More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_2023 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_2023  chorismate synthase  100 
 
 		 358 aa  728    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1974  chorismate synthase  68.17 
 
 		 358 aa  494  1e-139  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2064  chorismate synthase  57.58 
 
 		 354 aa  438  9.999999999999999e-123  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1741  chorismate synthase  60.11 
 
 		 356 aa  436  1e-121  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1493  chorismate synthase  56.63 
 
 		 362 aa  418  1e-116  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0114  chorismate synthase  57.38 
 
 		 366 aa  416  9.999999999999999e-116  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1806  chorismate synthase  56.94 
 
 		 362 aa  409  1e-113  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1994  chorismate synthase  57.22 
 
 		 362 aa  409  1e-113  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1625  chorismate synthase  57.22 
 
 		 362 aa  410  1e-113  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.511164  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2168  chorismate synthase  51.4 
 
 		 361 aa  370  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1538  chorismate synthase  53.01 
 
 		 366 aa  368  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002863  chorismate synthase  51.68 
 
 		 361 aa  365  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02755  chorismate synthase  52.94 
 
 		 365 aa  366  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0341392  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03114  chorismate synthase  51.4 
 
 		 384 aa  366  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2159  chorismate synthase  52.92 
 
 		 365 aa  364  1e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1537  chorismate synthase  52.92 
 
 		 364 aa  363  3e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1541  chorismate synthase  53.47 
 
 		 366 aa  363  4e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2769  chorismate synthase  52.63 
 
 		 364 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.116753  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2846  chorismate synthase  52.63 
 
 		 364 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000803726 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2667  chorismate synthase  52.34 
 
 		 364 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2752  chorismate synthase  52.63 
 
 		 364 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.200726  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2938  chorismate synthase  50.86 
 
 		 369 aa  362  6e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1607  chorismate synthase  52.63 
 
 		 364 aa  362  6e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  normal  0.360545 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2451  chorismate synthase  52.34 
 
 		 364 aa  359  4e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1360  chorismate synthase  51.9 
 
 		 366 aa  352  5e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767963  normal  0.499065 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1640  chorismate synthase  49.71 
 
 		 363 aa  351  1e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503125 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1972  chorismate synthase  49.71 
 
 		 363 aa  351  1e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2767  chorismate synthase  51.31 
 
 		 366 aa  350  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0369  chorismate synthase  52.41 
 
 		 360 aa  350  2e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1569  chorismate synthase  51.6 
 
 		 366 aa  349  4e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2797  chorismate synthase  51.54 
 
 		 368 aa  348  1e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3150  chorismate synthase  49.44 
 
 		 373 aa  348  1e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0858  chorismate synthase  51.17 
 
 		 366 aa  347  1e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.52804e-17  unclonable  0.0000000936669 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3017  chorismate synthase  52.44 
 
 		 364 aa  347  2e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.503026  normal  0.557092 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0762  chorismate synthase  50 
 
 		 430 aa  346  4e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0691461  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1481  chorismate synthase  50 
 
 		 369 aa  346  5e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.470447  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0946  chorismate synthase  50 
 
 		 369 aa  346  5e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.718045  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1699  chorismate synthase  52.51 
 
 		 361 aa  346  5e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1241  chorismate synthase  51.02 
 
 		 366 aa  346  5e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2466  chorismate synthase  49.27 
 
 		 361 aa  345  6e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.358807  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1713  chorismate synthase  50.73 
 
 		 369 aa  344  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193941  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1568  chorismate synthase  49.86 
 
 		 364 aa  344  1e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4957  chorismate synthase  51.01 
 
 		 389 aa  345  1e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1867  chorismate synthase  50.73 
 
 		 369 aa  344  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0797858  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2614  chorismate synthase  50.73 
 
 		 369 aa  344  1e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1689  chorismate synthase  50.73 
 
 		 369 aa  344  1e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.537327  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1469  chorismate synthase  53.51 
 
 		 364 aa  344  1e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0685488 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1814  chorismate synthase  49.12 
 
 		 367 aa  343  2e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1416  chorismate synthase  53.51 
 
 		 364 aa  344  2e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.25436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1481  chorismate synthase  53.51 
 
 		 364 aa  344  2e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.335191 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0401  chorismate synthase  50 
 
 		 369 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2416  chorismate synthase  51.71 
 
 		 364 aa  343  4e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1438  chorismate synthase  51.14 
 
 		 365 aa  343  4e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2091  chorismate synthase  50.29 
 
 		 371 aa  342  4e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1076  chorismate synthase  49.12 
 
 		 352 aa  341  1e-92  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.306004  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1012  chorismate synthase  49.14 
 
 		 366 aa  341  1e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1438  chorismate synthase  51 
 
 		 366 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0938  chorismate synthase  49.12 
 
 		 352 aa  341  1e-92  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.464022  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1018  chorismate synthase  50 
 
 		 362 aa  341  1e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1789  chorismate synthase  50.43 
 
 		 366 aa  340  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681987  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2251  chorismate synthase  52.19 
 
 		 352 aa  340  2.9999999999999998e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11018  chorismate synthase  51.3 
 
 		 354 aa  339  4e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2588  chorismate synthase  51 
 
 		 364 aa  339  5e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0978  chorismate synthase  50.72 
 
 		 366 aa  338  7e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1638  chorismate synthase  51 
 
 		 364 aa  338  7e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1460  chorismate synthase  50.72 
 
 		 366 aa  338  7e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2707  chorismate synthase  52.63 
 
 		 361 aa  338  7e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4605  chorismate synthase  50.72 
 
 		 366 aa  338  8e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0590951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1296  chorismate synthase  49.42 
 
 		 334 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.576188  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02254  chorismate synthase  52.34 
 
 		 361 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1327  Chorismate synthase  52.34 
 
 		 361 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.54496  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3074  chorismate synthase  51.02 
 
 		 376 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2624  chorismate synthase  52.34 
 
 		 361 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1657  chorismate synthase  50 
 
 		 366 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112196  normal  0.0287757 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2222  chorismate synthase  51.9 
 
 		 352 aa  337  1.9999999999999998e-91  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2481  chorismate synthase  52.34 
 
 		 361 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1381  chorismate synthase  49.86 
 
 		 366 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.674702 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2486  chorismate synthase  52.34 
 
 		 361 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1323  chorismate synthase  52.34 
 
 		 361 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3470  chorismate synthase  52.34 
 
 		 361 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1341  chorismate synthase  50.14 
 
 		 366 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02214  hypothetical protein  52.34 
 
 		 361 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2745  chorismate synthase  50.14 
 
 		 365 aa  336  2.9999999999999997e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0513827 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2995  chorismate synthase  49.57 
 
 		 365 aa  336  2.9999999999999997e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212385 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1987  chorismate synthase  50 
 
 		 366 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2090  chorismate synthase  48.98 
 
 		 354 aa  336  3.9999999999999995e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0281395  normal  0.0647066 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2470  chorismate synthase  50.56 
 
 		 361 aa  335  5e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1408  chorismate synthase  49.71 
 
 		 353 aa  335  7e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.422248 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2877  chorismate synthase  51.75 
 
 		 361 aa  335  7.999999999999999e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0472598  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2244  chorismate synthase  50.58 
 
 		 365 aa  335  9e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2613  chorismate synthase  52.05 
 
 		 361 aa  334  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.730292  normal  0.55052 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2757  chorismate synthase  50.55 
 
 		 366 aa  335  1e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0933744 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01260  chorismate synthase  49.42 
 
 		 367 aa  335  1e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2811  chorismate synthase  51.17 
 
 		 361 aa  334  1e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.655428  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3374  chorismate synthase  51.17 
 
 		 361 aa  335  1e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2626  chorismate synthase  52.05 
 
 		 361 aa  334  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000317199 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2737  chorismate synthase  52.05 
 
 		 361 aa  334  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1205  chorismate synthase  51.43 
 
 		 360 aa  335  1e-90  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0521105  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2524  chorismate synthase  52.05 
 
 		 361 aa  334  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2573  chorismate synthase  52.05 
 
 		 361 aa  334  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>