More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2119 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_2119  chorismate synthase  100 
 
 		 368 aa  741    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1763  chorismate synthase  80.49 
 
 		 365 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0879  chorismate synthase  76.9 
 
 		 368 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0780  chorismate synthase  80.17 
 
 		 365 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.151802  normal  0.220812 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0530  chorismate synthase  62.33 
 
 		 365 aa  471  1e-132  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.910862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0161  chorismate synthase  47.66 
 
 		 373 aa  335  7.999999999999999e-91  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.900075  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1012  chorismate synthase  48.08 
 
 		 366 aa  334  1e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1438  chorismate synthase  48.74 
 
 		 365 aa  332  8e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0462  chorismate synthase  46.37 
 
 		 364 aa  329  4e-89  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.282213  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1282  chorismate synthase  49.02 
 
 		 391 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_405  chorismate synthase  45.81 
 
 		 364 aa  322  8e-87  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.09813  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0439  chorismate synthase  45.13 
 
 		 364 aa  317  2e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.178344  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1873  chorismate synthase  49.86 
 
 		 390 aa  299  7e-80  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.485609 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0644  chorismate synthase  41.13 
 
 		 377 aa  287  2e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0547  chorismate synthase  41.06 
 
 		 365 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0689  chorismate synthase  42.28 
 
 		 373 aa  280  2e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0139341  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3801  chorismate synthase  44.85 
 
 		 364 aa  280  2e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1623  chorismate synthase  41.93 
 
 		 363 aa  270  2e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1408  chorismate synthase  46.61 
 
 		 353 aa  267  2e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.422248 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0691  chorismate synthase  40.06 
 
 		 357 aa  267  2e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0522046  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2090  chorismate synthase  46.15 
 
 		 354 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0281395  normal  0.0647066 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1952  chorismate synthase  43.33 
 
 		 358 aa  267  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0690  chorismate synthase  40.06 
 
 		 357 aa  266  4e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140082  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5072  chorismate synthase  43.82 
 
 		 359 aa  266  5.999999999999999e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0041  chorismate synthase  47.86 
 
 		 351 aa  259  8e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0022126  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2938  chorismate synthase  43.82 
 
 		 369 aa  258  1e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3830  chorismate synthase  41.83 
 
 		 358 aa  258  2e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1340  chorismate synthase  42.05 
 
 		 386 aa  256  5e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0369  chorismate synthase  40 
 
 		 360 aa  255  7e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1702  chorismate synthase  42.74 
 
 		 384 aa  255  7e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1296  chorismate synthase  43.02 
 
 		 334 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.576188  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4081  chorismate synthase  45.04 
 
 		 356 aa  255  1.0000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1943  chorismate synthase  42.47 
 
 		 332 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1568  chorismate synthase  42.7 
 
 		 364 aa  253  5.000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1947  chorismate synthase  45.94 
 
 		 354 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0212  chorismate synthase  44.97 
 
 		 362 aa  251  1e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.468689 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3161  chorismate synthase  43.38 
 
 		 364 aa  251  1e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2168  chorismate synthase  42.49 
 
 		 361 aa  251  1e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2420  chorismate synthase  42.9 
 
 		 366 aa  251  2e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0349388  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1607  chorismate synthase  42.16 
 
 		 364 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  normal  0.360545 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2752  chorismate synthase  41.85 
 
 		 364 aa  250  2e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.200726  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002863  chorismate synthase  41.08 
 
 		 361 aa  250  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2769  chorismate synthase  41.85 
 
 		 364 aa  250  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.116753  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2846  chorismate synthase  41.85 
 
 		 364 aa  250  2e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000803726 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03114  chorismate synthase  41.08 
 
 		 384 aa  250  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4112  chorismate synthase  43.42 
 
 		 363 aa  249  5e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356503  normal  0.0141233 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2470  chorismate synthase  43.25 
 
 		 361 aa  249  6e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1740  chorismate synthase  42.82 
 
 		 368 aa  249  7e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.544591 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02755  chorismate synthase  41.58 
 
 		 365 aa  248  1e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0341392  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2451  chorismate synthase  41.89 
 
 		 364 aa  248  1e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1434  chorismate synthase  42.54 
 
 		 383 aa  248  1e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1010  chorismate synthase  38.66 
 
 		 369 aa  248  1e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0494741  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2466  chorismate synthase  41.85 
 
 		 361 aa  248  1e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.358807  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2573  chorismate synthase  44.19 
 
 		 361 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2626  chorismate synthase  44.19 
 
 		 361 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000317199 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0578  chorismate synthase  40.97 
 
 		 373 aa  248  1e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.778585  normal  0.127119 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1212  chorismate synthase  42.58 
 
 		 361 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.535517 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1360  chorismate synthase  44.1 
 
 		 366 aa  248  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767963  normal  0.499065 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11018  chorismate synthase  39.72 
 
 		 354 aa  246  3e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1664  chorismate synthase  43.42 
 
 		 362 aa  246  3e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1510  chorismate synthase  43.37 
 
 		 362 aa  247  3e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1637  chorismate synthase  43.42 
 
 		 362 aa  246  3e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2737  chorismate synthase  44.07 
 
 		 361 aa  246  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2524  chorismate synthase  44.07 
 
 		 361 aa  246  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0589  chorismate synthase  44.26 
 
 		 362 aa  246  4e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2613  chorismate synthase  44.07 
 
 		 361 aa  246  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.730292  normal  0.55052 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1226  chorismate synthase  42.82 
 
 		 366 aa  246  4e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0161922 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2355  chorismate synthase  43.42 
 
 		 362 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0260  chorismate synthase  42.36 
 
 		 373 aa  246  6e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0823  chorismate synthase  42.15 
 
 		 360 aa  245  8e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02254  chorismate synthase  43.63 
 
 		 361 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1327  Chorismate synthase  43.63 
 
 		 361 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.54496  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2486  chorismate synthase  43.63 
 
 		 361 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1569  chorismate synthase  43.54 
 
 		 366 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1649  chorismate synthase  40.5 
 
 		 357 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0108012 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02214  hypothetical protein  43.63 
 
 		 361 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3470  chorismate synthase  43.63 
 
 		 361 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2481  chorismate synthase  43.63 
 
 		 361 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1323  chorismate synthase  43.63 
 
 		 361 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1814  chorismate synthase  43.66 
 
 		 367 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1564  chorismate synthase  44.03 
 
 		 328 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2624  chorismate synthase  43.63 
 
 		 361 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0401  chorismate synthase  42.21 
 
 		 369 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1537  chorismate synthase  41.97 
 
 		 364 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2667  chorismate synthase  40.49 
 
 		 364 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2159  chorismate synthase  42.21 
 
 		 365 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0762  chorismate synthase  42.21 
 
 		 430 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0691461  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0835  chorismate synthase  43.98 
 
 		 362 aa  243  3e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1689  chorismate synthase  42.98 
 
 		 369 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.537327  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1481  chorismate synthase  42.21 
 
 		 369 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.470447  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0946  chorismate synthase  42.21 
 
 		 369 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.718045  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1867  chorismate synthase  42.98 
 
 		 369 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0797858  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2614  chorismate synthase  42.98 
 
 		 369 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1713  chorismate synthase  42.98 
 
 		 369 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193941  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1699  chorismate synthase  42.78 
 
 		 361 aa  243  3.9999999999999997e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1541  chorismate synthase  41.36 
 
 		 366 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4576  chorismate synthase  40.17 
 
 		 352 aa  243  5e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2387  chorismate synthase  41.55 
 
 		 383 aa  243  5e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10150  chorismate synthase  38.94 
 
 		 362 aa  243  5e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.107827  hitchhiker  0.00000077932 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2023  chorismate synthase  43.47 
 
 		 358 aa  243  5e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>