More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0462 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0462  chorismate synthase  100 
 
 		 364 aa  742    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.282213  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_405  chorismate synthase  96.98 
 
 		 364 aa  723    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.09813  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0439  chorismate synthase  92.86 
 
 		 364 aa  694    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.178344  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0547  chorismate synthase  49.86 
 
 		 365 aa  376  1e-103  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1438  chorismate synthase  50.14 
 
 		 365 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0161  chorismate synthase  49.04 
 
 		 373 aa  358  8e-98  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.900075  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1012  chorismate synthase  49.16 
 
 		 366 aa  353  4e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0689  chorismate synthase  46.07 
 
 		 373 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0139341  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0530  chorismate synthase  45.05 
 
 		 365 aa  326  5e-88  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.910862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3801  chorismate synthase  47.31 
 
 		 364 aa  321  9.999999999999999e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1623  chorismate synthase  45.63 
 
 		 363 aa  320  3e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2119  chorismate synthase  46.37 
 
 		 368 aa  317  3e-85  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0691  chorismate synthase  42.82 
 
 		 357 aa  310  2e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0522046  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0690  chorismate synthase  42.82 
 
 		 357 aa  310  2.9999999999999997e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140082  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3830  chorismate synthase  45.33 
 
 		 358 aa  309  4e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0644  chorismate synthase  43.67 
 
 		 377 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0823  chorismate synthase  44.66 
 
 		 360 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10150  chorismate synthase  46.54 
 
 		 362 aa  304  1.0000000000000001e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.107827  hitchhiker  0.00000077932 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1649  chorismate synthase  46.52 
 
 		 357 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0108012 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0879  chorismate synthase  45.25 
 
 		 368 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1282  chorismate synthase  44.29 
 
 		 391 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1763  chorismate synthase  44.97 
 
 		 365 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02561  chorismate synthase  44.38 
 
 		 364 aa  302  6.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.46541  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0369  chorismate synthase  43.73 
 
 		 360 aa  300  3e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02451  chorismate synthase  43.54 
 
 		 365 aa  300  4e-80  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.642724  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1952  chorismate synthase  45.2 
 
 		 358 aa  299  6e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02461  chorismate synthase  43.54 
 
 		 365 aa  298  8e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3438  chorismate synthase  44.66 
 
 		 360 aa  297  2e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000199375 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11018  chorismate synthase  45.45 
 
 		 354 aa  297  2e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1637  chorismate synthase  45.51 
 
 		 362 aa  296  3e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1664  chorismate synthase  45.51 
 
 		 362 aa  296  3e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2149  chorismate synthase  44.19 
 
 		 355 aa  294  1e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0529344  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2355  chorismate synthase  46.35 
 
 		 362 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02471  chorismate synthase  45.56 
 
 		 363 aa  294  2e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4576  chorismate synthase  44.51 
 
 		 352 aa  293  3e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0780  chorismate synthase  44.29 
 
 		 365 aa  293  3e-78  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.151802  normal  0.220812 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4112  chorismate synthase  45 
 
 		 363 aa  293  3e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356503  normal  0.0141233 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0226  chorismate synthase  43.54 
 
 		 365 aa  293  4e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0212  chorismate synthase  46.78 
 
 		 362 aa  292  5e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.468689 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0589  chorismate synthase  46.52 
 
 		 362 aa  292  8e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3093  chorismate synthase  47.6 
 
 		 367 aa  291  1e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000101466  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1702  chorismate synthase  43.28 
 
 		 384 aa  290  3e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1010  chorismate synthase  40.77 
 
 		 369 aa  290  3e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0494741  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1943  chorismate synthase  44.75 
 
 		 332 aa  288  9e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4081  chorismate synthase  45.33 
 
 		 356 aa  288  1e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1361  chorismate synthase  44.51 
 
 		 362 aa  287  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.565895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5072  chorismate synthase  43.66 
 
 		 359 aa  287  2.9999999999999996e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2866  chorismate synthase  44.66 
 
 		 370 aa  281  1e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4064  chorismate synthase  44.29 
 
 		 359 aa  280  2e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000659407  hitchhiker  0.000000405427 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2420  chorismate synthase  43.33 
 
 		 366 aa  280  3e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0349388  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0835  chorismate synthase  45.83 
 
 		 362 aa  279  6e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1510  chorismate synthase  44.54 
 
 		 362 aa  278  7e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02755  chorismate synthase  44.41 
 
 		 365 aa  278  1e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0341392  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03041  chorismate synthase  43.54 
 
 		 361 aa  277  2e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.418255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1593  chorismate synthase  43.54 
 
 		 361 aa  277  2e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.040702  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0732  chorismate synthase  42.05 
 
 		 394 aa  276  3e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0075518  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0578  chorismate synthase  43.09 
 
 		 373 aa  277  3e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.778585  normal  0.127119 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0041  chorismate synthase  47.29 
 
 		 351 aa  276  4e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0022126  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23791  chorismate synthase  43.42 
 
 		 362 aa  275  8e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0240204 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90939  Chorismate synthase  42.58 
 
 		 377 aa  275  8e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.352684 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2090  chorismate synthase  44.48 
 
 		 354 aa  275  9e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0281395  normal  0.0647066 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1340  chorismate synthase  41.73 
 
 		 386 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2466  chorismate synthase  42.37 
 
 		 361 aa  273  5.000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.358807  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1541  chorismate synthase  42.66 
 
 		 366 aa  272  7e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1314  chorismate synthase  45.25 
 
 		 368 aa  271  2e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1360  chorismate synthase  43.5 
 
 		 366 aa  270  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767963  normal  0.499065 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1947  chorismate synthase  46.74 
 
 		 354 aa  271  2e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2938  chorismate synthase  42.21 
 
 		 369 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1897  chorismate synthase  42.98 
 
 		 361 aa  270  4e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2427  chorismate synthase  39.47 
 
 		 392 aa  269  5e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00147882  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1814  chorismate synthase  43.63 
 
 		 367 aa  269  7e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1408  chorismate synthase  43.66 
 
 		 353 aa  269  7e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.422248 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1568  chorismate synthase  42.13 
 
 		 364 aa  268  8.999999999999999e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2168  chorismate synthase  41.36 
 
 		 361 aa  268  1e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1873  chorismate synthase  44.2 
 
 		 390 aa  267  2e-70  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.485609 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1640  chorismate synthase  41.36 
 
 		 363 aa  267  2e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503125 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1972  chorismate synthase  41.36 
 
 		 363 aa  267  2e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0260  chorismate synthase  42.01 
 
 		 373 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1789  chorismate synthase  42.7 
 
 		 366 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0304  chorismate synthase  43.37 
 
 		 366 aa  265  7e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.21806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2171  chorismate synthase  42.17 
 
 		 359 aa  265  1e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2767  chorismate synthase  42.66 
 
 		 366 aa  265  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1974  chorismate synthase  44.48 
 
 		 358 aa  264  2e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1564  chorismate synthase  45.3 
 
 		 328 aa  263  3e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1381  chorismate synthase  42.78 
 
 		 366 aa  263  4e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.674702 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2091  chorismate synthase  40.85 
 
 		 371 aa  263  4e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2040  chorismate synthase  43.65 
 
 		 364 aa  263  4.999999999999999e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1569  chorismate synthase  42.37 
 
 		 366 aa  262  6e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29930  predicted protein  42.33 
 
 		 458 aa  262  6.999999999999999e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1537  chorismate synthase  41.57 
 
 		 364 aa  262  8e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4605  chorismate synthase  42.13 
 
 		 366 aa  261  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0590951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0978  chorismate synthase  41.85 
 
 		 366 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1460  chorismate synthase  41.85 
 
 		 366 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1438  chorismate synthase  41.85 
 
 		 366 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002863  chorismate synthase  40.79 
 
 		 361 aa  260  3e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1538  chorismate synthase  39.89 
 
 		 366 aa  260  3e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1657  chorismate synthase  40.96 
 
 		 366 aa  260  3e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112196  normal  0.0287757 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1987  chorismate synthase  40.96 
 
 		 366 aa  260  3e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1341  chorismate synthase  41.85 
 
 		 366 aa  260  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2251  chorismate synthase  42.21 
 
 		 352 aa  259  4e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>