More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0691 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0690  chorismate synthase  98.6 
 
 		 357 aa  704    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140082  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0691  chorismate synthase  100 
 
 		 357 aa  716    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0522046  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1010  chorismate synthase  55 
 
 		 369 aa  376  1e-103  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0494741  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2420  chorismate synthase  54.34 
 
 		 366 aa  369  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0349388  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10150  chorismate synthase  45.01 
 
 		 362 aa  348  1e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.107827  hitchhiker  0.00000077932 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0547  chorismate synthase  45.63 
 
 		 365 aa  332  6e-90  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0439  chorismate synthase  44.13 
 
 		 364 aa  317  2e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.178344  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_405  chorismate synthase  44.13 
 
 		 364 aa  314  9.999999999999999e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.09813  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0462  chorismate synthase  42.82 
 
 		 364 aa  310  2e-83  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.282213  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1438  chorismate synthase  45.07 
 
 		 365 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1943  chorismate synthase  46.31 
 
 		 332 aa  304  1.0000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1649  chorismate synthase  43.02 
 
 		 357 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0108012 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1012  chorismate synthase  44.51 
 
 		 366 aa  299  6e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5072  chorismate synthase  43.7 
 
 		 359 aa  293  3e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0662  chorismate synthase  40.05 
 
 		 380 aa  290  2e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0369  chorismate synthase  43.14 
 
 		 360 aa  289  5.0000000000000004e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0161  chorismate synthase  40.33 
 
 		 373 aa  288  1e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.900075  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4064  chorismate synthase  43.58 
 
 		 359 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000659407  hitchhiker  0.000000405427 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1623  chorismate synthase  38.03 
 
 		 363 aa  278  8e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4576  chorismate synthase  43.54 
 
 		 352 aa  278  9e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1972  chorismate synthase  41.53 
 
 		 363 aa  277  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1640  chorismate synthase  41.53 
 
 		 363 aa  277  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503125 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0689  chorismate synthase  41.64 
 
 		 373 aa  276  5e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0139341  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2466  chorismate synthase  39.66 
 
 		 361 aa  273  3e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.358807  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1510  chorismate synthase  41.18 
 
 		 362 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11018  chorismate synthase  43.38 
 
 		 354 aa  272  6e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1568  chorismate synthase  40.4 
 
 		 364 aa  272  8.000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0644  chorismate synthase  40.11 
 
 		 377 aa  271  1e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2938  chorismate synthase  40.4 
 
 		 369 aa  271  2e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2023  chorismate synthase  45.04 
 
 		 358 aa  270  2e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2149  chorismate synthase  41.29 
 
 		 355 aa  270  2.9999999999999997e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0529344  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02561  chorismate synthase  40.62 
 
 		 364 aa  269  5.9999999999999995e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.46541  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3801  chorismate synthase  38.42 
 
 		 364 aa  267  2e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03114  chorismate synthase  40.91 
 
 		 384 aa  266  4e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02461  chorismate synthase  40.06 
 
 		 365 aa  266  5e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2667  chorismate synthase  40.11 
 
 		 364 aa  266  5e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1296  chorismate synthase  41.08 
 
 		 334 aa  265  7e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.576188  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1282  chorismate synthase  42.02 
 
 		 391 aa  265  1e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0226  chorismate synthase  40.06 
 
 		 365 aa  265  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1241  chorismate synthase  40.11 
 
 		 366 aa  265  1e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1537  chorismate synthase  39.83 
 
 		 364 aa  264  1e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2244  chorismate synthase  40.96 
 
 		 365 aa  264  1e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02451  chorismate synthase  39.22 
 
 		 365 aa  264  2e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.642724  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3150  chorismate synthase  40.39 
 
 		 373 aa  264  2e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002863  chorismate synthase  40.68 
 
 		 361 aa  263  3e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3093  chorismate synthase  46.31 
 
 		 367 aa  263  3e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000101466  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1657  chorismate synthase  41.53 
 
 		 366 aa  262  6.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112196  normal  0.0287757 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1987  chorismate synthase  41.53 
 
 		 366 aa  262  8e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1541  chorismate synthase  41.24 
 
 		 366 aa  261  1e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3830  chorismate synthase  38.98 
 
 		 358 aa  261  2e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2168  chorismate synthase  40.4 
 
 		 361 aa  260  3e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1569  chorismate synthase  40.96 
 
 		 366 aa  259  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1360  chorismate synthase  40.73 
 
 		 366 aa  260  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767963  normal  0.499065 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1018  chorismate synthase  40.5 
 
 		 362 aa  259  4e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1702  chorismate synthase  38.34 
 
 		 384 aa  259  6e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2752  chorismate synthase  40.11 
 
 		 364 aa  258  8e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.200726  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0666  chorismate synthase  39.27 
 
 		 366 aa  258  8e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0639836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2846  chorismate synthase  40.11 
 
 		 364 aa  258  8e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000803726 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2769  chorismate synthase  40.11 
 
 		 364 aa  258  8e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.116753  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1607  chorismate synthase  40.11 
 
 		 364 aa  258  9e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  normal  0.360545 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0823  chorismate synthase  37.82 
 
 		 360 aa  258  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0304  chorismate synthase  39.5 
 
 		 366 aa  258  1e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.21806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2767  chorismate synthase  40.4 
 
 		 366 aa  258  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2159  chorismate synthase  40.96 
 
 		 365 aa  258  1e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2737  chorismate synthase  42.82 
 
 		 361 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2524  chorismate synthase  42.82 
 
 		 361 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2613  chorismate synthase  42.82 
 
 		 361 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.730292  normal  0.55052 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4957  chorismate synthase  40.17 
 
 		 389 aa  257  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02471  chorismate synthase  37.92 
 
 		 363 aa  258  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2040  chorismate synthase  40.06 
 
 		 364 aa  256  3e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1740  chorismate synthase  40.4 
 
 		 368 aa  256  5e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.544591 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2355  chorismate synthase  40.34 
 
 		 362 aa  256  6e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2451  chorismate synthase  39.83 
 
 		 364 aa  255  7e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3438  chorismate synthase  37.82 
 
 		 360 aa  255  7e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000199375 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4112  chorismate synthase  38.33 
 
 		 363 aa  255  8e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356503  normal  0.0141233 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02254  chorismate synthase  43.1 
 
 		 361 aa  255  9e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1323  chorismate synthase  43.1 
 
 		 361 aa  255  9e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2626  chorismate synthase  42.09 
 
 		 361 aa  255  9e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000317199 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2486  chorismate synthase  43.1 
 
 		 361 aa  255  9e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3470  chorismate synthase  43.1 
 
 		 361 aa  255  9e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2573  chorismate synthase  42.09 
 
 		 361 aa  255  9e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02214  hypothetical protein  43.1 
 
 		 361 aa  255  9e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2624  chorismate synthase  43.1 
 
 		 361 aa  255  9e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1327  Chorismate synthase  43.38 
 
 		 361 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.54496  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2481  chorismate synthase  43.38 
 
 		 361 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1664  chorismate synthase  40.06 
 
 		 362 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1637  chorismate synthase  40.06 
 
 		 362 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1564  chorismate synthase  40.51 
 
 		 328 aa  255  1.0000000000000001e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0702  chorismate synthase  38.7 
 
 		 366 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0530  chorismate synthase  38.86 
 
 		 365 aa  254  2.0000000000000002e-66  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.910862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1952  chorismate synthase  37.85 
 
 		 358 aa  254  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0762  chorismate synthase  38.42 
 
 		 430 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0691461  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2707  chorismate synthase  43.94 
 
 		 361 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1226  chorismate synthase  38.42 
 
 		 366 aa  253  2.0000000000000002e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0161922 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2090  chorismate synthase  38.87 
 
 		 354 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0281395  normal  0.0647066 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1525  chorismate synthase  39.27 
 
 		 385 aa  254  2.0000000000000002e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0632175 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1481  chorismate synthase  38.42 
 
 		 369 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.470447  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0946  chorismate synthase  38.42 
 
 		 369 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.718045  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1341  chorismate synthase  39.33 
 
 		 366 aa  253  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1974  chorismate synthase  41.62 
 
 		 358 aa  253  3e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>