More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_10150 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_10150  chorismate synthase  100 
 
 		 362 aa  731    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.107827  hitchhiker  0.00000077932 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0691  chorismate synthase  45.01 
 
 		 357 aa  348  1e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0522046  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0690  chorismate synthase  44.73 
 
 		 357 aa  345  8e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140082  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0662  chorismate synthase  46.87 
 
 		 380 aa  338  9e-92  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1010  chorismate synthase  43.44 
 
 		 369 aa  312  6.999999999999999e-84  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0494741  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0439  chorismate synthase  46.3 
 
 		 364 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.178344  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_405  chorismate synthase  46.81 
 
 		 364 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.09813  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0462  chorismate synthase  46.54 
 
 		 364 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.282213  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1649  chorismate synthase  45.66 
 
 		 357 aa  298  8e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0108012 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1012  chorismate synthase  44.85 
 
 		 366 aa  297  2e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2420  chorismate synthase  43.49 
 
 		 366 aa  296  3e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0349388  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0547  chorismate synthase  42.46 
 
 		 365 aa  295  1e-78  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0161  chorismate synthase  44.66 
 
 		 373 aa  291  1e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.900075  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1943  chorismate synthase  45.68 
 
 		 332 aa  288  8e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1438  chorismate synthase  43.89 
 
 		 365 aa  288  1e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0689  chorismate synthase  40.93 
 
 		 373 aa  283  5.000000000000001e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0139341  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5072  chorismate synthase  44.35 
 
 		 359 aa  269  7e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0212  chorismate synthase  44.75 
 
 		 362 aa  268  1e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.468689 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1623  chorismate synthase  42.34 
 
 		 363 aa  265  1e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4112  chorismate synthase  43.21 
 
 		 363 aa  264  2e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356503  normal  0.0141233 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0369  chorismate synthase  40.82 
 
 		 360 aa  264  2e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2023  chorismate synthase  41.97 
 
 		 358 aa  263  3e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0823  chorismate synthase  40.77 
 
 		 360 aa  263  3e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1296  chorismate synthase  42.86 
 
 		 334 aa  262  6e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.576188  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3438  chorismate synthase  40.22 
 
 		 360 aa  258  8e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000199375 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2667  chorismate synthase  41.27 
 
 		 364 aa  257  2e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2149  chorismate synthase  43.09 
 
 		 355 aa  256  3e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0529344  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0644  chorismate synthase  37.4 
 
 		 377 aa  256  6e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4576  chorismate synthase  42.22 
 
 		 352 aa  255  8e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1537  chorismate synthase  40.17 
 
 		 364 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2064  chorismate synthase  43.94 
 
 		 354 aa  254  2.0000000000000002e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4064  chorismate synthase  42.86 
 
 		 359 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000659407  hitchhiker  0.000000405427 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1972  chorismate synthase  42.66 
 
 		 363 aa  253  5.000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1640  chorismate synthase  42.66 
 
 		 363 aa  253  5.000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503125 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02561  chorismate synthase  41.39 
 
 		 364 aa  252  6e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.46541  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02755  chorismate synthase  40.72 
 
 		 365 aa  252  8.000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0341392  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1361  chorismate synthase  42.38 
 
 		 362 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.565895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02461  chorismate synthase  40.28 
 
 		 365 aa  249  4e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02471  chorismate synthase  41.69 
 
 		 363 aa  249  7e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1564  chorismate synthase  41.29 
 
 		 328 aa  248  8e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1789  chorismate synthase  41.5 
 
 		 366 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3093  chorismate synthase  42.31 
 
 		 367 aa  246  3e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000101466  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02451  chorismate synthase  40.28 
 
 		 365 aa  246  4e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.642724  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3830  chorismate synthase  39.78 
 
 		 358 aa  246  4.9999999999999997e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1897  chorismate synthase  40.44 
 
 		 361 aa  246  4.9999999999999997e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3801  chorismate synthase  42.27 
 
 		 364 aa  246  6e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03114  chorismate synthase  40.38 
 
 		 384 aa  245  8e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0589  chorismate synthase  41.23 
 
 		 362 aa  245  8e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1974  chorismate synthase  39.78 
 
 		 358 aa  245  9e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0530  chorismate synthase  39.28 
 
 		 365 aa  244  9.999999999999999e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.910862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2846  chorismate synthase  39.55 
 
 		 364 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000803726 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2752  chorismate synthase  39.55 
 
 		 364 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.200726  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0226  chorismate synthase  40.28 
 
 		 365 aa  244  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3132  chorismate synthase  41.94 
 
 		 357 aa  245  9.999999999999999e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111802  normal  0.087423 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2769  chorismate synthase  39.55 
 
 		 364 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.116753  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2466  chorismate synthase  39.66 
 
 		 361 aa  244  9.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.358807  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1541  chorismate synthase  39.56 
 
 		 366 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2767  chorismate synthase  41.5 
 
 		 366 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1607  chorismate synthase  39.55 
 
 		 364 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  normal  0.360545 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11018  chorismate synthase  40 
 
 		 354 aa  244  1.9999999999999999e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2355  chorismate synthase  41.5 
 
 		 362 aa  243  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1360  chorismate synthase  41.27 
 
 		 366 aa  243  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767963  normal  0.499065 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0586  chorismate synthase  41.62 
 
 		 365 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1569  chorismate synthase  41.23 
 
 		 366 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1637  chorismate synthase  39.39 
 
 		 362 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1381  chorismate synthase  41.27 
 
 		 366 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.674702 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1664  chorismate synthase  39.39 
 
 		 362 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2159  chorismate synthase  39.28 
 
 		 365 aa  243  5e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1341  chorismate synthase  41 
 
 		 366 aa  243  6e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2451  chorismate synthase  39.39 
 
 		 364 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2040  chorismate synthase  41.85 
 
 		 364 aa  242  9e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0762  chorismate synthase  40.67 
 
 		 430 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0691461  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1481  chorismate synthase  40.67 
 
 		 369 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.470447  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0946  chorismate synthase  40.67 
 
 		 369 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.718045  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002863  chorismate synthase  40.11 
 
 		 361 aa  241  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2168  chorismate synthase  39.23 
 
 		 361 aa  240  2e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1538  chorismate synthase  38.5 
 
 		 366 aa  241  2e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1568  chorismate synthase  39.89 
 
 		 364 aa  240  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0978  chorismate synthase  40.39 
 
 		 366 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1460  chorismate synthase  40.39 
 
 		 366 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1741  chorismate synthase  38.94 
 
 		 356 aa  240  2e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0846  chorismate synthase  40.81 
 
 		 371 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.742224 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4605  chorismate synthase  40.67 
 
 		 366 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0590951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43429  chorismate synthase  41.37 
 
 		 442 aa  240  2.9999999999999997e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0435185  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1340  chorismate synthase  39.34 
 
 		 386 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1657  chorismate synthase  41.23 
 
 		 366 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112196  normal  0.0287757 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1226  chorismate synthase  41.5 
 
 		 366 aa  240  2.9999999999999997e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0161922 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1320  chorismate synthase  42.94 
 
 		 369 aa  239  4e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0852715  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1438  chorismate synthase  41 
 
 		 366 aa  240  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1987  chorismate synthase  41.23 
 
 		 366 aa  239  4e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4081  chorismate synthase  41.55 
 
 		 356 aa  239  4e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23791  chorismate synthase  40.61 
 
 		 362 aa  239  5e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0240204 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2614  chorismate synthase  40.39 
 
 		 369 aa  239  5e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3150  chorismate synthase  40.17 
 
 		 373 aa  239  5.999999999999999e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0304  chorismate synthase  41.58 
 
 		 366 aa  239  5.999999999999999e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.21806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1867  chorismate synthase  40.39 
 
 		 369 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0797858  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1689  chorismate synthase  40.39 
 
 		 369 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.537327  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1713  chorismate synthase  40.39 
 
 		 369 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193941  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1952  chorismate synthase  39.5 
 
 		 358 aa  239  8e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2090  chorismate synthase  40.83 
 
 		 354 aa  238  1e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0281395  normal  0.0647066 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>