More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1341 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_1713  chorismate synthase  91.23 
 
 		 369 aa  691    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193941  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0401  chorismate synthase  90.96 
 
 		 369 aa  687    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0762  chorismate synthase  91.23 
 
 		 430 aa  692    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0691461  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1481  chorismate synthase  91.23 
 
 		 369 aa  691    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.470447  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0946  chorismate synthase  91.23 
 
 		 369 aa  691    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.718045  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1867  chorismate synthase  91.23 
 
 		 369 aa  691    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0797858  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4605  chorismate synthase  97.54 
 
 		 366 aa  727    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0590951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1689  chorismate synthase  91.23 
 
 		 369 aa  691    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.537327  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2614  chorismate synthase  92.05 
 
 		 369 aa  696    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2767  chorismate synthase  89.32 
 
 		 366 aa  676    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1789  chorismate synthase  97.27 
 
 		 366 aa  726    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1381  chorismate synthase  98.36 
 
 		 366 aa  737    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.674702 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1360  chorismate synthase  89.59 
 
 		 366 aa  676    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767963  normal  0.499065 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1438  chorismate synthase  97.54 
 
 		 366 aa  728    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0978  chorismate synthase  98.09 
 
 		 366 aa  732    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1569  chorismate synthase  88.49 
 
 		 366 aa  665    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1341  chorismate synthase  100 
 
 		 366 aa  745    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1460  chorismate synthase  98.09 
 
 		 366 aa  732    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1657  chorismate synthase  81.42 
 
 		 366 aa  623  1e-177  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112196  normal  0.0287757 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1987  chorismate synthase  81.15 
 
 		 366 aa  620  1e-176  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1257  chorismate synthase  84.38 
 
 		 370 aa  618  1e-176  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.234528  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1138  chorismate synthase  83.29 
 
 		 369 aa  615  1e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.26701  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1566  chorismate synthase  82.47 
 
 		 366 aa  609  1e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3074  chorismate synthase  80.61 
 
 		 376 aa  598  1e-170  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1425  chorismate synthase  78.73 
 
 		 368 aa  587  1e-166  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865922 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1525  chorismate synthase  76.16 
 
 		 385 aa  581  1.0000000000000001e-165  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0632175 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0858  chorismate synthase  76.86 
 
 		 366 aa  575  1.0000000000000001e-163  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.52804e-17  unclonable  0.0000000936669 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2745  chorismate synthase  76.18 
 
 		 365 aa  559  1e-158  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0513827 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1241  chorismate synthase  72.8 
 
 		 366 aa  556  1e-157  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1958  chorismate synthase  74.66 
 
 		 393 aa  552  1e-156  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0977  chorismate synthase  73.9 
 
 		 371 aa  548  1e-155  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2995  chorismate synthase  73.63 
 
 		 365 aa  550  1e-155  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212385 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0666  chorismate synthase  72.3 
 
 		 366 aa  550  1e-155  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0639836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1658  chorismate synthase  75.14 
 
 		 366 aa  545  1e-154  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2046  chorismate synthase  75.14 
 
 		 366 aa  545  1e-154  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4957  chorismate synthase  71.51 
 
 		 389 aa  540  9.999999999999999e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0871  chorismate synthase  73.08 
 
 		 371 aa  538  9.999999999999999e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.205918  normal  0.59922 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2580  chorismate synthase  72.88 
 
 		 365 aa  531  1e-150  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.03113 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2938  chorismate synthase  71.19 
 
 		 369 aa  529  1e-149  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3161  chorismate synthase  72.53 
 
 		 364 aa  530  1e-149  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1842  chorismate synthase  74.79 
 
 		 365 aa  528  1e-149  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.473892  normal  0.107896 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2137  chorismate synthase  73.06 
 
 		 361 aa  527  1e-148  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.146002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1568  chorismate synthase  70.19 
 
 		 364 aa  523  1e-147  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2856  chorismate synthase  69.97 
 
 		 367 aa  521  1e-147  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0702  chorismate synthase  69.04 
 
 		 366 aa  519  1e-146  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3358  chorismate synthase  72.5 
 
 		 370 aa  520  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2244  chorismate synthase  68.77 
 
 		 365 aa  519  1e-146  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2466  chorismate synthase  69.81 
 
 		 361 aa  515  1.0000000000000001e-145  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.358807  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01260  chorismate synthase  67.03 
 
 		 367 aa  511  1e-144  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1740  chorismate synthase  68.23 
 
 		 368 aa  511  1e-144  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.544591 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2091  chorismate synthase  67.03 
 
 		 371 aa  506  9.999999999999999e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2168  chorismate synthase  66.76 
 
 		 361 aa  501  1e-141  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1814  chorismate synthase  66.76 
 
 		 367 aa  500  1e-140  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002863  chorismate synthase  66.76 
 
 		 361 aa  500  1e-140  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1538  chorismate synthase  68.64 
 
 		 366 aa  498  1e-140  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1226  chorismate synthase  67.59 
 
 		 366 aa  499  1e-140  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0161922 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1833  chorismate synthase  68.98 
 
 		 365 aa  496  1e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.306795  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03114  chorismate synthase  66.2 
 
 		 384 aa  497  1e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1972  chorismate synthase  65.93 
 
 		 363 aa  496  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1640  chorismate synthase  65.93 
 
 		 363 aa  496  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503125 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02755  chorismate synthase  67.95 
 
 		 365 aa  496  1e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0341392  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42760  chorismate synthase  69.08 
 
 		 363 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3150  chorismate synthase  63.34 
 
 		 373 aa  486  1e-136  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2752  chorismate synthase  66.3 
 
 		 364 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.200726  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3591  chorismate synthase  69.08 
 
 		 363 aa  486  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1607  chorismate synthase  66.3 
 
 		 364 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  normal  0.360545 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2846  chorismate synthase  66.3 
 
 		 364 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000803726 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2769  chorismate synthase  66.3 
 
 		 364 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.116753  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1018  chorismate synthase  63.43 
 
 		 362 aa  486  1e-136  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1830  chorismate synthase  69.08 
 
 		 363 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.265321  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2043  chorismate synthase  68.23 
 
 		 363 aa  481  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00765141  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1853  chorismate synthase  68.8 
 
 		 363 aa  482  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1408  chorismate synthase  68.8 
 
 		 363 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.231327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1537  chorismate synthase  64.82 
 
 		 364 aa  483  1e-135  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2451  chorismate synthase  66.02 
 
 		 364 aa  483  1e-135  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0638  chorismate synthase  66.76 
 
 		 372 aa  481  1e-135  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.704225  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1541  chorismate synthase  65.1 
 
 		 366 aa  484  1e-135  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2667  chorismate synthase  65.1 
 
 		 364 aa  481  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3880  chorismate synthase  69.08 
 
 		 363 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00247284  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2159  chorismate synthase  64.62 
 
 		 365 aa  481  1e-135  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1438  chorismate synthase  68.25 
 
 		 363 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0279248 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0722  chorismate synthase  67.04 
 
 		 372 aa  479  1e-134  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02254  chorismate synthase  66.39 
 
 		 361 aa  475  1e-133  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1327  Chorismate synthase  66.39 
 
 		 361 aa  475  1e-133  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.54496  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1323  chorismate synthase  66.39 
 
 		 361 aa  475  1e-133  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2251  chorismate synthase  65.53 
 
 		 352 aa  475  1e-133  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2222  chorismate synthase  65.53 
 
 		 352 aa  474  1e-133  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1722  chorismate synthase  68.25 
 
 		 363 aa  475  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02214  hypothetical protein  66.39 
 
 		 361 aa  475  1e-133  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2486  chorismate synthase  66.39 
 
 		 361 aa  475  1e-133  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2573  chorismate synthase  66.11 
 
 		 361 aa  474  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3470  chorismate synthase  66.39 
 
 		 361 aa  475  1e-133  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2481  chorismate synthase  66.39 
 
 		 361 aa  475  1e-133  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2593  chorismate synthase  65.56 
 
 		 361 aa  475  1e-133  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2624  chorismate synthase  66.39 
 
 		 361 aa  474  1e-133  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2626  chorismate synthase  66.11 
 
 		 361 aa  474  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000317199 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1405  chorismate synthase  65.28 
 
 		 361 aa  473  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.47258  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2588  chorismate synthase  67.31 
 
 		 364 aa  473  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2707  chorismate synthase  66.39 
 
 		 361 aa  474  1e-132  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1699  chorismate synthase  66.2 
 
 		 361 aa  474  1e-132  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>