More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1897 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1897  chorismate synthase  100 
 
 		 361 aa  741    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4112  chorismate synthase  61.71 
 
 		 363 aa  443  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356503  normal  0.0141233 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1361  chorismate synthase  61.45 
 
 		 362 aa  443  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.565895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1637  chorismate synthase  60.5 
 
 		 362 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0589  chorismate synthase  60.17 
 
 		 362 aa  439  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2355  chorismate synthase  61.56 
 
 		 362 aa  439  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1664  chorismate synthase  60.5 
 
 		 362 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0835  chorismate synthase  61 
 
 		 362 aa  434  1e-121  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1623  chorismate synthase  58.1 
 
 		 363 aa  432  1e-120  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0212  chorismate synthase  62.5 
 
 		 362 aa  433  1e-120  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.468689 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02461  chorismate synthase  57.22 
 
 		 365 aa  431  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02451  chorismate synthase  57.5 
 
 		 365 aa  431  1e-119  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.642724  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02471  chorismate synthase  58.29 
 
 		 363 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02561  chorismate synthase  56.11 
 
 		 364 aa  424  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.46541  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0226  chorismate synthase  56.47 
 
 		 365 aa  427  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2866  chorismate synthase  59.33 
 
 		 370 aa  424  1e-117  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0369  chorismate synthase  54.85 
 
 		 360 aa  413  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03041  chorismate synthase  59.61 
 
 		 361 aa  414  1e-114  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.418255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43429  chorismate synthase  59.56 
 
 		 442 aa  410  1e-113  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0435185  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29930  predicted protein  61.28 
 
 		 458 aa  409  1e-113  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1593  chorismate synthase  58.77 
 
 		 361 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.040702  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23791  chorismate synthase  57.46 
 
 		 362 aa  402  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0240204 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0304  chorismate synthase  58.52 
 
 		 366 aa  402  1e-111  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.21806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0823  chorismate synthase  55.9 
 
 		 360 aa  395  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2040  chorismate synthase  58.24 
 
 		 364 aa  396  1e-109  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3438  chorismate synthase  55.28 
 
 		 360 aa  393  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000199375 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4064  chorismate synthase  53.89 
 
 		 359 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000659407  hitchhiker  0.000000405427 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5072  chorismate synthase  55.77 
 
 		 359 aa  380  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1510  chorismate synthase  54.17 
 
 		 362 aa  377  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1952  chorismate synthase  52.51 
 
 		 358 aa  366  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2149  chorismate synthase  51.41 
 
 		 355 aa  365  1e-100  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0529344  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3830  chorismate synthase  51.12 
 
 		 358 aa  360  3e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02650  chorismate synthase, putative  51.06 
 
 		 421 aa  359  3e-98  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11018  chorismate synthase  49.3 
 
 		 354 aa  360  3e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3801  chorismate synthase  51.4 
 
 		 364 aa  356  2.9999999999999997e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1438  chorismate synthase  50.71 
 
 		 365 aa  355  5e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90939  Chorismate synthase  51.62 
 
 		 377 aa  355  5e-97  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.352684 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0161  chorismate synthase  50.14 
 
 		 373 aa  355  7.999999999999999e-97  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.900075  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4576  chorismate synthase  49.15 
 
 		 352 aa  353  2e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4081  chorismate synthase  52.23 
 
 		 356 aa  345  1e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05731  chorismate synthase (Eurofung)  48.2 
 
 		 410 aa  335  5e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.430078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1012  chorismate synthase  48.44 
 
 		 366 aa  335  1e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1226  chorismate synthase  45.94 
 
 		 366 aa  329  4e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0161922 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1408  chorismate synthase  48.74 
 
 		 353 aa  328  8e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.422248 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02755  chorismate synthase  46.22 
 
 		 365 aa  328  1.0000000000000001e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0341392  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2168  chorismate synthase  46.5 
 
 		 361 aa  326  3e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3132  chorismate synthase  47.63 
 
 		 357 aa  326  5e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111802  normal  0.087423 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1814  chorismate synthase  48.04 
 
 		 367 aa  325  9e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002863  chorismate synthase  45.94 
 
 		 361 aa  323  4e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1541  chorismate synthase  45.53 
 
 		 366 aa  322  6e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2938  chorismate synthase  46.5 
 
 		 369 aa  322  9.000000000000001e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2090  chorismate synthase  47.74 
 
 		 354 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0281395  normal  0.0647066 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03114  chorismate synthase  45.38 
 
 		 384 aa  320  1.9999999999999998e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1702  chorismate synthase  46.36 
 
 		 384 aa  320  3e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3150  chorismate synthase  45.6 
 
 		 373 aa  319  3.9999999999999996e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2251  chorismate synthase  46.63 
 
 		 352 aa  317  3e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2222  chorismate synthase  46.35 
 
 		 352 aa  317  3e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1538  chorismate synthase  45.38 
 
 		 366 aa  316  4e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1568  chorismate synthase  45.38 
 
 		 364 aa  316  5e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2244  chorismate synthase  43.3 
 
 		 365 aa  314  9.999999999999999e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0041  chorismate synthase  51.28 
 
 		 351 aa  312  5.999999999999999e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0022126  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3093  chorismate synthase  47.31 
 
 		 367 aa  311  7.999999999999999e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000101466  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1296  chorismate synthase  46.8 
 
 		 334 aa  311  1e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.576188  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1699  chorismate synthase  47.62 
 
 		 361 aa  310  2e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1640  chorismate synthase  46.65 
 
 		 363 aa  310  2e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503125 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1537  chorismate synthase  44.66 
 
 		 364 aa  310  2e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1972  chorismate synthase  46.65 
 
 		 363 aa  310  2e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0858  chorismate synthase  44.94 
 
 		 366 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.52804e-17  unclonable  0.0000000936669 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2091  chorismate synthase  44.13 
 
 		 371 aa  310  2.9999999999999997e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2769  chorismate synthase  45.51 
 
 		 364 aa  310  4e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.116753  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2752  chorismate synthase  45.51 
 
 		 364 aa  310  4e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.200726  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1607  chorismate synthase  45.51 
 
 		 364 aa  310  4e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  normal  0.360545 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2846  chorismate synthase  45.51 
 
 		 364 aa  310  4e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000803726 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0009  chorismate synthase  48.31 
 
 		 356 aa  309  5e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1018  chorismate synthase  44.66 
 
 		 362 aa  309  5e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2451  chorismate synthase  45.51 
 
 		 364 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1740  chorismate synthase  45.25 
 
 		 368 aa  308  6.999999999999999e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.544591 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2159  chorismate synthase  44.94 
 
 		 365 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1212  chorismate synthase  45.48 
 
 		 361 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.535517 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1947  chorismate synthase  47.75 
 
 		 354 aa  306  3e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1514  chorismate synthase  47.34 
 
 		 361 aa  306  4.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.85122  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0377  chorismate synthase  47.34 
 
 		 361 aa  306  4.0000000000000004e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1405  chorismate synthase  47.34 
 
 		 361 aa  306  4.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.47258  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1205  chorismate synthase  45.48 
 
 		 360 aa  306  4.0000000000000004e-82  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0521105  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2667  chorismate synthase  44.94 
 
 		 364 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1314  chorismate synthase  45.21 
 
 		 361 aa  305  7e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0659  chorismate synthase  47.63 
 
 		 358 aa  305  8.000000000000001e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.463158  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4332  chorismate synthase  46.52 
 
 		 366 aa  305  1.0000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.259213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0644  chorismate synthase  41.6 
 
 		 377 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3374  chorismate synthase  45.94 
 
 		 361 aa  303  3.0000000000000004e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1394  chorismate synthase  45.21 
 
 		 362 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187693  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4138  chorismate synthase  44.66 
 
 		 370 aa  302  5.000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0341634 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1833  chorismate synthase  46.91 
 
 		 365 aa  302  8.000000000000001e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.306795  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1241  chorismate synthase  44.26 
 
 		 366 aa  301  9e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2877  chorismate synthase  45.13 
 
 		 361 aa  301  1e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0472598  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3275  chorismate synthase  46.8 
 
 		 367 aa  301  1e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0702  chorismate synthase  44.82 
 
 		 366 aa  301  2e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2466  chorismate synthase  43.85 
 
 		 361 aa  300  2e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.358807  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2757  chorismate synthase  45.21 
 
 		 366 aa  300  4e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0933744 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2797  chorismate synthase  42.42 
 
 		 368 aa  299  6e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>