More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_1625 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1806  chorismate synthase  98.62 
 
 
362 aa  723    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1625  chorismate synthase  100 
 
 
362 aa  733    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.511164  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1994  chorismate synthase  98.07 
 
 
362 aa  721    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1493  chorismate synthase  69.25 
 
 
362 aa  510  1e-143  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1741  chorismate synthase  62.4 
 
 
356 aa  466  9.999999999999999e-131  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0114  chorismate synthase  60.82 
 
 
366 aa  454  1.0000000000000001e-126  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2064  chorismate synthase  60 
 
 
354 aa  436  1e-121  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1974  chorismate synthase  58.5 
 
 
358 aa  412  1e-114  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2023  chorismate synthase  57.22 
 
 
358 aa  409  1e-113  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1538  chorismate synthase  48.01 
 
 
366 aa  330  2e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2466  chorismate synthase  47.59 
 
 
361 aa  330  3e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.358807  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2938  chorismate synthase  45.48 
 
 
369 aa  324  2e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1438  chorismate synthase  45.56 
 
 
365 aa  321  9.999999999999999e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2091  chorismate synthase  46.59 
 
 
371 aa  318  6e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1814  chorismate synthase  46.33 
 
 
367 aa  318  7e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2244  chorismate synthase  45.76 
 
 
365 aa  318  7.999999999999999e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2168  chorismate synthase  46.18 
 
 
361 aa  318  1e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3074  chorismate synthase  47.28 
 
 
376 aa  318  1e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1012  chorismate synthase  46.13 
 
 
366 aa  317  1e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1952  chorismate synthase  45.25 
 
 
358 aa  318  1e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2767  chorismate synthase  46.82 
 
 
366 aa  318  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1569  chorismate synthase  47.11 
 
 
366 aa  318  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453683  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1360  chorismate synthase  46.82 
 
 
366 aa  317  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767963  normal  0.499065 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0161  chorismate synthase  46.07 
 
 
373 aa  317  2e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.900075  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3830  chorismate synthase  45.13 
 
 
358 aa  317  2e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1972  chorismate synthase  44.07 
 
 
363 aa  316  5e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1640  chorismate synthase  44.07 
 
 
363 aa  316  5e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000503125 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4957  chorismate synthase  48.15 
 
 
389 aa  315  7e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1408  chorismate synthase  47.14 
 
 
353 aa  315  9e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.422248 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1568  chorismate synthase  45.74 
 
 
364 aa  314  9.999999999999999e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4064  chorismate synthase  47.62 
 
 
359 aa  315  9.999999999999999e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000659407  hitchhiker  0.000000405427 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0401  chorismate synthase  47.16 
 
 
369 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03114  chorismate synthase  44.6 
 
 
384 aa  315  9.999999999999999e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3801  chorismate synthase  44.97 
 
 
364 aa  315  9.999999999999999e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0858  chorismate synthase  46.86 
 
 
366 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.52804e-17  unclonable  0.0000000936669 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4138  chorismate synthase  45.92 
 
 
370 aa  313  3.9999999999999997e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0341634 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002863  chorismate synthase  44.89 
 
 
361 aa  313  3.9999999999999997e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2451  chorismate synthase  44.69 
 
 
364 aa  311  7.999999999999999e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1327  Chorismate synthase  46.76 
 
 
361 aa  311  9e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.54496  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2481  chorismate synthase  46.76 
 
 
361 aa  311  9e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2797  chorismate synthase  45.53 
 
 
368 aa  311  1e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2707  chorismate synthase  46.76 
 
 
361 aa  311  1e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1241  chorismate synthase  45.09 
 
 
366 aa  311  1e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2159  chorismate synthase  46.48 
 
 
365 aa  311  1e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02254  chorismate synthase  46.76 
 
 
361 aa  311  2e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2090  chorismate synthase  45.53 
 
 
354 aa  310  2e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0281395  normal  0.0647066 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0946  chorismate synthase  46.88 
 
 
369 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.718045  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2486  chorismate synthase  46.76 
 
 
361 aa  311  2e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519758  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2624  chorismate synthase  46.76 
 
 
361 aa  311  2e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0762  chorismate synthase  46.88 
 
 
430 aa  311  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0691461  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1481  chorismate synthase  46.88 
 
 
369 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.470447  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1958  chorismate synthase  45.2 
 
 
393 aa  310  2e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3470  chorismate synthase  46.76 
 
 
361 aa  311  2e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1537  chorismate synthase  46.2 
 
 
364 aa  310  2e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1541  chorismate synthase  46.2 
 
 
366 aa  310  2e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02214  hypothetical protein  46.76 
 
 
361 aa  311  2e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1323  chorismate synthase  46.76 
 
 
361 aa  311  2e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2614  chorismate synthase  45.56 
 
 
369 aa  309  5e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1438  chorismate synthase  45.38 
 
 
366 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1689  chorismate synthase  45.27 
 
 
369 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.537327  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1713  chorismate synthase  45.27 
 
 
369 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193941  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1867  chorismate synthase  45.27 
 
 
369 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0797858  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1226  chorismate synthase  45.95 
 
 
366 aa  308  6.999999999999999e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0161922 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1607  chorismate synthase  45.92 
 
 
364 aa  308  8e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  normal  0.360545 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1868  chorismate synthase  44.1 
 
 
373 aa  308  1.0000000000000001e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.423516  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3374  chorismate synthase  47.22 
 
 
361 aa  307  1.0000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2752  chorismate synthase  45.63 
 
 
364 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.200726  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2769  chorismate synthase  45.63 
 
 
364 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.116753  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2623  chorismate synthase  45.61 
 
 
366 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2846  chorismate synthase  45.63 
 
 
364 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000803726 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3150  chorismate synthase  45.18 
 
 
373 aa  306  3e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4605  chorismate synthase  45.38 
 
 
366 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0590951  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2667  chorismate synthase  44.13 
 
 
364 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1564  chorismate synthase  46.82 
 
 
328 aa  306  5.0000000000000004e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3619  chorismate synthase  44.32 
 
 
361 aa  305  7e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000281464  normal  0.087707 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2613  chorismate synthase  46.2 
 
 
361 aa  304  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.730292  normal  0.55052 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2737  chorismate synthase  46.2 
 
 
361 aa  304  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2524  chorismate synthase  46.2 
 
 
361 aa  304  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0846  chorismate synthase  44.57 
 
 
371 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.742224 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02755  chorismate synthase  44.29 
 
 
365 aa  305  1.0000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0341392  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1142  chorismate synthase  44.51 
 
 
362 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  0.271094 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0978  chorismate synthase  45.09 
 
 
366 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1460  chorismate synthase  45.09 
 
 
366 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3132  chorismate synthase  43.84 
 
 
357 aa  304  2.0000000000000002e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111802  normal  0.087423 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1789  chorismate synthase  44.7 
 
 
366 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681987  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1212  chorismate synthase  44.79 
 
 
361 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.535517 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1381  chorismate synthase  44.8 
 
 
366 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.674702 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2995  chorismate synthase  45.71 
 
 
365 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.212385 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2573  chorismate synthase  46.2 
 
 
361 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1314  chorismate synthase  44.23 
 
 
361 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2626  chorismate synthase  46.2 
 
 
361 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000317199 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1394  chorismate synthase  44.23 
 
 
362 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187693  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2470  chorismate synthase  44.23 
 
 
361 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1341  chorismate synthase  44.99 
 
 
366 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1018  chorismate synthase  43.53 
 
 
362 aa  303  4.0000000000000003e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2149  chorismate synthase  44.25 
 
 
355 aa  302  6.000000000000001e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0529344  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0770  chorismate synthase  44.13 
 
 
366 aa  302  6.000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.742046  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1525  chorismate synthase  45.63 
 
 
385 aa  302  6.000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0632175 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2580  chorismate synthase  44.44 
 
 
365 aa  301  8.000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.03113 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1296  chorismate synthase  45.09 
 
 
334 aa  301  9e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.576188  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>