 
361 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0377  chorismate synthase  78.06 
 
 
361 aa  571  1e-161  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2626  chorismate synthase  78.33 
 
 
361 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000317199 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3470  chorismate synthase  78.33 
 
 
361 aa  570  1e-161  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2524  chorismate synthase  78.33 
 
 
361 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2613  chorismate synthase  78.33 
 
 
361 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.730292  normal  0.55052 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1541  chorismate synthase  72.58 
 
 
366 aa  568  1e-161  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1405  chorismate synthase  78.06 
 
 
361 aa  571  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.47258  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2737  chorismate synthase  78.33 
 
 
361 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3374  chorismate synthase  77.22 
 
 
361 aa  569  1e-161  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2707  chorismate synthase  78.33 
 
 
361 aa  569  1e-161  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2486  chorismate synthase  78.33 
 
 
361 aa  570  1e-161  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519758  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1323  chorismate synthase  78.33 
 
 
361 aa  570  1e-161  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1345  chorismate synthase  77.78 
 
 
361 aa  565  1e-160  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.607384  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2593  chorismate synthase  77.5 
 
 
361 aa  565  1e-160  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1453  chorismate synthase  76.94 
 
 
361 aa  565  1e-160  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.71846  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3150  chorismate synthase  71.97 
 
 
373 aa  563  1.0000000000000001e-159  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2877  chorismate synthase  77.22 
 
 
361 aa  555  1e-157  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0472598  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1568  chorismate synthase  71.03 
 
 
364 aa  550  1e-155  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2938  chorismate synthase  71.19 
 
 
369 aa  544  1e-154  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1241  chorismate synthase  70.08 
 
 
366 aa  541  1e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2244  chorismate synthase  70.64 
 
 
365 aa  543  1e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1538  chorismate synthase  70.37 
 
 
366 aa  538  9.999999999999999e-153  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2091  chorismate synthase  68.7 
 
 
371 aa  539  9.999999999999999e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0702  chorismate synthase  72.03 
 
 
366 aa  531  1e-150  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2466  chorismate synthase  68.42 
 
 
361 aa  531  1e-150  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.358807  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1205  chorismate synthase  72.91 
 
 
360 aa  532  1e-150  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0521105  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1226  chorismate synthase  68.98 
 
 
366 aa  533  1e-150  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0161922 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1740  chorismate synthase  69.21 
 
 
368 aa  528  1e-149  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.544591 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1814  chorismate synthase  65.65 
 
 
367 aa  509  1e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0762  chorismate synthase  65.21 
 
 
430 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0691461  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1481  chorismate synthase  65.65 
 
 
369 aa  501  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.470447  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1789  chorismate synthase  66.2 
 
 
366 aa  504  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681987  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0946  chorismate synthase  65.65 
 
 
369 aa  501  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.718045  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2614  chorismate synthase  66.48 
 
 
369 aa  504  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1972  chorismate synthase  65.1 
 
 
363 aa  502  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1833  chorismate synthase  69.53 
 
 
365 aa  504  1e-141  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.306795  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1438  chorismate synthase  70.47 
 
 
363 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0279248 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1640  chorismate synthase  65.1 
 
 
363 aa  502  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000503125 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1713  chorismate synthase  65.65 
 
 
369 aa  501  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193941  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0401  chorismate synthase  65.65 
 
 
369 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1853  chorismate synthase  69.25 
 
 
363 aa  498  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1867  chorismate synthase  65.65 
 
 
369 aa  501  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0797858  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1689  chorismate synthase  65.65 
 
 
369 aa  501  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.537327  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1360  chorismate synthase  65.37 
 
 
366 aa  499  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767963  normal  0.499065 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42760  chorismate synthase  69.36 
 
 
363 aa  498  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1408  chorismate synthase  70.19 
 
 
363 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.231327  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2767  chorismate synthase  64.27 
 
 
366 aa  494  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2043  chorismate synthase  69.36 
 
 
363 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00765141  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1455  chorismate synthase  67.49 
 
 
367 aa  495  1e-139  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.055382  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0858  chorismate synthase  65.1 
 
 
366 aa  494  1e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.52804e-17  unclonable  0.0000000936669 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1722  chorismate synthase  70.47 
 
 
363 aa  495  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1882  chorismate synthase  69.08 
 
 
363 aa  494  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.501466  normal  0.394588 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3591  chorismate synthase  69.36 
 
 
363 aa  495  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1381  chorismate synthase  65.93 
 
 
366 aa  497  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.674702 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1569  chorismate synthase  64.82 
 
 
366 aa  496  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453683  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0978  chorismate synthase  65.65 
 
 
366 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1341  chorismate synthase  66.2 
 
 
366 aa  497  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1460  chorismate synthase  65.65 
 
 
366 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1830  chorismate synthase  69.25 
 
 
363 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.265321  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3074  chorismate synthase  64.82 
 
 
376 aa  492  9.999999999999999e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4605  chorismate synthase  65.37 
 
 
366 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0590951  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3880  chorismate synthase  69.25 
 
 
363 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00247284  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1438  chorismate synthase  65.37 
 
 
366 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1635  chorismate synthase  67.21 
 
 
367 aa  493  9.999999999999999e-139  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0500037  hitchhiker  0.00265035 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0929  chorismate synthase  68.52 
 
 
367 aa  490  1e-137  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000251856  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1657  chorismate synthase  63.99 
 
 
366 aa  491  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112196  normal  0.0287757 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1987  chorismate synthase  63.99 
 
 
366 aa  490  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2995  chorismate synthase  64 
 
 
365 aa  479  1e-134  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.212385 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2745  chorismate synthase  63.43 
 
 
365 aa  478  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0513827 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1257  chorismate synthase  64.27 
 
 
370 aa  479  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.234528  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1076  chorismate synthase  64 
 
 
352 aa  477  1e-133  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.306004  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>