More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1029 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1029  chorismate synthase  100 
 
 		 335 aa  681    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.979791 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1296  chorismate synthase  64.42 
 
 		 334 aa  436  1e-121  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.576188  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1564  chorismate synthase  60.74 
 
 		 328 aa  409  1e-113  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1226  chorismate synthase  53.11 
 
 		 366 aa  377  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0161922 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3074  chorismate synthase  51.13 
 
 		 376 aa  363  2e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2938  chorismate synthase  51.59 
 
 		 369 aa  359  3e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1814  chorismate synthase  53.18 
 
 		 367 aa  359  4e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2168  chorismate synthase  51.3 
 
 		 361 aa  358  6e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1657  chorismate synthase  54.05 
 
 		 366 aa  358  7e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112196  normal  0.0287757 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1538  chorismate synthase  52.46 
 
 		 366 aa  358  9e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1987  chorismate synthase  54.05 
 
 		 366 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1541  chorismate synthase  51.59 
 
 		 366 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2745  chorismate synthase  52.14 
 
 		 365 aa  357  1.9999999999999998e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0513827 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0858  chorismate synthase  51.01 
 
 		 366 aa  355  6.999999999999999e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.52804e-17  unclonable  0.0000000936669 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2222  chorismate synthase  55.78 
 
 		 352 aa  353  2e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02755  chorismate synthase  53.04 
 
 		 365 aa  353  2.9999999999999997e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0341392  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2604  chorismate synthase  60.79 
 
 		 331 aa  352  5e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1568  chorismate synthase  51.73 
 
 		 364 aa  352  5e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1569  chorismate synthase  51.88 
 
 		 366 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3161  chorismate synthase  51.74 
 
 		 364 aa  352  7e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2091  chorismate synthase  51.45 
 
 		 371 aa  352  7e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2251  chorismate synthase  55.49 
 
 		 352 aa  351  8e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1360  chorismate synthase  51.59 
 
 		 366 aa  351  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767963  normal  0.499065 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2767  chorismate synthase  51.3 
 
 		 366 aa  350  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2466  chorismate synthase  49.86 
 
 		 361 aa  350  2e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.358807  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002863  chorismate synthase  50.43 
 
 		 361 aa  350  2e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03114  chorismate synthase  49.86 
 
 		 384 aa  349  3e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1740  chorismate synthase  50.43 
 
 		 368 aa  349  4e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.544591 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4957  chorismate synthase  51.45 
 
 		 389 aa  349  5e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2159  chorismate synthase  49.57 
 
 		 365 aa  348  8e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1525  chorismate synthase  50.43 
 
 		 385 aa  347  2e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0632175 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1241  chorismate synthase  50.29 
 
 		 366 aa  346  3e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1018  chorismate synthase  50.43 
 
 		 362 aa  346  4e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1138  chorismate synthase  52.84 
 
 		 369 aa  345  8e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.26701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1607  chorismate synthase  48.86 
 
 		 364 aa  344  1e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  normal  0.360545 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1537  chorismate synthase  49.57 
 
 		 364 aa  344  1e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0161  chorismate synthase  51.37 
 
 		 373 aa  344  1e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.900075  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3150  chorismate synthase  48.45 
 
 		 373 aa  343  2e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2846  chorismate synthase  48.58 
 
 		 364 aa  343  2e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000803726 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2769  chorismate synthase  48.58 
 
 		 364 aa  343  2e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.116753  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1341  chorismate synthase  50.72 
 
 		 366 aa  343  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2752  chorismate synthase  48.58 
 
 		 364 aa  343  2e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.200726  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0762  chorismate synthase  49.86 
 
 		 430 aa  342  4e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0691461  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1481  chorismate synthase  49.86 
 
 		 369 aa  342  4e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.470447  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0946  chorismate synthase  49.86 
 
 		 369 aa  342  4e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.718045  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1789  chorismate synthase  50.43 
 
 		 366 aa  342  4e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1972  chorismate synthase  49.86 
 
 		 363 aa  342  5e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1640  chorismate synthase  49.86 
 
 		 363 aa  342  5e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503125 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1438  chorismate synthase  50.72 
 
 		 366 aa  342  5e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2614  chorismate synthase  50.14 
 
 		 369 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0401  chorismate synthase  49.86 
 
 		 369 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1689  chorismate synthase  49.86 
 
 		 369 aa  342  7e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.537327  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1867  chorismate synthase  49.86 
 
 		 369 aa  342  7e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0797858  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1713  chorismate synthase  49.86 
 
 		 369 aa  342  7e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193941  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1958  chorismate synthase  51.59 
 
 		 393 aa  341  8e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1381  chorismate synthase  50.72 
 
 		 366 aa  341  8e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.674702 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0978  chorismate synthase  50.72 
 
 		 366 aa  341  9e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1460  chorismate synthase  50.72 
 
 		 366 aa  341  9e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1566  chorismate synthase  53.91 
 
 		 366 aa  341  1e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2470  chorismate synthase  51.82 
 
 		 361 aa  340  1e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2451  chorismate synthase  48.3 
 
 		 364 aa  341  1e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2797  chorismate synthase  50.85 
 
 		 368 aa  340  1e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2244  chorismate synthase  50 
 
 		 365 aa  340  2e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2995  chorismate synthase  49.15 
 
 		 365 aa  340  2e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212385 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4605  chorismate synthase  50.72 
 
 		 366 aa  340  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0590951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0938  chorismate synthase  50.14 
 
 		 352 aa  340  2e-92  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.464022  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1076  chorismate synthase  50.14 
 
 		 352 aa  340  2e-92  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.306004  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1012  chorismate synthase  50.97 
 
 		 366 aa  340  2e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1833  chorismate synthase  53.18 
 
 		 365 aa  340  2e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.306795  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1425  chorismate synthase  49.72 
 
 		 368 aa  340  2e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865922 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1257  chorismate synthase  51.99 
 
 		 370 aa  339  2.9999999999999998e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.234528  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0666  chorismate synthase  49.57 
 
 		 366 aa  338  9.999999999999999e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0639836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1658  chorismate synthase  49.72 
 
 		 366 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01260  chorismate synthase  49.42 
 
 		 367 aa  337  1.9999999999999998e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2667  chorismate synthase  48.7 
 
 		 364 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0702  chorismate synthase  50.29 
 
 		 366 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1438  chorismate synthase  49.58 
 
 		 365 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42760  chorismate synthase  51 
 
 		 363 aa  335  5e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1699  chorismate synthase  51.01 
 
 		 361 aa  335  9e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2580  chorismate synthase  49.57 
 
 		 365 aa  334  1e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.03113 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2856  chorismate synthase  48.55 
 
 		 367 aa  334  1e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1842  chorismate synthase  52.62 
 
 		 365 aa  334  1e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.473892  normal  0.107896 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3132  chorismate synthase  50.57 
 
 		 357 aa  333  2e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111802  normal  0.087423 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3591  chorismate synthase  51.14 
 
 		 363 aa  333  2e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0041  chorismate synthase  53.51 
 
 		 351 aa  333  2e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0022126  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2046  chorismate synthase  49.15 
 
 		 366 aa  333  2e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02254  chorismate synthase  50.85 
 
 		 361 aa  332  4e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1327  Chorismate synthase  50.85 
 
 		 361 aa  332  4e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.54496  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2486  chorismate synthase  50.85 
 
 		 361 aa  332  4e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2481  chorismate synthase  50.85 
 
 		 361 aa  332  4e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1323  chorismate synthase  50.85 
 
 		 361 aa  332  4e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3470  chorismate synthase  50.85 
 
 		 361 aa  332  4e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02214  hypothetical protein  50.85 
 
 		 361 aa  332  4e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2624  chorismate synthase  51.88 
 
 		 361 aa  332  5e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2707  chorismate synthase  50.85 
 
 		 361 aa  332  5e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0846  chorismate synthase  49.02 
 
 		 371 aa  332  6e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.742224 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2023  chorismate synthase  50.88 
 
 		 358 aa  331  1e-89  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0114  chorismate synthase  50.28 
 
 		 366 aa  331  1e-89  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2877  chorismate synthase  50.72 
 
 		 361 aa  330  2e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0472598  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1345  chorismate synthase  50.86 
 
 		 361 aa  330  2e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.607384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>