More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2990 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_2990  chorismate synthase  100 
 
 
366 aa  746    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3216  chorismate synthase  98.91 
 
 
366 aa  739    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.279354  normal  0.10403 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3176  chorismate synthase  94.52 
 
 
366 aa  668    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2757  chorismate synthase  92.54 
 
 
366 aa  671    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0933744 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0392  chorismate synthase  83.61 
 
 
390 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1873  chorismate synthase  84.93 
 
 
371 aa  598  1e-170  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1142  chorismate synthase  78.79 
 
 
362 aa  594  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  0.271094 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2470  chorismate synthase  77.69 
 
 
361 aa  592  1e-168  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0770  chorismate synthase  77.03 
 
 
366 aa  591  1e-168  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.742046  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0846  chorismate synthase  76.23 
 
 
371 aa  588  1e-167  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.742224 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1314  chorismate synthase  76.86 
 
 
361 aa  585  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1212  chorismate synthase  77.41 
 
 
361 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.535517 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0629  chorismate synthase  76.09 
 
 
368 aa  578  1e-164  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1394  chorismate synthase  77.13 
 
 
362 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187693  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1868  chorismate synthase  74.18 
 
 
373 aa  569  1e-161  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.423516  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4138  chorismate synthase  72.8 
 
 
370 aa  560  1e-158  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0341634 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0586  chorismate synthase  73.28 
 
 
365 aa  556  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0627  chorismate synthase  73 
 
 
365 aa  555  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0254313 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0730  chorismate synthase  71.58 
 
 
364 aa  556  1e-157  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0539  chorismate synthase  73.55 
 
 
364 aa  550  1e-155  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0428  chorismate synthase  71.9 
 
 
364 aa  541  1e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0435  chorismate synthase  71.9 
 
 
364 aa  541  1e-153  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0785  chorismate synthase  74.66 
 
 
365 aa  535  1e-151  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.229169 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0515  chorismate synthase  72.18 
 
 
365 aa  533  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0397  chorismate synthase  67.22 
 
 
364 aa  531  1e-149  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.209987  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1015  chorismate synthase  73.28 
 
 
364 aa  528  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3961  chorismate synthase  72.45 
 
 
421 aa  524  1e-148  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168181  normal  0.429407 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3132  chorismate synthase  69.78 
 
 
357 aa  513  1e-144  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111802  normal  0.087423 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1320  chorismate synthase  72.33 
 
 
369 aa  505  9.999999999999999e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0852715  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2797  chorismate synthase  69.21 
 
 
368 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0057  chorismate synthase  70.3 
 
 
366 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.14254  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1389  chorismate synthase  70.3 
 
 
366 aa  489  1e-137  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0855  chorismate synthase  69.15 
 
 
363 aa  489  1e-137  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4332  chorismate synthase  68.56 
 
 
366 aa  484  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.259213  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3275  chorismate synthase  68.65 
 
 
367 aa  478  1e-133  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4770  chorismate synthase  68.6 
 
 
356 aa  473  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00112305  normal  0.0417622 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0331  chorismate synthase  66.94 
 
 
370 aa  468  1.0000000000000001e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.288386 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2819  chorismate synthase  65.76 
 
 
370 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0159117  normal  0.634482 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0009  chorismate synthase  68.6 
 
 
356 aa  466  9.999999999999999e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2466  chorismate synthase  63.39 
 
 
361 aa  465  9.999999999999999e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.358807  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3619  chorismate synthase  65.29 
 
 
361 aa  465  9.999999999999999e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000281464  normal  0.087707 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0659  chorismate synthase  66.85 
 
 
358 aa  462  1e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.463158  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1568  chorismate synthase  63.76 
 
 
364 aa  464  1e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2623  chorismate synthase  66.58 
 
 
366 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03114  chorismate synthase  60 
 
 
384 aa  449  1e-125  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2938  chorismate synthase  61.1 
 
 
369 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002863  chorismate synthase  59.45 
 
 
361 aa  443  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1241  chorismate synthase  61.31 
 
 
366 aa  443  1e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2168  chorismate synthase  60.82 
 
 
361 aa  443  1e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2091  chorismate synthase  60.66 
 
 
371 aa  444  1e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0702  chorismate synthase  61.37 
 
 
366 aa  434  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1538  chorismate synthase  58.58 
 
 
366 aa  436  1e-121  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1537  chorismate synthase  60 
 
 
364 aa  437  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2667  chorismate synthase  60.27 
 
 
364 aa  435  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02254  chorismate synthase  61.85 
 
 
361 aa  432  1e-120  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1327  Chorismate synthase  62.13 
 
 
361 aa  433  1e-120  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.54496  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3470  chorismate synthase  61.85 
 
 
361 aa  432  1e-120  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2524  chorismate synthase  61.58 
 
 
361 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2486  chorismate synthase  61.85 
 
 
361 aa  432  1e-120  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519758  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1323  chorismate synthase  61.85 
 
 
361 aa  432  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02214  hypothetical protein  61.85 
 
 
361 aa  432  1e-120  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2481  chorismate synthase  62.13 
 
 
361 aa  433  1e-120  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2737  chorismate synthase  61.58 
 
 
361 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2573  chorismate synthase  61.58 
 
 
361 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2626  chorismate synthase  61.58 
 
 
361 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000317199 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1740  chorismate synthase  61.31 
 
 
368 aa  431  1e-120  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.544591 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2624  chorismate synthase  61.85 
 
 
361 aa  432  1e-120  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2613  chorismate synthase  61.58 
 
 
361 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.730292  normal  0.55052 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2159  chorismate synthase  59.18 
 
 
365 aa  431  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2752  chorismate synthase  58.9 
 
 
364 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.200726  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2846  chorismate synthase  58.9 
 
 
364 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000803726 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1814  chorismate synthase  61.31 
 
 
367 aa  431  1e-119  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2877  chorismate synthase  62.06 
 
 
361 aa  431  1e-119  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0472598  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1607  chorismate synthase  58.9 
 
 
364 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  normal  0.360545 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1514  chorismate synthase  61.04 
 
 
361 aa  431  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.85122  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2707  chorismate synthase  61.58 
 
 
361 aa  430  1e-119  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0377  chorismate synthase  61.04 
 
 
361 aa  431  1e-119  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2244  chorismate synthase  59.95 
 
 
365 aa  431  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2769  chorismate synthase  58.9 
 
 
364 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.116753  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1405  chorismate synthase  61.04 
 
 
361 aa  431  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.47258  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1226  chorismate synthase  59.62 
 
 
366 aa  430  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0161922 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3074  chorismate synthase  59.4 
 
 
376 aa  428  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1699  chorismate synthase  60.55 
 
 
361 aa  427  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3374  chorismate synthase  59.67 
 
 
361 aa  425  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02755  chorismate synthase  56.99 
 
 
365 aa  425  1e-118  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0341392  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2451  chorismate synthase  58.63 
 
 
364 aa  426  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1345  chorismate synthase  60.99 
 
 
361 aa  423  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.607384  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1640  chorismate synthase  57.49 
 
 
363 aa  423  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000503125 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2811  chorismate synthase  60.22 
 
 
361 aa  424  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.655428  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1018  chorismate synthase  58.08 
 
 
362 aa  424  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0858  chorismate synthase  59.67 
 
 
366 aa  422  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.52804e-17  unclonable  0.0000000936669 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1789  chorismate synthase  59.13 
 
 
366 aa  423  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681987  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4605  chorismate synthase  59.13 
 
 
366 aa  422  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0590951  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1972  chorismate synthase  57.49 
 
 
363 aa  423  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1541  chorismate synthase  57.49 
 
 
366 aa  423  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2593  chorismate synthase  61.85 
 
 
361 aa  422  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2767  chorismate synthase  59.95 
 
 
366 aa  422  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1713  chorismate synthase  58.86 
 
 
369 aa  418  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193941  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3150  chorismate synthase  57.6 
 
 
373 aa  421  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1958  chorismate synthase  61.04 
 
 
393 aa  419  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>