More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0730 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0730  chorismate synthase  100 
 
 		 364 aa  746    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0428  chorismate synthase  77.81 
 
 		 364 aa  578  1e-164  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0435  chorismate synthase  77.81 
 
 		 364 aa  578  1e-164  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0539  chorismate synthase  78.36 
 
 		 364 aa  579  1e-164  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0627  chorismate synthase  76.44 
 
 		 365 aa  578  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0254313 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0515  chorismate synthase  77.53 
 
 		 365 aa  570  1.0000000000000001e-162  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0586  chorismate synthase  75.89 
 
 		 365 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2470  chorismate synthase  75.27 
 
 		 361 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4138  chorismate synthase  72.8 
 
 		 370 aa  558  1e-158  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0341634 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0770  chorismate synthase  73.02 
 
 		 366 aa  556  1e-157  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.742046  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1394  chorismate synthase  73.9 
 
 		 362 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187693  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0846  chorismate synthase  73.77 
 
 		 371 aa  552  1e-156  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.742224 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1212  chorismate synthase  73.63 
 
 		 361 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.535517 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0397  chorismate synthase  72.53 
 
 		 364 aa  546  1e-154  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.209987  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1314  chorismate synthase  72.25 
 
 		 361 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1142  chorismate synthase  71.7 
 
 		 362 aa  541  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  0.271094 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1015  chorismate synthase  75 
 
 		 364 aa  541  1e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0629  chorismate synthase  72.63 
 
 		 368 aa  540  9.999999999999999e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2757  chorismate synthase  72.75 
 
 		 366 aa  537  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0933744 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1868  chorismate synthase  71.58 
 
 		 373 aa  531  1e-150  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.423516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3176  chorismate synthase  72.6 
 
 		 366 aa  519  1e-146  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3216  chorismate synthase  71.58 
 
 		 366 aa  518  1e-146  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.279354  normal  0.10403 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0392  chorismate synthase  71.23 
 
 		 390 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2990  chorismate synthase  71.58 
 
 		 366 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3132  chorismate synthase  69.7 
 
 		 357 aa  508  1e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111802  normal  0.087423 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1873  chorismate synthase  72.13 
 
 		 371 aa  504  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0785  chorismate synthase  69.61 
 
 		 365 aa  501  1e-141  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229169 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3961  chorismate synthase  67.21 
 
 		 421 aa  492  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168181  normal  0.429407 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1320  chorismate synthase  68.68 
 
 		 369 aa  483  1e-135  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0852715  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2797  chorismate synthase  65.57 
 
 		 368 aa  474  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4332  chorismate synthase  63.93 
 
 		 366 aa  460  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.259213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0057  chorismate synthase  64.75 
 
 		 366 aa  455  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.14254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1389  chorismate synthase  65.03 
 
 		 366 aa  457  1e-127  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3275  chorismate synthase  63.59 
 
 		 367 aa  451  1.0000000000000001e-126  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2819  chorismate synthase  62.4 
 
 		 370 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0159117  normal  0.634482 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2623  chorismate synthase  65.94 
 
 		 366 aa  450  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4770  chorismate synthase  64.92 
 
 		 356 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00112305  normal  0.0417622 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0331  chorismate synthase  63.49 
 
 		 370 aa  446  1.0000000000000001e-124  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.288386 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0855  chorismate synthase  62.36 
 
 		 363 aa  447  1.0000000000000001e-124  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0659  chorismate synthase  62.36 
 
 		 358 aa  442  1e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.463158  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3619  chorismate synthase  62.71 
 
 		 361 aa  442  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000281464  normal  0.087707 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1568  chorismate synthase  60.55 
 
 		 364 aa  435  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0009  chorismate synthase  62.98 
 
 		 356 aa  431  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1226  chorismate synthase  58.95 
 
 		 366 aa  429  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0161922 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2938  chorismate synthase  59.34 
 
 		 369 aa  427  1e-118  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2466  chorismate synthase  60.61 
 
 		 361 aa  427  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.358807  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3074  chorismate synthase  60 
 
 		 376 aa  424  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0702  chorismate synthase  60.44 
 
 		 366 aa  422  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1241  chorismate synthase  59.73 
 
 		 366 aa  421  1e-117  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1740  chorismate synthase  59.62 
 
 		 368 aa  421  1e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.544591 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4605  chorismate synthase  59.45 
 
 		 366 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0590951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002863  chorismate synthase  57.42 
 
 		 361 aa  411  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0762  chorismate synthase  59.45 
 
 		 430 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0691461  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1814  chorismate synthase  59.07 
 
 		 367 aa  414  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03114  chorismate synthase  57.42 
 
 		 384 aa  412  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1438  chorismate synthase  58.9 
 
 		 366 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0946  chorismate synthase  59.45 
 
 		 369 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.718045  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1481  chorismate synthase  59.45 
 
 		 369 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.470447  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3161  chorismate synthase  59.02 
 
 		 364 aa  412  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2244  chorismate synthase  56.87 
 
 		 365 aa  412  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0978  chorismate synthase  59.18 
 
 		 366 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0401  chorismate synthase  59.45 
 
 		 369 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1789  chorismate synthase  58.63 
 
 		 366 aa  411  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1460  chorismate synthase  59.18 
 
 		 366 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1689  chorismate synthase  59.18 
 
 		 369 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.537327  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2745  chorismate synthase  58.9 
 
 		 365 aa  410  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0513827 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2995  chorismate synthase  58.63 
 
 		 365 aa  408  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212385 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1867  chorismate synthase  59.18 
 
 		 369 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0797858  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1713  chorismate synthase  59.18 
 
 		 369 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193941  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1381  chorismate synthase  58.08 
 
 		 366 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.674702 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1341  chorismate synthase  58.36 
 
 		 366 aa  411  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1327  Chorismate synthase  59.62 
 
 		 361 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.54496  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1658  chorismate synthase  58.63 
 
 		 366 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0858  chorismate synthase  58.63 
 
 		 366 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.52804e-17  unclonable  0.0000000936669 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2168  chorismate synthase  56.32 
 
 		 361 aa  405  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1569  chorismate synthase  58.08 
 
 		 366 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2614  chorismate synthase  58.36 
 
 		 369 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2046  chorismate synthase  58.63 
 
 		 366 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1360  chorismate synthase  57.26 
 
 		 366 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767963  normal  0.499065 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2481  chorismate synthase  59.62 
 
 		 361 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02254  chorismate synthase  59.34 
 
 		 361 aa  404  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2707  chorismate synthase  59.62 
 
 		 361 aa  404  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1257  chorismate synthase  59.18 
 
 		 370 aa  402  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.234528  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1323  chorismate synthase  59.34 
 
 		 361 aa  404  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2767  chorismate synthase  57.26 
 
 		 366 aa  403  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1538  chorismate synthase  55.89 
 
 		 366 aa  403  1e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02214  hypothetical protein  59.34 
 
 		 361 aa  404  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1958  chorismate synthase  59.34 
 
 		 393 aa  401  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2091  chorismate synthase  56.16 
 
 		 371 aa  404  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2486  chorismate synthase  59.34 
 
 		 361 aa  404  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3470  chorismate synthase  59.34 
 
 		 361 aa  404  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2856  chorismate synthase  58.08 
 
 		 367 aa  401  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2624  chorismate synthase  59.34 
 
 		 361 aa  404  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1018  chorismate synthase  56.2 
 
 		 362 aa  403  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3150  chorismate synthase  54.18 
 
 		 373 aa  399  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2251  chorismate synthase  59.23 
 
 		 352 aa  399  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2222  chorismate synthase  59.23 
 
 		 352 aa  400  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4957  chorismate synthase  56.16 
 
 		 389 aa  400  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2613  chorismate synthase  59.07 
 
 		 361 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.730292  normal  0.55052 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2524  chorismate synthase  59.07 
 
 		 361 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>