More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1010 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_1010  chorismate synthase  100 
 
 		 369 aa  749    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0494741  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0690  chorismate synthase  55.28 
 
 		 357 aa  379  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140082  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0691  chorismate synthase  55 
 
 		 357 aa  376  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0522046  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0547  chorismate synthase  45.68 
 
 		 365 aa  318  1e-85  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10150  chorismate synthase  43.44 
 
 		 362 aa  312  6.999999999999999e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.107827  hitchhiker  0.00000077932 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2420  chorismate synthase  47.03 
 
 		 366 aa  296  4e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0349388  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0462  chorismate synthase  40.77 
 
 		 364 aa  290  3e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.282213  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_405  chorismate synthase  40.77 
 
 		 364 aa  289  6e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.09813  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0439  chorismate synthase  40.22 
 
 		 364 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.178344  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1438  chorismate synthase  42.5 
 
 		 365 aa  285  7e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1012  chorismate synthase  41.55 
 
 		 366 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0369  chorismate synthase  40.87 
 
 		 360 aa  272  7e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02561  chorismate synthase  41.23 
 
 		 364 aa  271  1e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.46541  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1649  chorismate synthase  39.94 
 
 		 357 aa  269  5e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0108012 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02451  chorismate synthase  42.06 
 
 		 365 aa  268  1e-70  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.642724  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0689  chorismate synthase  40.16 
 
 		 373 aa  267  2e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0139341  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03114  chorismate synthase  39.78 
 
 		 384 aa  266  4e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1664  chorismate synthase  39.78 
 
 		 362 aa  266  5.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1637  chorismate synthase  39.78 
 
 		 362 aa  266  5.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2355  chorismate synthase  40.87 
 
 		 362 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0226  chorismate synthase  42.06 
 
 		 365 aa  265  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002863  chorismate synthase  39.78 
 
 		 361 aa  263  2e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0161  chorismate synthase  37.63 
 
 		 373 aa  264  2e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.900075  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02461  chorismate synthase  41.78 
 
 		 365 aa  263  3e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1702  chorismate synthase  37.4 
 
 		 384 aa  263  4.999999999999999e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1541  chorismate synthase  39.13 
 
 		 366 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11018  chorismate synthase  41.32 
 
 		 354 aa  260  3e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02471  chorismate synthase  39.67 
 
 		 363 aa  259  5.0000000000000005e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1537  chorismate synthase  38.04 
 
 		 364 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2159  chorismate synthase  39.35 
 
 		 365 aa  259  7e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0662  chorismate synthase  38.65 
 
 		 380 aa  258  9e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2667  chorismate synthase  38.52 
 
 		 364 aa  258  1e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3150  chorismate synthase  39.4 
 
 		 373 aa  257  2e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2995  chorismate synthase  38.44 
 
 		 365 aa  257  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212385 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0858  chorismate synthase  38.87 
 
 		 366 aa  257  2e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.52804e-17  unclonable  0.0000000936669 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0644  chorismate synthase  38.48 
 
 		 377 aa  257  2e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4064  chorismate synthase  39.84 
 
 		 359 aa  257  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000659407  hitchhiker  0.000000405427 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02755  chorismate synthase  38.8 
 
 		 365 aa  257  3e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0341392  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3830  chorismate synthase  37.06 
 
 		 358 aa  257  3e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0212  chorismate synthase  39.72 
 
 		 362 aa  256  6e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.468689 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2769  chorismate synthase  39.3 
 
 		 364 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.116753  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1607  chorismate synthase  39.3 
 
 		 364 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  normal  0.360545 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1952  chorismate synthase  37.06 
 
 		 358 aa  254  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2752  chorismate synthase  39.3 
 
 		 364 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.200726  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2846  chorismate synthase  39.3 
 
 		 364 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000803726 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1943  chorismate synthase  39.94 
 
 		 332 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1657  chorismate synthase  39.04 
 
 		 366 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112196  normal  0.0287757 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2451  chorismate synthase  40.16 
 
 		 364 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2168  chorismate synthase  38.17 
 
 		 361 aa  254  2.0000000000000002e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1741  chorismate synthase  41.23 
 
 		 356 aa  254  2.0000000000000002e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5072  chorismate synthase  39.35 
 
 		 359 aa  253  3e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1987  chorismate synthase  39.04 
 
 		 366 aa  253  3e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4112  chorismate synthase  36.24 
 
 		 363 aa  252  6e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356503  normal  0.0141233 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0589  chorismate synthase  39.24 
 
 		 362 aa  251  1e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3161  chorismate synthase  38.52 
 
 		 364 aa  251  1e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2023  chorismate synthase  43.3 
 
 		 358 aa  251  2e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0666  chorismate synthase  37.37 
 
 		 366 aa  250  3e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0639836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2046  chorismate synthase  38.52 
 
 		 366 aa  249  4e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1538  chorismate synthase  39.06 
 
 		 366 aa  249  5e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4576  chorismate synthase  39.61 
 
 		 352 aa  249  5e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0835  chorismate synthase  39.78 
 
 		 362 aa  249  6e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1972  chorismate synthase  36.07 
 
 		 363 aa  249  8e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1640  chorismate synthase  36.07 
 
 		 363 aa  249  8e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503125 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1296  chorismate synthase  39.06 
 
 		 334 aa  248  1e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.576188  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1974  chorismate synthase  41.99 
 
 		 358 aa  248  1e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0530  chorismate synthase  36.36 
 
 		 365 aa  248  1e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.910862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1438  chorismate synthase  37.4 
 
 		 366 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1018  chorismate synthase  38.98 
 
 		 362 aa  248  1e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2149  chorismate synthase  38.46 
 
 		 355 aa  248  2e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0529344  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1114  chorismate synthase  36.66 
 
 		 395 aa  248  2e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1623  chorismate synthase  37.5 
 
 		 363 aa  248  2e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4957  chorismate synthase  37.06 
 
 		 389 aa  247  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2222  chorismate synthase  37.43 
 
 		 352 aa  246  4e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0978  chorismate synthase  37.67 
 
 		 366 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2866  chorismate synthase  39.4 
 
 		 370 aa  246  4e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1381  chorismate synthase  37.67 
 
 		 366 aa  246  4e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.674702 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1341  chorismate synthase  37.67 
 
 		 366 aa  246  4e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1460  chorismate synthase  37.67 
 
 		 366 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1658  chorismate synthase  37.98 
 
 		 366 aa  246  6e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1425  chorismate synthase  37.1 
 
 		 368 aa  245  8e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865922 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2251  chorismate synthase  37.7 
 
 		 352 aa  245  9e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1789  chorismate synthase  37.4 
 
 		 366 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1569  chorismate synthase  37.16 
 
 		 366 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1361  chorismate synthase  37.88 
 
 		 362 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.565895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4605  chorismate synthase  37.4 
 
 		 366 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0590951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0304  chorismate synthase  37.77 
 
 		 366 aa  244  1.9999999999999999e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.21806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1568  chorismate synthase  35.42 
 
 		 364 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0114  chorismate synthase  42.66 
 
 		 366 aa  243  3e-63  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2040  chorismate synthase  39.19 
 
 		 364 aa  243  3e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29930  predicted protein  39 
 
 		 458 aa  243  3e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1699  chorismate synthase  39.51 
 
 		 361 aa  243  3e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2614  chorismate synthase  36.68 
 
 		 369 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1481  chorismate synthase  36.14 
 
 		 369 aa  243  5e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.470447  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0946  chorismate synthase  36.14 
 
 		 369 aa  243  5e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.718045  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2416  chorismate synthase  39.73 
 
 		 364 aa  243  5e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1493  chorismate synthase  39.66 
 
 		 362 aa  242  6e-63  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3438  chorismate synthase  36.46 
 
 		 360 aa  242  6e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000199375 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0762  chorismate synthase  36.14 
 
 		 430 aa  242  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0691461  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2767  chorismate synthase  36.14 
 
 		 366 aa  242  7e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1510  chorismate synthase  40.11 
 
 		 362 aa  242  7e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.832102 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>