More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1868 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1868  chorismate synthase  100 
 
 		 373 aa  763    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.423516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0846  chorismate synthase  80.71 
 
 		 371 aa  630  1e-179  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.742224 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1394  chorismate synthase  79.56 
 
 		 362 aa  595  1e-169  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187693  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1212  chorismate synthase  78.73 
 
 		 361 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.535517 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2470  chorismate synthase  78.45 
 
 		 361 aa  586  1e-166  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1314  chorismate synthase  77.35 
 
 		 361 aa  585  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1142  chorismate synthase  77.62 
 
 		 362 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  0.271094 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0770  chorismate synthase  77.87 
 
 		 366 aa  579  1e-164  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.742046  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0629  chorismate synthase  76.78 
 
 		 368 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4138  chorismate synthase  72.83 
 
 		 370 aa  553  1e-156  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0341634 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2757  chorismate synthase  73.15 
 
 		 366 aa  541  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0933744 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0392  chorismate synthase  74.38 
 
 		 390 aa  537  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0730  chorismate synthase  71.58 
 
 		 364 aa  531  1e-150  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0627  chorismate synthase  70.44 
 
 		 365 aa  527  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0254313 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3216  chorismate synthase  74.45 
 
 		 366 aa  527  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.279354  normal  0.10403 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2990  chorismate synthase  74.18 
 
 		 366 aa  527  1e-148  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3176  chorismate synthase  73.9 
 
 		 366 aa  524  1e-147  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0586  chorismate synthase  69.89 
 
 		 365 aa  523  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0397  chorismate synthase  67.4 
 
 		 364 aa  523  1e-147  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.209987  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1873  chorismate synthase  74.18 
 
 		 371 aa  524  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3132  chorismate synthase  70.8 
 
 		 357 aa  521  1e-147  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111802  normal  0.087423 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0539  chorismate synthase  70.17 
 
 		 364 aa  518  1e-146  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0428  chorismate synthase  70.17 
 
 		 364 aa  520  1e-146  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0435  chorismate synthase  70.17 
 
 		 364 aa  520  1e-146  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0785  chorismate synthase  71.82 
 
 		 365 aa  511  1e-144  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229169 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0515  chorismate synthase  69.89 
 
 		 365 aa  513  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3961  chorismate synthase  67.56 
 
 		 421 aa  501  1e-141  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168181  normal  0.429407 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1320  chorismate synthase  70.6 
 
 		 369 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0852715  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1015  chorismate synthase  68.78 
 
 		 364 aa  493  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0855  chorismate synthase  68.7 
 
 		 363 aa  487  1e-136  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2797  chorismate synthase  66.94 
 
 		 368 aa  480  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4770  chorismate synthase  67.68 
 
 		 356 aa  467  9.999999999999999e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00112305  normal  0.0417622 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0057  chorismate synthase  65.85 
 
 		 366 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.14254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1389  chorismate synthase  65.85 
 
 		 366 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0009  chorismate synthase  66.3 
 
 		 356 aa  456  1e-127  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3275  chorismate synthase  64.67 
 
 		 367 aa  449  1e-125  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0331  chorismate synthase  64.58 
 
 		 370 aa  451  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.288386 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4332  chorismate synthase  64.21 
 
 		 366 aa  450  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.259213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0659  chorismate synthase  64.29 
 
 		 358 aa  439  9.999999999999999e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.463158  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2819  chorismate synthase  61.85 
 
 		 370 aa  436  1e-121  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0159117  normal  0.634482 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3619  chorismate synthase  62.43 
 
 		 361 aa  435  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000281464  normal  0.087707 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2623  chorismate synthase  64.03 
 
 		 366 aa  432  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1568  chorismate synthase  60.38 
 
 		 364 aa  432  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03114  chorismate synthase  60.33 
 
 		 384 aa  429  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002863  chorismate synthase  59.78 
 
 		 361 aa  427  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2938  chorismate synthase  61.16 
 
 		 369 aa  425  1e-118  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2466  chorismate synthase  59.94 
 
 		 361 aa  426  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.358807  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0377  chorismate synthase  61.14 
 
 		 361 aa  422  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1405  chorismate synthase  61.14 
 
 		 361 aa  422  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.47258  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1514  chorismate synthase  61.14 
 
 		 361 aa  422  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.85122  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1241  chorismate synthase  58.74 
 
 		 366 aa  420  1e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3074  chorismate synthase  59.29 
 
 		 376 aa  421  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1327  Chorismate synthase  61.16 
 
 		 361 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.54496  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2626  chorismate synthase  61.98 
 
 		 361 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000317199 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2481  chorismate synthase  61.16 
 
 		 361 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2613  chorismate synthase  61.98 
 
 		 361 aa  415  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.730292  normal  0.55052 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2091  chorismate synthase  58.08 
 
 		 371 aa  417  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2244  chorismate synthase  58.13 
 
 		 365 aa  415  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2524  chorismate synthase  61.98 
 
 		 361 aa  415  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2737  chorismate synthase  61.98 
 
 		 361 aa  415  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1226  chorismate synthase  59.02 
 
 		 366 aa  416  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0161922 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2573  chorismate synthase  61.98 
 
 		 361 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02254  chorismate synthase  60.88 
 
 		 361 aa  414  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2486  chorismate synthase  60.88 
 
 		 361 aa  414  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02214  hypothetical protein  60.88 
 
 		 361 aa  414  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2251  chorismate synthase  60.88 
 
 		 352 aa  413  1e-114  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2222  chorismate synthase  60.88 
 
 		 352 aa  411  1e-114  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3470  chorismate synthase  60.88 
 
 		 361 aa  414  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2624  chorismate synthase  60.88 
 
 		 361 aa  413  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1323  chorismate synthase  60.88 
 
 		 361 aa  414  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0702  chorismate synthase  58.4 
 
 		 366 aa  409  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1814  chorismate synthase  58.4 
 
 		 367 aa  408  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2811  chorismate synthase  59.29 
 
 		 361 aa  408  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.655428  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4605  chorismate synthase  57.65 
 
 		 366 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0590951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1438  chorismate synthase  57.65 
 
 		 366 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1740  chorismate synthase  59.23 
 
 		 368 aa  410  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.544591 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1789  chorismate synthase  57.38 
 
 		 366 aa  408  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2168  chorismate synthase  57.02 
 
 		 361 aa  410  1e-113  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0978  chorismate synthase  57.92 
 
 		 366 aa  411  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1541  chorismate synthase  57.3 
 
 		 366 aa  410  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1341  chorismate synthase  57.38 
 
 		 366 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1460  chorismate synthase  57.92 
 
 		 366 aa  411  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2707  chorismate synthase  60.61 
 
 		 361 aa  408  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1381  chorismate synthase  57.65 
 
 		 366 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.674702 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1018  chorismate synthase  57.85 
 
 		 362 aa  409  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02755  chorismate synthase  57.85 
 
 		 365 aa  406  1.0000000000000001e-112  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0341392  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0858  chorismate synthase  58.54 
 
 		 366 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.52804e-17  unclonable  0.0000000936669 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2856  chorismate synthase  57.53 
 
 		 367 aa  407  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2159  chorismate synthase  57.02 
 
 		 365 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2752  chorismate synthase  56.75 
 
 		 364 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.200726  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1607  chorismate synthase  56.75 
 
 		 364 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  normal  0.360545 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2451  chorismate synthase  56.75 
 
 		 364 aa  403  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1640  chorismate synthase  56.75 
 
 		 363 aa  403  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503125 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3374  chorismate synthase  58.47 
 
 		 361 aa  403  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1538  chorismate synthase  56.28 
 
 		 366 aa  404  1e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2846  chorismate synthase  56.75 
 
 		 364 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000803726 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1972  chorismate synthase  56.75 
 
 		 363 aa  403  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2769  chorismate synthase  56.75 
 
 		 364 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.116753  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2877  chorismate synthase  60.06 
 
 		 361 aa  403  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0472598  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3161  chorismate synthase  56.91 
 
 		 364 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>