More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1296 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1296  chorismate synthase  100 
 
 		 334 aa  668    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.576188  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1564  chorismate synthase  71.04 
 
 		 328 aa  484  1e-136  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2604  chorismate synthase  67.07 
 
 		 331 aa  390  1e-107  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1029  chorismate synthase  64.42 
 
 		 335 aa  380  1e-104  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1438  chorismate synthase  56.66 
 
 		 365 aa  369  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0161  chorismate synthase  53.13 
 
 		 373 aa  361  1e-98  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.900075  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1541  chorismate synthase  51.42 
 
 		 366 aa  359  3e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02755  chorismate synthase  52.62 
 
 		 365 aa  357  1.9999999999999998e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0341392  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2168  chorismate synthase  52.44 
 
 		 361 aa  355  5.999999999999999e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0858  chorismate synthase  53.91 
 
 		 366 aa  353  2e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.52804e-17  unclonable  0.0000000936669 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2938  chorismate synthase  52.91 
 
 		 369 aa  353  2e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2159  chorismate synthase  52.03 
 
 		 365 aa  352  4e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2451  chorismate synthase  51.74 
 
 		 364 aa  352  5e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1360  chorismate synthase  54.65 
 
 		 366 aa  352  5e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767963  normal  0.499065 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0041  chorismate synthase  57.31 
 
 		 351 aa  352  7e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0022126  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3074  chorismate synthase  54.49 
 
 		 376 aa  352  8e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1607  chorismate synthase  51.74 
 
 		 364 aa  351  1e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  normal  0.360545 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2846  chorismate synthase  51.74 
 
 		 364 aa  351  1e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000803726 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2752  chorismate synthase  51.74 
 
 		 364 aa  351  1e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.200726  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2769  chorismate synthase  51.74 
 
 		 364 aa  351  1e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.116753  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2091  chorismate synthase  53.51 
 
 		 371 aa  349  3e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1537  chorismate synthase  52.03 
 
 		 364 aa  349  4e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1569  chorismate synthase  54.49 
 
 		 366 aa  349  4e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1623  chorismate synthase  50.42 
 
 		 363 aa  348  5e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2667  chorismate synthase  51.16 
 
 		 364 aa  349  5e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2745  chorismate synthase  53.94 
 
 		 365 aa  348  8e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0513827 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0846  chorismate synthase  52.35 
 
 		 371 aa  348  9e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.742224 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2626  chorismate synthase  55.52 
 
 		 361 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000317199 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2573  chorismate synthase  55.52 
 
 		 361 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1538  chorismate synthase  52.05 
 
 		 366 aa  347  2e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2767  chorismate synthase  53.78 
 
 		 366 aa  347  2e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3801  chorismate synthase  53.74 
 
 		 364 aa  347  2e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2613  chorismate synthase  55.23 
 
 		 361 aa  346  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.730292  normal  0.55052 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2737  chorismate synthase  55.23 
 
 		 361 aa  346  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2524  chorismate synthase  55.23 
 
 		 361 aa  346  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1525  chorismate synthase  54.49 
 
 		 385 aa  346  3e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0632175 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1226  chorismate synthase  52.62 
 
 		 366 aa  345  4e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0161922 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2090  chorismate synthase  53.06 
 
 		 354 aa  345  5e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0281395  normal  0.0647066 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02254  chorismate synthase  54.65 
 
 		 361 aa  345  8e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02214  hypothetical protein  54.65 
 
 		 361 aa  345  8e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002863  chorismate synthase  50.43 
 
 		 361 aa  345  8e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2486  chorismate synthase  54.65 
 
 		 361 aa  345  8e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1323  chorismate synthase  54.65 
 
 		 361 aa  345  8e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2624  chorismate synthase  54.65 
 
 		 361 aa  345  8e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3470  chorismate synthase  54.65 
 
 		 361 aa  345  8e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1327  Chorismate synthase  54.65 
 
 		 361 aa  345  8.999999999999999e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.54496  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2481  chorismate synthase  54.65 
 
 		 361 aa  345  8.999999999999999e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2470  chorismate synthase  52.63 
 
 		 361 aa  344  1e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2244  chorismate synthase  52.03 
 
 		 365 aa  343  2e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1076  chorismate synthase  52.15 
 
 		 352 aa  343  2e-93  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.306004  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1012  chorismate synthase  50.99 
 
 		 366 aa  343  2e-93  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2466  chorismate synthase  51.31 
 
 		 361 aa  343  2e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.358807  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0938  chorismate synthase  52.15 
 
 		 352 aa  343  2e-93  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.464022  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3150  chorismate synthase  49.45 
 
 		 373 aa  343  2.9999999999999997e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1740  chorismate synthase  52.84 
 
 		 368 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.544591 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03114  chorismate synthase  49.86 
 
 		 384 aa  342  4e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1814  chorismate synthase  53.62 
 
 		 367 aa  342  7e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3830  chorismate synthase  52.3 
 
 		 358 aa  342  8e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3132  chorismate synthase  52.44 
 
 		 357 aa  341  8e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111802  normal  0.087423 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1341  chorismate synthase  54.78 
 
 		 366 aa  341  8e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1438  chorismate synthase  54.2 
 
 		 366 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1212  chorismate synthase  51.8 
 
 		 361 aa  340  1e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.535517 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1381  chorismate synthase  54.49 
 
 		 366 aa  340  1e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.674702 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0978  chorismate synthase  54.49 
 
 		 366 aa  340  1e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1241  chorismate synthase  53.49 
 
 		 366 aa  341  1e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1460  chorismate synthase  54.49 
 
 		 366 aa  340  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2707  chorismate synthase  54.36 
 
 		 361 aa  341  1e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1972  chorismate synthase  51.88 
 
 		 363 aa  340  2e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4605  chorismate synthase  54.78 
 
 		 366 aa  340  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0590951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1640  chorismate synthase  51.88 
 
 		 363 aa  340  2e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503125 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4112  chorismate synthase  51.52 
 
 		 363 aa  340  2e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356503  normal  0.0141233 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3161  chorismate synthase  51.02 
 
 		 364 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1314  chorismate synthase  50.42 
 
 		 361 aa  339  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1657  chorismate synthase  53.04 
 
 		 366 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112196  normal  0.0287757 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2877  chorismate synthase  54.07 
 
 		 354 aa  339  4e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1987  chorismate synthase  53.04 
 
 		 366 aa  339  4e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1868  chorismate synthase  51.23 
 
 		 373 aa  339  4e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.423516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1789  chorismate synthase  53.62 
 
 		 366 aa  338  5e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2614  chorismate synthase  53.2 
 
 		 369 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1689  chorismate synthase  52.91 
 
 		 369 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.537327  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2064  chorismate synthase  49.71 
 
 		 354 aa  337  9.999999999999999e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1408  chorismate synthase  53.47 
 
 		 353 aa  337  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.422248 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1867  chorismate synthase  52.91 
 
 		 369 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0797858  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1713  chorismate synthase  52.91 
 
 		 369 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193941  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1952  chorismate synthase  52.3 
 
 		 358 aa  338  9.999999999999999e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1018  chorismate synthase  49.42 
 
 		 362 aa  337  9.999999999999999e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1481  chorismate synthase  52.91 
 
 		 369 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.470447  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0946  chorismate synthase  52.91 
 
 		 369 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.718045  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2811  chorismate synthase  52.91 
 
 		 361 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.655428  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0401  chorismate synthase  52.91 
 
 		 369 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1138  chorismate synthase  54.94 
 
 		 369 aa  336  2.9999999999999997e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.26701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1394  chorismate synthase  50.56 
 
 		 362 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187693  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0762  chorismate synthase  52.91 
 
 		 430 aa  335  5e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0691461  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0770  chorismate synthase  51.24 
 
 		 366 aa  335  5e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.742046  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1699  chorismate synthase  51.86 
 
 		 361 aa  335  7e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2251  chorismate synthase  52.33 
 
 		 352 aa  335  7e-91  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2222  chorismate synthase  50.43 
 
 		 352 aa  334  1e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2856  chorismate synthase  51.3 
 
 		 367 aa  334  1e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1453  chorismate synthase  52.62 
 
 		 361 aa  333  2e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.71846  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1568  chorismate synthase  51.29 
 
 		 364 aa  333  2e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>