More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0823 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3438  chorismate synthase  94.72 
 
 		 360 aa  690    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000199375 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0823  chorismate synthase  100 
 
 		 360 aa  730    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02650  chorismate synthase, putative  61.33 
 
 		 421 aa  463  1e-129  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05731  chorismate synthase (Eurofung)  60.1 
 
 		 410 aa  447  1.0000000000000001e-124  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.430078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90939  Chorismate synthase  61.04 
 
 		 377 aa  431  1e-119  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.352684 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1664  chorismate synthase  59.94 
 
 		 362 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1637  chorismate synthase  59.94 
 
 		 362 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02451  chorismate synthase  55.21 
 
 		 365 aa  420  1e-116  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.642724  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02461  chorismate synthase  54.93 
 
 		 365 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02561  chorismate synthase  55.59 
 
 		 364 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.46541  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0226  chorismate synthase  54.93 
 
 		 365 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1623  chorismate synthase  59.27 
 
 		 363 aa  415  9.999999999999999e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2355  chorismate synthase  58.45 
 
 		 362 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0212  chorismate synthase  59.66 
 
 		 362 aa  413  1e-114  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.468689 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4112  chorismate synthase  60.45 
 
 		 363 aa  408  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356503  normal  0.0141233 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1361  chorismate synthase  58.47 
 
 		 362 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.565895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23791  chorismate synthase  56.86 
 
 		 362 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0240204 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0589  chorismate synthase  57.06 
 
 		 362 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2866  chorismate synthase  57.58 
 
 		 370 aa  403  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0304  chorismate synthase  56.42 
 
 		 366 aa  392  1e-108  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.21806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02471  chorismate synthase  55.74 
 
 		 363 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0835  chorismate synthase  56.46 
 
 		 362 aa  390  1e-107  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2040  chorismate synthase  56.15 
 
 		 364 aa  390  1e-107  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1593  chorismate synthase  55.34 
 
 		 361 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.040702  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03041  chorismate synthase  55.9 
 
 		 361 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.418255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29930  predicted protein  57.46 
 
 		 458 aa  384  1e-105  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0369  chorismate synthase  52.66 
 
 		 360 aa  379  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43429  chorismate synthase  55.71 
 
 		 442 aa  377  1e-103  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0435185  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1897  chorismate synthase  55.9 
 
 		 361 aa  377  1e-103  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5072  chorismate synthase  53.5 
 
 		 359 aa  358  7e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1952  chorismate synthase  51.13 
 
 		 358 aa  358  9.999999999999999e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1438  chorismate synthase  51.12 
 
 		 365 aa  355  5e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4064  chorismate synthase  53.07 
 
 		 359 aa  354  1e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000659407  hitchhiker  0.000000405427 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0161  chorismate synthase  50.27 
 
 		 373 aa  354  1e-96  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.900075  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1510  chorismate synthase  52.1 
 
 		 362 aa  352  4e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3830  chorismate synthase  50 
 
 		 358 aa  352  8e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2149  chorismate synthase  52.99 
 
 		 355 aa  348  7e-95  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0529344  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4576  chorismate synthase  51.56 
 
 		 352 aa  348  1e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11018  chorismate synthase  49.16 
 
 		 354 aa  342  5e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3801  chorismate synthase  49.44 
 
 		 364 aa  338  7e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1012  chorismate synthase  48.16 
 
 		 366 aa  331  1e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2251  chorismate synthase  48.04 
 
 		 352 aa  327  2.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2222  chorismate synthase  48.04 
 
 		 352 aa  327  2.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03114  chorismate synthase  46.74 
 
 		 384 aa  326  4.0000000000000003e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1538  chorismate synthase  46.46 
 
 		 366 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002863  chorismate synthase  47.03 
 
 		 361 aa  325  5e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1814  chorismate synthase  50.71 
 
 		 367 aa  322  7e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2168  chorismate synthase  46.74 
 
 		 361 aa  322  9.000000000000001e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1740  chorismate synthase  49.29 
 
 		 368 aa  321  9.999999999999999e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.544591 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02755  chorismate synthase  47.03 
 
 		 365 aa  320  1.9999999999999998e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0341392  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3150  chorismate synthase  47.21 
 
 		 373 aa  320  3e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1702  chorismate synthase  46.49 
 
 		 384 aa  318  7e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0644  chorismate synthase  43.72 
 
 		 377 aa  318  1e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2159  chorismate synthase  45.81 
 
 		 365 aa  317  1e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2938  chorismate synthase  47.88 
 
 		 369 aa  317  2e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1568  chorismate synthase  46.18 
 
 		 364 aa  316  5e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1541  chorismate synthase  45.89 
 
 		 366 aa  316  5e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1018  chorismate synthase  44.76 
 
 		 362 aa  315  8e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1076  chorismate synthase  46.33 
 
 		 352 aa  314  9.999999999999999e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.306004  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0938  chorismate synthase  46.33 
 
 		 352 aa  315  9.999999999999999e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.464022  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4081  chorismate synthase  47.46 
 
 		 356 aa  314  1.9999999999999998e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0439  chorismate synthase  44.94 
 
 		 364 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.178344  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1657  chorismate synthase  46.46 
 
 		 366 aa  312  5.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112196  normal  0.0287757 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1438  chorismate synthase  47.03 
 
 		 366 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0666  chorismate synthase  47.88 
 
 		 366 aa  312  6.999999999999999e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0639836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0978  chorismate synthase  47.03 
 
 		 366 aa  311  9e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1226  chorismate synthase  48.44 
 
 		 366 aa  311  9e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0161922 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1460  chorismate synthase  47.03 
 
 		 366 aa  311  9e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1987  chorismate synthase  46.46 
 
 		 366 aa  311  1e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2466  chorismate synthase  47.31 
 
 		 361 aa  311  1e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.358807  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1972  chorismate synthase  46.78 
 
 		 363 aa  311  2e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1640  chorismate synthase  46.78 
 
 		 363 aa  311  2e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503125 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1699  chorismate synthase  47.59 
 
 		 361 aa  310  2.9999999999999997e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4605  chorismate synthase  47.03 
 
 		 366 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0590951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2767  chorismate synthase  46.74 
 
 		 366 aa  309  4e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02254  chorismate synthase  49.01 
 
 		 361 aa  309  5e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1327  Chorismate synthase  48.73 
 
 		 361 aa  309  5e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.54496  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3470  chorismate synthase  49.01 
 
 		 361 aa  309  5e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1323  chorismate synthase  49.01 
 
 		 361 aa  309  5e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2486  chorismate synthase  49.01 
 
 		 361 aa  309  5e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02214  hypothetical protein  49.01 
 
 		 361 aa  309  5e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2481  chorismate synthase  48.73 
 
 		 361 aa  309  5e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2624  chorismate synthase  49.01 
 
 		 361 aa  309  5e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0858  chorismate synthase  46.46 
 
 		 366 aa  309  5.9999999999999995e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.52804e-17  unclonable  0.0000000936669 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1789  chorismate synthase  46.46 
 
 		 366 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1360  chorismate synthase  46.18 
 
 		 366 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767963  normal  0.499065 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0401  chorismate synthase  45.89 
 
 		 369 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1525  chorismate synthase  47.03 
 
 		 385 aa  308  1.0000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0632175 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1569  chorismate synthase  45.89 
 
 		 366 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453683  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0946  chorismate synthase  45.89 
 
 		 369 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.718045  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1481  chorismate synthase  45.89 
 
 		 369 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.470447  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2769  chorismate synthase  44.69 
 
 		 364 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.116753  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2846  chorismate synthase  44.69 
 
 		 364 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000803726 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2752  chorismate synthase  44.69 
 
 		 364 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.200726  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1607  chorismate synthase  44.69 
 
 		 364 aa  306  3e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  normal  0.360545 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0762  chorismate synthase  45.89 
 
 		 430 aa  306  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0691461  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2614  chorismate synthase  45.89 
 
 		 369 aa  306  3e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2707  chorismate synthase  48.73 
 
 		 361 aa  306  3e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1537  chorismate synthase  44.69 
 
 		 364 aa  306  3e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2667  chorismate synthase  44.97 
 
 		 364 aa  306  3e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>