More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0690 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0690  chorismate synthase  100 
 
 		 357 aa  716    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140082  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0691  chorismate synthase  98.6 
 
 		 357 aa  704    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0522046  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1010  chorismate synthase  55.28 
 
 		 369 aa  379  1e-104  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0494741  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2420  chorismate synthase  54.34 
 
 		 366 aa  366  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0349388  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10150  chorismate synthase  44.73 
 
 		 362 aa  345  8e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.107827  hitchhiker  0.00000077932 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0547  chorismate synthase  45.53 
 
 		 365 aa  332  5e-90  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0439  chorismate synthase  43.82 
 
 		 364 aa  315  6e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.178344  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_405  chorismate synthase  43.82 
 
 		 364 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.09813  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0462  chorismate synthase  42.82 
 
 		 364 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.282213  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1438  chorismate synthase  44.82 
 
 		 365 aa  305  8.000000000000001e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1943  chorismate synthase  46.31 
 
 		 332 aa  301  2e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1649  chorismate synthase  42.45 
 
 		 357 aa  296  3e-79  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0108012 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1012  chorismate synthase  44.23 
 
 		 366 aa  295  9e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5072  chorismate synthase  43.42 
 
 		 359 aa  289  4e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0369  chorismate synthase  43.14 
 
 		 360 aa  289  4e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0662  chorismate synthase  39.51 
 
 		 380 aa  284  2.0000000000000002e-75  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0161  chorismate synthase  40.06 
 
 		 373 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.900075  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4064  chorismate synthase  43.02 
 
 		 359 aa  278  9e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000659407  hitchhiker  0.000000405427 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4576  chorismate synthase  43.26 
 
 		 352 aa  276  5e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0689  chorismate synthase  41.64 
 
 		 373 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0139341  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1623  chorismate synthase  37.46 
 
 		 363 aa  273  4.0000000000000004e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11018  chorismate synthase  42.82 
 
 		 354 aa  273  4.0000000000000004e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1640  chorismate synthase  40.96 
 
 		 363 aa  271  1e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503125 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1972  chorismate synthase  40.96 
 
 		 363 aa  271  1e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1568  chorismate synthase  40.11 
 
 		 364 aa  270  2.9999999999999997e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2938  chorismate synthase  40.11 
 
 		 369 aa  269  5e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1510  chorismate synthase  40.9 
 
 		 362 aa  269  5e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2466  chorismate synthase  39.38 
 
 		 361 aa  269  5e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.358807  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0644  chorismate synthase  40.11 
 
 		 377 aa  269  5e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2149  chorismate synthase  41.57 
 
 		 355 aa  268  1e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0529344  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02561  chorismate synthase  40.5 
 
 		 364 aa  268  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.46541  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1282  chorismate synthase  42.7 
 
 		 391 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2023  chorismate synthase  44.48 
 
 		 358 aa  265  1e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02461  chorismate synthase  40.22 
 
 		 365 aa  265  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0226  chorismate synthase  39.04 
 
 		 365 aa  263  4.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02451  chorismate synthase  38.66 
 
 		 365 aa  262  6e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.642724  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03114  chorismate synthase  40.34 
 
 		 384 aa  260  2e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1296  chorismate synthase  40.51 
 
 		 334 aa  261  2e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.576188  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1241  chorismate synthase  39.83 
 
 		 366 aa  260  2e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1537  chorismate synthase  39.55 
 
 		 364 aa  260  2e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2244  chorismate synthase  40.68 
 
 		 365 aa  260  3e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2667  chorismate synthase  39.55 
 
 		 364 aa  260  3e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1657  chorismate synthase  41.24 
 
 		 366 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112196  normal  0.0287757 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002863  chorismate synthase  40.4 
 
 		 361 aa  259  6e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1987  chorismate synthase  41.24 
 
 		 366 aa  259  6e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3150  chorismate synthase  40.11 
 
 		 373 aa  259  6e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1360  chorismate synthase  41.01 
 
 		 366 aa  259  6e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767963  normal  0.499065 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02471  chorismate synthase  37.92 
 
 		 363 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3093  chorismate synthase  45.72 
 
 		 367 aa  258  1e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000101466  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3801  chorismate synthase  37.75 
 
 		 364 aa  257  2e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0530  chorismate synthase  39.43 
 
 		 365 aa  257  2e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.910862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1637  chorismate synthase  40.62 
 
 		 362 aa  256  3e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1569  chorismate synthase  40.96 
 
 		 366 aa  257  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1664  chorismate synthase  40.62 
 
 		 362 aa  256  3e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1541  chorismate synthase  40.96 
 
 		 366 aa  256  3e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1702  chorismate synthase  38.3 
 
 		 384 aa  256  3e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2767  chorismate synthase  40.96 
 
 		 366 aa  256  4e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4957  chorismate synthase  40.45 
 
 		 389 aa  256  6e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1018  chorismate synthase  40.22 
 
 		 362 aa  255  8e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1740  chorismate synthase  40.4 
 
 		 368 aa  255  9e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.544591 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0823  chorismate synthase  37.54 
 
 		 360 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2168  chorismate synthase  39.83 
 
 		 361 aa  254  2.0000000000000002e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2355  chorismate synthase  40.62 
 
 		 362 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0702  chorismate synthase  38.7 
 
 		 366 aa  253  3e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4112  chorismate synthase  37.6 
 
 		 363 aa  253  3e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356503  normal  0.0141233 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0304  chorismate synthase  39.22 
 
 		 366 aa  253  3e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.21806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1741  chorismate synthase  41.64 
 
 		 356 aa  253  3e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3830  chorismate synthase  37.29 
 
 		 358 aa  253  4.0000000000000004e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1226  chorismate synthase  38.42 
 
 		 366 aa  253  4.0000000000000004e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0161922 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2090  chorismate synthase  38.87 
 
 		 354 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0281395  normal  0.0647066 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2846  chorismate synthase  39.72 
 
 		 364 aa  252  6e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000803726 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3438  chorismate synthase  37.54 
 
 		 360 aa  252  6e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000199375 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2769  chorismate synthase  39.72 
 
 		 364 aa  252  6e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.116753  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2752  chorismate synthase  39.72 
 
 		 364 aa  252  6e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.200726  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0666  chorismate synthase  38.7 
 
 		 366 aa  252  7e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0639836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1607  chorismate synthase  39.72 
 
 		 364 aa  252  7e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  normal  0.360545 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2119  chorismate synthase  40.29 
 
 		 368 aa  252  7e-66  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1341  chorismate synthase  39.33 
 
 		 366 aa  252  7e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1493  chorismate synthase  42.37 
 
 		 362 aa  252  7e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2159  chorismate synthase  40.4 
 
 		 365 aa  252  7e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1789  chorismate synthase  38.76 
 
 		 366 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2091  chorismate synthase  39.55 
 
 		 371 aa  252  8.000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2451  chorismate synthase  39.72 
 
 		 364 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1525  chorismate synthase  38.98 
 
 		 385 aa  251  9.000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0632175 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0762  chorismate synthase  38.2 
 
 		 430 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0691461  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0589  chorismate synthase  39.61 
 
 		 362 aa  251  1e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2470  chorismate synthase  39.22 
 
 		 361 aa  251  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2524  chorismate synthase  41.97 
 
 		 361 aa  250  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2737  chorismate synthase  41.97 
 
 		 361 aa  250  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1814  chorismate synthase  38.14 
 
 		 367 aa  250  2e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1481  chorismate synthase  38.2 
 
 		 369 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.470447  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0946  chorismate synthase  38.2 
 
 		 369 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.718045  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2222  chorismate synthase  40.56 
 
 		 352 aa  251  2e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1438  chorismate synthase  39.33 
 
 		 366 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2613  chorismate synthase  41.97 
 
 		 361 aa  250  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.730292  normal  0.55052 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1381  chorismate synthase  39.04 
 
 		 366 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.674702 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0978  chorismate synthase  39.04 
 
 		 366 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1564  chorismate synthase  40.23 
 
 		 328 aa  250  2e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1460  chorismate synthase  39.04 
 
 		 366 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0835  chorismate synthase  39.61 
 
 		 362 aa  251  2e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>