More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1012 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_1012  chorismate synthase  100 
 
 		 366 aa  740    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1438  chorismate synthase  69.86 
 
 		 365 aa  538  9.999999999999999e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0161  chorismate synthase  63.11 
 
 		 373 aa  477  1e-133  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.900075  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3801  chorismate synthase  57.87 
 
 		 364 aa  411  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1952  chorismate synthase  55.9 
 
 		 358 aa  396  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3830  chorismate synthase  56.18 
 
 		 358 aa  397  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0644  chorismate synthase  51.74 
 
 		 377 aa  390  1e-107  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1623  chorismate synthase  52.11 
 
 		 363 aa  381  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0689  chorismate synthase  51.47 
 
 		 373 aa  381  1e-104  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0139341  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4081  chorismate synthase  55.49 
 
 		 356 aa  365  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0439  chorismate synthase  50.28 
 
 		 364 aa  360  2e-98  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.178344  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_405  chorismate synthase  48.88 
 
 		 364 aa  353  2e-96  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.09813  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0462  chorismate synthase  49.16 
 
 		 364 aa  353  4e-96  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.282213  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4112  chorismate synthase  50.42 
 
 		 363 aa  351  8.999999999999999e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356503  normal  0.0141233 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1947  chorismate synthase  55.43 
 
 		 354 aa  351  1e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1361  chorismate synthase  51.84 
 
 		 362 aa  348  6e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.565895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2355  chorismate synthase  53.39 
 
 		 362 aa  348  6e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1637  chorismate synthase  52.82 
 
 		 362 aa  348  7e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1664  chorismate synthase  52.82 
 
 		 362 aa  348  7e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1510  chorismate synthase  50.56 
 
 		 362 aa  347  2e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3093  chorismate synthase  55.06 
 
 		 367 aa  347  2e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000101466  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0547  chorismate synthase  45.03 
 
 		 365 aa  346  4e-94  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0041  chorismate synthase  52.73 
 
 		 351 aa  345  6e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0022126  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1340  chorismate synthase  50.67 
 
 		 386 aa  344  1e-93  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2938  chorismate synthase  49.58 
 
 		 369 aa  344  2e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2171  chorismate synthase  50.99 
 
 		 359 aa  344  2e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3132  chorismate synthase  50.85 
 
 		 357 aa  343  2e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111802  normal  0.087423 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0578  chorismate synthase  51.47 
 
 		 373 aa  343  2e-93  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.778585  normal  0.127119 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1296  chorismate synthase  50.99 
 
 		 334 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.576188  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0369  chorismate synthase  49.04 
 
 		 360 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0589  chorismate synthase  52.26 
 
 		 362 aa  342  5.999999999999999e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1702  chorismate synthase  48.66 
 
 		 384 aa  342  9e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1537  chorismate synthase  50 
 
 		 364 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2168  chorismate synthase  49.01 
 
 		 361 aa  336  2.9999999999999997e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002863  chorismate synthase  49.01 
 
 		 361 aa  335  5.999999999999999e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1282  chorismate synthase  50.69 
 
 		 391 aa  334  1e-90  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2769  chorismate synthase  50.14 
 
 		 364 aa  334  2e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.116753  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03114  chorismate synthase  48.73 
 
 		 384 aa  334  2e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1607  chorismate synthase  50.14 
 
 		 364 aa  333  2e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  normal  0.360545 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2752  chorismate synthase  50.14 
 
 		 364 aa  334  2e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.200726  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2846  chorismate synthase  50.14 
 
 		 364 aa  334  2e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000803726 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2159  chorismate synthase  48.5 
 
 		 365 aa  333  2e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2090  chorismate synthase  50.99 
 
 		 354 aa  333  3e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0281395  normal  0.0647066 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2866  chorismate synthase  50.56 
 
 		 370 aa  332  6e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3150  chorismate synthase  50.69 
 
 		 373 aa  332  7.000000000000001e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2451  chorismate synthase  49.58 
 
 		 364 aa  331  1e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02451  chorismate synthase  48.73 
 
 		 365 aa  331  1e-89  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.642724  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0835  chorismate synthase  51.69 
 
 		 362 aa  331  1e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0823  chorismate synthase  48.16 
 
 		 360 aa  331  1e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2091  chorismate synthase  48.08 
 
 		 371 aa  330  2e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0212  chorismate synthase  50.56 
 
 		 362 aa  330  3e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.468689 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02461  chorismate synthase  48.44 
 
 		 365 aa  329  5.0000000000000004e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2667  chorismate synthase  50.42 
 
 		 364 aa  328  7e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0260  chorismate synthase  50.94 
 
 		 373 aa  328  8e-89  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1974  chorismate synthase  50.29 
 
 		 358 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3438  chorismate synthase  47.61 
 
 		 360 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000199375 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1538  chorismate synthase  49.16 
 
 		 366 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02471  chorismate synthase  48.59 
 
 		 363 aa  327  2.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5072  chorismate synthase  48.86 
 
 		 359 aa  327  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1568  chorismate synthase  47.89 
 
 		 364 aa  327  2.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1564  chorismate synthase  51.14 
 
 		 328 aa  326  3e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0846  chorismate synthase  49.03 
 
 		 371 aa  327  3e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.742224 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4064  chorismate synthase  48.73 
 
 		 359 aa  327  3e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000659407  hitchhiker  0.000000405427 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02561  chorismate synthase  47.01 
 
 		 364 aa  326  4.0000000000000003e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.46541  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02755  chorismate synthase  49.16 
 
 		 365 aa  326  4.0000000000000003e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0341392  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2149  chorismate synthase  49.03 
 
 		 355 aa  326  5e-88  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0529344  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2023  chorismate synthase  49.14 
 
 		 358 aa  325  6e-88  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11018  chorismate synthase  48.02 
 
 		 354 aa  323  2e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4576  chorismate synthase  47.88 
 
 		 352 aa  324  2e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2470  chorismate synthase  47.78 
 
 		 361 aa  324  2e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1114  chorismate synthase  43.62 
 
 		 395 aa  323  3e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1408  chorismate synthase  49.16 
 
 		 353 aa  323  3e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.422248 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0226  chorismate synthase  47.59 
 
 		 365 aa  323  3e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1314  chorismate synthase  47.78 
 
 		 361 aa  323  3e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0530  chorismate synthase  47.35 
 
 		 365 aa  323  3e-87  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.910862  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1327  Chorismate synthase  51.68 
 
 		 361 aa  323  4e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.54496  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2481  chorismate synthase  51.68 
 
 		 361 aa  323  4e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2877  chorismate synthase  50.84 
 
 		 361 aa  322  6e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0472598  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2466  chorismate synthase  47.18 
 
 		 361 aa  322  7e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.358807  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02254  chorismate synthase  51.4 
 
 		 361 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3470  chorismate synthase  51.4 
 
 		 361 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2486  chorismate synthase  51.4 
 
 		 361 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2624  chorismate synthase  51.4 
 
 		 361 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2797  chorismate synthase  47.32 
 
 		 368 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2119  chorismate synthase  48.08 
 
 		 368 aa  321  9.999999999999999e-87  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1323  chorismate synthase  51.4 
 
 		 361 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02214  hypothetical protein  51.4 
 
 		 361 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0770  chorismate synthase  46.49 
 
 		 366 aa  321  9.999999999999999e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.742046  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1226  chorismate synthase  48.74 
 
 		 366 aa  320  1.9999999999999998e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0161922 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2222  chorismate synthase  49.01 
 
 		 352 aa  320  3e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2251  chorismate synthase  48.73 
 
 		 352 aa  319  5e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1018  chorismate synthase  47.61 
 
 		 362 aa  319  5e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03041  chorismate synthase  50 
 
 		 361 aa  318  7.999999999999999e-86  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.418255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0392  chorismate synthase  49.72 
 
 		 390 aa  318  1e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0629  chorismate synthase  46.85 
 
 		 368 aa  317  1e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3017  chorismate synthase  50.7 
 
 		 364 aa  318  1e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.503026  normal  0.557092 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1868  chorismate synthase  47.65 
 
 		 373 aa  318  1e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.423516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2819  chorismate synthase  48.49 
 
 		 370 aa  317  2e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0159117  normal  0.634482 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1541  chorismate synthase  46.35 
 
 		 366 aa  317  2e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0858  chorismate synthase  48.6 
 
 		 366 aa  317  3e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.52804e-17  unclonable  0.0000000936669 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>